發(fā)布時間：2020-05-17 16:09

【摘要】：目的:乳腺浸潤性導(dǎo)管癌(Invasive ductal carcinoma,IDC)是乳腺癌最常見的組織學(xué)類型。我們旨在研究IDC的分子機(jī)制并確定與其預(yù)后相關(guān)的潛在治療靶點(diǎn)。本研究通過分析IDC和癌旁組織芯片數(shù)據(jù)發(fā)現(xiàn)腫瘤組織中LIPE和COL4A1基因表達(dá)與IDC發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。方法:從Gene Expression Omnibus下載芯片數(shù)據(jù)。在R軟件上用limma包篩選差異基因,然后通過DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行Gene Ontology(GO)和pathway富集分析。通過STRING在線數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件對差異性基因進(jìn)行分析,分別得到蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)。同時對基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行節(jié)點(diǎn)度和路徑長度頻率分布分析。此外,檢測了關(guān)鍵基因LIPE在臨床樣本中表達(dá)值情況。用KM Plotter在線數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站對LIPE在乳腺癌患者中表達(dá)值高低進(jìn)行預(yù)后分析。結(jié)果:從IDC和癌旁組織芯片數(shù)據(jù)篩選到了108個差異基因。交叉網(wǎng)絡(luò)分析篩選出關(guān)鍵基因COMP、PPARG、LEP和LIPE基因。生存預(yù)后分析得出LIPE對乳腺癌患者預(yù)后影響具有統(tǒng)計學(xué)差異,LIPE高表達(dá)乳腺癌患者的預(yù)后優(yōu)于低表達(dá)患者。同時,我們還確認(rèn)了LIPE在正常乳腺組織的蛋白和mRNA水平表達(dá)水平均比IDC組織中高。另一組數(shù)據(jù)分析顯示差異表達(dá)顯著的基因總數(shù)是478。功能富集分析證明差異表達(dá)基因中最重要的部分與ECM受體相互作用有關(guān)。這兩組基因在PPI網(wǎng)絡(luò)和miRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中形成對照,我們在研究中篩選出最關(guān)鍵的兩個基因,這可能有助于改善浸潤性導(dǎo)管癌的治療。同時,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,COL4A1基因在IDC的增殖和遷移過程中發(fā)揮重要作用。結(jié)論:LIPE在IDC中的表達(dá)量低于癌旁組織,同時該蛋白的表達(dá)量與IDC患者預(yù)后有關(guān),因此可以被認(rèn)為是一個潛在的乳腺癌診斷生物標(biāo)志物;IDC可能與ECM受體突變有關(guān),篩選出的9個關(guān)鍵的基因可能是IDC治療靶點(diǎn)和預(yù)后指標(biāo)的一個重要組成部分。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明COL4A1是影響IDC增殖和遷移的關(guān)鍵基因。
【圖文】：

23圖 1 IDC 和癌旁組織細(xì)胞樣本的 DEGs 聚類熱圖分析綠色和紅色分別表示下調(diào)和上調(diào)基因，黑色部分是無差異表達(dá)基因1 A microarray analysis of DEGs was performed to compare the IDC and adjacent ti map indicates up-regulation (red), down-regulation (green), and mean gene express

圖 2 IDC 和正常乳腺導(dǎo)管細(xì)胞進(jìn)行的 DEGs 分析藍(lán)色三角形和紅色加號區(qū)域分別表示下調(diào)和上調(diào)基因，黑色圓點(diǎn)部分是無差異表達(dá)基因Figure 2 The DEGs in ductal tumor samples compared with those in normal samplesBlue triangles and red plus signs represented down- and up-regulated genes respectively, black dots wnon-differentially expressed genes
【學(xué)位授予單位】：桂林醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：R737.9

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 陳新龍;夏照帆;韋多;賁道鋒;唐洪泰;葛繩德;;c-Jun氨基末端激酶在燒傷后胰島素抵抗中作用的實(shí)驗(yàn)研究[J];中華外科雜志;2007年01期

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本文編號：2668825