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海洋哺乳動(dòng)物IGHC基因座位的結(jié)構(gòu)與特點(diǎn)及其適應(yīng)性進(jìn)化

發(fā)布時(shí)間:2020-05-11 10:51
【摘要】:海洋哺乳動(dòng)物是哺乳動(dòng)物進(jìn)化史中較為神秘的一大類群,其陸生祖先于不同時(shí)期重返海洋環(huán)境,營(yíng)完全或半水生生活。經(jīng)過長(zhǎng)期的進(jìn)化,海洋哺乳動(dòng)物形成了諸多獨(dú)特的適應(yīng)水生環(huán)境的生理、生態(tài)等性狀,特別是它們的免疫系統(tǒng),在長(zhǎng)期進(jìn)化過程中形成了能夠應(yīng)對(duì)不同于陸生環(huán)境病原微生物的能力。免疫球蛋白(immunoglobulin)是一類介導(dǎo)體液免疫的球蛋白,由2條相同的重鏈和2條相同的輕鏈構(gòu)成。根據(jù)氨基酸組成和排列順序,整個(gè)免疫球蛋白分子可以分為恒定區(qū)和可變區(qū),其中重鏈恒定區(qū)(immunoglobulin heavy chain constant region,IGHC)在免疫過程中起多種效應(yīng)作用,如激活補(bǔ)體,結(jié)合Fc(fragment crystallisable)受體從而介導(dǎo)調(diào)理功能、ADCC(antibody-dependentcell-mediated cytotoxicity)作用和Ⅰ型超敏反應(yīng),在免疫防御中發(fā)揮著不可替代的重要作用。哺乳動(dòng)物普遍具有5種典型的IGHC編碼基因,包括IGHM、IGHD、IGHG、IGHE和IGHA基因。然而,IGHC在海洋哺乳動(dòng)物中的進(jìn)化機(jī)制仍不十分清楚。因此,我們以10個(gè)海洋哺乳動(dòng)物代表性物種(7個(gè)鯨類+2個(gè)鰭足類+1個(gè)海牛目物種)和16個(gè)陸生哺乳動(dòng)物代表性物種為研究對(duì)象,通過基因組掃描或數(shù)據(jù)庫(kù)搜索獲得這些物種的IGHC基因序列,以生物信息學(xué)和比較基因組學(xué)為分析手段,探究了海洋哺乳動(dòng)物IGHC基因座位的結(jié)構(gòu)與特點(diǎn),并且比較分析了不同物種的IGHC所受病原微生物的選擇壓力情況。研究結(jié)果如下:1、海洋哺乳動(dòng)物IGHC具有與其近緣陸生哺乳動(dòng)物相似的基因座結(jié)構(gòu)與特點(diǎn):①海洋哺乳動(dòng)物具有5種典型的IGHC基因,且在結(jié)構(gòu)上以5'-Cμ-Cδ-Cγ-Cε-Cα-3'形式排列在染色體上;②與偶蹄目類似,鯨類IGHM CH1和IGHD CH1序列具有高度的同源性。這些研究結(jié)果表明IGHC基因座的結(jié)構(gòu)在哺乳動(dòng)物中高度保守。2、哺乳動(dòng)物間IGHC基因數(shù)目變異較大,從短尾負(fù)鼠和,

本文編號(hào):2658342

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