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沉默CDC25A基因后肝癌HepG2細(xì)胞差異表達(dá)基因的篩選

發(fā)布時(shí)間:2020-05-11 19:08
【摘要】:目的:構(gòu)建穩(wěn)定沉默細(xì)胞分裂周期蛋白25A(CDC25A)基因的人肝癌HepG2細(xì)胞模型。方法:通過構(gòu)建能夠沉默CDC25A基因表達(dá)的慢病毒RNA干擾載體,感染人肝癌HepG2細(xì)胞,再采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR及Western blot方法驗(yàn)證該基因的沉默效率。結(jié)果:構(gòu)建出穩(wěn)定沉默CDC25A基因的人肝癌細(xì)胞,經(jīng)檢測(cè)其CDC25A基因mRNA及蛋白質(zhì)的表達(dá)水平均呈下調(diào),且CDC25A基因的沉默效率在50%左右。結(jié)論:利用慢病毒載體和RNA干擾技術(shù),可以成功構(gòu)建穩(wěn)定沉默CDC25A基因人肝癌HepG2細(xì)胞株。目的:應(yīng)用基因芯片技術(shù)研究沉默CDC25A基因后Hep G2細(xì)胞的差異基因表達(dá),尋找與CDC25A基因相關(guān)的上下游基因。方法:采用Affymetrix人基因表達(dá)譜芯片,篩選沉默CDC25A基因后Hep G2細(xì)胞的差異表達(dá)基因,進(jìn)一步行IPA(Ingenuity Pathway Analysis)分析。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證芯片結(jié)果中部分細(xì)胞周期相關(guān)差異表達(dá)基因的表達(dá)水平。結(jié)果:通過Affymetrix人基因表達(dá)譜芯片篩選,在沉默CDC25A基因后的人肝癌Hep G2細(xì)胞中,顯著差異表達(dá)基因共有1453個(gè),其中上調(diào)基因有789個(gè),下調(diào)基因有664個(gè);贗PA軟件,對(duì)顯著差異表達(dá)基因進(jìn)行經(jīng)典信號(hào)通路富集,結(jié)果發(fā)現(xiàn)顯著差異表達(dá)基因主要涉及IL-6信號(hào)通路、細(xì)胞周期通路、P53信號(hào)通路、PI3K/AKT信號(hào)通路、Wnt/β-連環(huán)蛋白信號(hào)傳導(dǎo)、c AMP介導(dǎo)的信號(hào)通路、Toll樣受體信號(hào)通路等。其中IL-6信號(hào)通路被顯著抑制,細(xì)胞周期通路亦被抑制。另外,疾病與功能分析顯示Progression of tumor被顯著抑制。q RT-PCR檢測(cè)證實(shí),在沉默CDC25A基因的肝癌Hep G2細(xì)胞中,CCND1、CDKN1A、CDC42、IL6、MAP4K4和CXCL8等細(xì)胞周期通路相關(guān)基因均表現(xiàn)下調(diào),與基因芯片結(jié)果一致。結(jié)論:采用人基因表達(dá)譜芯片,成功篩選出了沉默CDC25A基因后人肝癌Hep G2細(xì)胞中細(xì)胞周期相關(guān)的差異表達(dá)基因,為探究CDC25A基因影響肝癌細(xì)胞生長(zhǎng)提供了線索。
【圖文】:

慢病毒,測(cè)序,序列比對(duì),靶點(diǎn)


圖 1-1 RNAi 慢病毒的構(gòu)建包裝流程圖Figure1-1 The flowchart of RNAinterference lentiviral vector construction and packing其中對(duì)上海吉?jiǎng)P基因公司構(gòu)建的慢病毒載體中的 PCR 陽性克隆進(jìn)行測(cè)序,經(jīng)過測(cè)序序列比對(duì),結(jié)果顯示其與本課題組前期驗(yàn)證所得的干擾靶點(diǎn)一致,如圖 1-2。

慢病毒,靶點(diǎn),測(cè)序,序列比對(duì)


圖 1-1 RNAi 慢病毒的構(gòu)建包裝流程圖Figure1-1 The flowchart of RNAinterference lentiviral vector construction and packing其中對(duì)上海吉?jiǎng)P基因公司構(gòu)建的慢病毒載體中的 PCR 陽性克隆進(jìn)行序,經(jīng)過測(cè)序序列比對(duì),結(jié)果顯示其與本課題組前期驗(yàn)證所得的干擾靶一致,如圖 1-2。
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R735.7

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本文編號(hào):2658925

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