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狐貍毛色基因TYR、CBD103、MITF啟動子活性探究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-14 13:19
【摘要】:酪氨酸酶基因(Tyrosinase,TYR)、β-防御素103基因(Defensin beta 103B,CBD103)及小眼畸形相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子(Microphthalmia-associtated transcription factor,MITF)是調(diào)控動物被毛顏色的主效基因。多彩的毛色不僅對于動物自身趨利避害、相互識別和求偶等方面有重要的作用,同時(shí)對于毛皮產(chǎn)品的生產(chǎn)和加工及其經(jīng)濟(jì)價(jià)值有重要影響。在基因表達(dá)調(diào)控中,啟動子不僅能決定基因轉(zhuǎn)錄起始,還能調(diào)控基因表達(dá)的強(qiáng)弱,但在狐貍的相關(guān)研究中鮮有報(bào)道。因此,本研究利用生物信息學(xué)方法、分子克隆、細(xì)胞瞬時(shí)轉(zhuǎn)染、雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)及點(diǎn)突變技術(shù)對影響北極狐毛色形成的TYR、CBD103和MITF基因啟動子轉(zhuǎn)錄活性進(jìn)行研究。研究結(jié)果為揭示各基因調(diào)控北極狐被毛顏色分子遺傳機(jī)制提供理論依據(jù),同時(shí)對于揭示北極狐被毛顏色的遺傳多樣性有重要意義。本研究利用生物信息學(xué)方法結(jié)合PCR克隆技術(shù)首次獲得北極狐CBD103、MITF-M和TYR基因5′側(cè)翼區(qū)及全部編碼區(qū)序列。擴(kuò)增獲得:CBD103基因2 327bp(5′側(cè)翼區(qū)2 071 bp、CDS區(qū)204 bp、3′側(cè)翼區(qū)52 bp);MITF-M基因3 880bp(5′側(cè)翼區(qū)2 262 bp、CDS區(qū)1 260 bp、3′側(cè)翼區(qū)358 bp);TYR基因4 300bp(5′側(cè)翼區(qū)2 681 bp、CDS區(qū)1 593 bp、3′側(cè)翼區(qū)26 bp)。并構(gòu)建了多個(gè)不同長度的5′缺失啟動子雙熒光素酶報(bào)告基因表達(dá)載體,同時(shí)轉(zhuǎn)染A375和293T細(xì)胞,通過雙熒光素酶檢測體系檢測這3個(gè)基因啟動子活性,確定各基因啟動子的功能序列位置,并對該位置的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)分別進(jìn)行定點(diǎn)突變,探究轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)在該基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的作用。結(jié)果表明:1.CBD103基因缺失片段1 656 bp(-1 604/+51)區(qū)域的活性值最高,該區(qū)域的3個(gè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)Sp1(-1 552/-1 564)、Sp1(-1 439/-1 454)和Sp1(-329/-339)突變后,與野生型相比啟動子活性明顯下降。表明這3個(gè)位點(diǎn)為CBD103基因轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控區(qū)域。2.MITF-M基因缺失片段524 bp(-510/+13)區(qū)域的活性值最高,-222/-510區(qū)域?yàn)镸ITF-M基因的核心啟動子區(qū)域,該區(qū)域的3個(gè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)CREB(-312/-319)、Sp1(-295/-307)和Sp1(-249/-262)突變后,與野生型相比啟動子活性顯著上升。推測:(1)這3個(gè)位點(diǎn)為MITF-M基因的負(fù)調(diào)控區(qū)域;(2)這3個(gè)位點(diǎn)為MITF-M基因的正調(diào)控區(qū)域,但由于該位點(diǎn)發(fā)生DNA甲基化修飾,阻礙CREB和Sp1與其結(jié)合,抑制轉(zhuǎn)錄激活MITF-M基因啟動子的活性。3.TYR基因缺失片段2 066 bp(-2 033/+32)區(qū)域的活性值最高,該區(qū)域的3個(gè)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)Sp1(-1 775/-1 785)、NF-1(-199/-208)和Sp1(-119/-129)突變后,與野生型相比啟動子活性顯著下降。表明這3個(gè)位點(diǎn)為TYR基因轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控區(qū)域。本研究最終確定北極狐CBD103、MITF-M和TYR基因啟動子區(qū)域及相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)在該基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中的作用。
【圖文】:

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蟲熒光素酶載體(pGL3-Basic):序列全長 4 818 bp,含)、多克隆位點(diǎn)和 SV40 poly A 信號等,但不存在真核啟通過在 Luc 基因上游插入目的片段表達(dá)熒光素酶活性,(
【學(xué)位授予單位】:河北科技師范學(xué)院
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:Q953

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2663411

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