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二維二分表現(xiàn)型變量基因關(guān)聯(lián)分析中若干統(tǒng)計(jì)方法研究

發(fā)布時間:2020-05-21 01:47
【摘要】:在基因與疾病的關(guān)聯(lián)分析中,一個較普遍的做法是討論單個疾病與基因的關(guān)系,實(shí)際上由于代表疾病的各種性狀之間具有一些相關(guān)性以及基因本身的基因多效性,使得同時檢驗(yàn)一些性狀的基因關(guān)聯(lián)性變得有意義,并且與考察單個性狀相比具有更好的檢驗(yàn)功效.在這個領(lǐng)域的研究中,不少學(xué)者研究的都是具有相關(guān)關(guān)系的定量性狀或者定量性狀與定性性狀與基因的同時關(guān)聯(lián)分析.本文單單討論二元的二分表現(xiàn)型的基因關(guān)聯(lián)分析,在三種模型下研究多個疾病與基因的關(guān)系.第一種模型是傳統(tǒng)的logistic回歸模型,在考慮單個定性性狀和基因的關(guān)系基礎(chǔ)上,通過聯(lián)立得分函數(shù)構(gòu)造檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量完成多個性狀與單個基因的關(guān)聯(lián)檢測;第二種模型假定存在與定性性狀相關(guān)的潛在的連續(xù)型變量,使得定性變量的取值由連續(xù)型變量決定,通過討論該連續(xù)型變量與基因的關(guān)系來研究定性變量與基因的關(guān)系,由于這些連續(xù)型變量的相關(guān)性使得同時關(guān)聯(lián)檢測比單個關(guān)聯(lián)檢測有意義的多.第三種模型基于條件分布的概念,假設(shè)多個定性性狀的某一個性狀與其余性狀和基因一起具有l(wèi)ogistic線性關(guān)系,這樣多個性狀的概率分布可以方便給出,從而大大簡化模型,提高檢驗(yàn)功效.文章的第一部分介紹基因關(guān)聯(lián)檢測的研究背景和研究意義,并給出已有的參考文獻(xiàn)中關(guān)于基因關(guān)聯(lián)檢測的檢驗(yàn)方法,分別從基因位點(diǎn)和性狀兩個方面出發(fā)介紹;文章的第二部分考察兩個二分變量和單個基因的同時關(guān)聯(lián)分析,提出了三種模型,并在每種模型下都給出檢驗(yàn)方法,理論上證明了這些方法的合理性并給出檢驗(yàn)統(tǒng)計(jì)量;文章的第三部分通過計(jì)算機(jī)模擬分別驗(yàn)證三種檢驗(yàn)方法是否能控制第一類錯誤,并比較在不同的數(shù)值模擬參數(shù)下三種檢驗(yàn)方法的檢驗(yàn)功效,給出三種檢驗(yàn)方法的優(yōu)劣;文章的第四部分對模擬結(jié)果進(jìn)行分析,給出結(jié)論:三種檢驗(yàn)?zāi)P椭袧撛谡龖B(tài)模型的檢驗(yàn)功效最高但可操作性不大,條件線性模型功效次之,但當(dāng)人群中只患某種疾病的概率遠(yuǎn)小于同時患兩種疾病的概率時條件線性模型是最佳的選擇.在解決一般的二維二分表現(xiàn)型變量是否與特定基因相關(guān)時我們可以用logistic回歸模型,當(dāng)兩種疾病有較明顯的相關(guān)性時可以用條件logistic回歸模型進(jìn)行假設(shè)檢驗(yàn).
【圖文】:

第一類錯誤,顯著性水平,下模


圖1:不同顯著性水平下模擬數(shù)據(jù)的第一類錯誤逡逑2三

檢驗(yàn)功效,顯著性水平,可乘,模型


圖2:可乘模型下不同顯著性水平的檢驗(yàn)功效逡逑
【學(xué)位授予單位】:華中師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:Q811.4

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本文編號:2673538

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