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中國水仙花轉(zhuǎn)錄組分析及類黃酮代謝MYB基因功能研究

發(fā)布時間:2020-04-30 06:43
【摘要】:中國水仙(Narcissus tazetta var.chinensis)是我國十大傳統(tǒng)名花,觀賞價值較高。然而水仙花色單調(diào)、品種單一,至今中國水仙品種仍較少。深入研究中國水仙花色形成的分子機制,進行分子改造,將是中國水仙花色創(chuàng)新和新品種培育的有效途徑。本研究以漳州水仙為材料,通過水仙花瓣和副冠轉(zhuǎn)錄組測序分析,篩選出參與調(diào)控類黃酮合成途徑的R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子,進行表達分析及功能驗證,為中國水仙花色形成機理的研究提供理論基礎。本研究主要獲得以下研究成果:1.本試驗以漳州水仙'金盞銀臺'為實驗材料,提取始花期花朵(花瓣和副冠混合)RNA,用IlluminaHiseq 2000進行高通量測序,共獲得 23,081,029 條total clean reads,組裝后共獲得 55,418 條 unigene,其中超過500的unigene有21,750個,長度在1kb以上的unigene有11,053 條,unigene 平均讀長 669bp,N50 讀長 1,049bp。對 Unigene進行功能注釋,包括與 NR、Swiss-Prot、KEGG、COG、KOG、GO和Pfam數(shù)據(jù)庫的比對,共獲得32,414條Unigene的注釋結果,從而構建了水仙花轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫。進行基于Unigene庫的基因結構分析,其中SSR分析共獲得3,276個SSR標記。將花轉(zhuǎn)錄組與之前測序的鱗莖盤轉(zhuǎn)錄組進行分析,共得到7,059個差異表達基因(DEGs),其中3,663個DEGs上調(diào)表達,3,396個DEGs下調(diào)表達,差異表達基因被注釋到126個KEGG代謝通路。2.通過花轉(zhuǎn)錄組與鱗莖盤轉(zhuǎn)錄組差異表達基因分析,獲得2個與類黃酮代謝相關的R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子。初步序列分析表明其中一個與花青素合成抑制有關,命名為NtMYB7;另一個與類黃酮合成激活有關,命名為NtMYB8。3.從漳州水仙中克隆出NtMYB7和NtMYB8編碼區(qū)全長序列,開放閱讀框(ORF)分別為753bp、803bp,分別編碼250和268個氨基酸。NtMYB7和NtMYB8的GenBank登錄號為MF522208和MF522209。蛋白多重序列比對分析發(fā)現(xiàn)NtMYB7、NtMYB8基因都含有R2和R3保守結構域,屬于R2R3-MYB基因;系統(tǒng)進化樹分析結果顯示NtMYB7與花青素合成抑制因子聚為一類,NtMYB8與花青素合成激活因子聚為一類。通過對NtMYB7、NtMYB8在中國水仙不同花期花瓣和副冠以及不同器官的表達,發(fā)現(xiàn)NtMYB7表達量在鱗莖盤中表達量最高,表達量是花苞期花瓣表達量的近20倍;在花瓣中,NtMYB7基因的相對表達量隨著水仙花的開放逐漸升高,盛花期達到最高;在副冠中,始花期表達量最高,花苞期和盛花期表達量較低。NtMYB8在花中的表達量高于鱗莖盤和葉片,花苞期副冠中NtMYB8的表達量是鱗莖盤的近17倍,隨著花的開放,NtMYB8在副冠中的表達量顯著下降。4.構建 pSAK277-NtMYB7 和 pSAK277-NtMYB8 植物表達載體,并轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌,進行煙草瞬時表達實驗。在煙草瞬時表達中,定量PCR分析表明NtMYB7顯著抑制煙草黃酮醇代謝分支FLS基因的表達,同時抑制StMYB激活的花青素和原花青素合成結構基因的表達。研究結果初步判斷NtMYB7是中國水仙類黃酮代謝途徑的抑制因子。單獨注射NtMYB8基因煙草葉片沒有變化,NtMYB8基因與StBHLH混合注射,定量結果顯著上調(diào)FLS、LAR和ANS基因的表達,NtMYB8可能與StBHLH結合促進黃酮醇、原花青素以及花青素的合成。但是NtMYB8在水仙的花中表達量最高,所以推測它在中國水仙中,特別是副冠中可能同時激活黃酮醇、原花青素和花青素的合成,但是由于水仙與煙草不同,在水仙中是否激活黃酮醇代謝途徑,還有待進一步驗證。5.通過NtMYB7基因、NtMYB8基因穩(wěn)定轉(zhuǎn)化煙草,獲得了轉(zhuǎn)基因植株,煙草開花表型分析發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)基因花色顏色變淺,進一步推測NtMYB7基因可能抑制了花青素代謝途徑,導致顏色變淺;NtMYB8基因可能主要促進黃酮醇分支,從而與花青素分支競爭,導致煙草花色變淺,其基因功能需要后續(xù)實驗進一步驗證。
【圖文】:

黃酮醇,生物合成途徑,黃酮


(4)鞋酐(Phlobaphenes)途徑;(5)原花青素(Proanthocynidins)途徑;(6)花逡逑青素(Anthocyanidin)途徑;(7)橙酮(Aurones)途徑[17]。逡逑類黃酮合成途徑如圖1-1,類黃酮色素的前體物質(zhì)是苯丙氨(phenylalanine),逡逑其合成途徑由多種結構基因和調(diào)節(jié)基因控制。首先,類黃酮代謝途徑為由苯丙氨逡逑酸裂解酶(PAO催化苯丙氨酸形成肉桂酸,再經(jīng)肉桂酸徑化酶(C份)和香豆逡逑酞CoA連接酶UCZ)的催化作用形成4-香豆素-CoA,接著在查兒酮合成酶逡逑C/對(Chalcone邋synthase)的作用下生成查兒酮;其中香豆酰CoA來源于苯丙煉逡逑途徑(Phenylpropanoid邋pathway),丙二酰CoA來自乙憸CoA[18];接著,以查爾逡逑酮為底物并在查耳酮異構酶C7//(Chalconeisomerase)的作用下生成黃酮;之后黃逡逑酮在黃酮醇-3-輕化酶(Favono3-hydroxylase邋)和黃酮醇-3’-輕化酶逡逑’//(Flavonol邋3’-hydroxylase)的作用下形成二氫黃酮醇,在二氫黃酮醇4-還原酶逡逑i^P^Dihydroflavonol邋4-reductase邋)和黃酮醇合成酶邋FLS(Flavonol邋synthase)作用下逡逑生二氫黃酮醇分別生成花青素和黃酮醇;原花青素原花青素還原酶逡逑Ui?(Leucoanthocyanidin邋reductase)的催化作用下生成兒茶素,花青素在花青素還逡逑原酶邐Anthocyanidin邋reductase)催化下形成表兒茶素[

不同時期,水仙,轉(zhuǎn)錄組,實驗材料


。分析,我們能在宏觀水平上檢測物種轉(zhuǎn)錄本的結構和表達量。本部分實驗主要以逡逑水仙始花期的花朵為實驗材料,基于Illumina邋HiSeqTM邋2000進行轉(zhuǎn)錄組高通量逡逑測序。前期研究發(fā)現(xiàn),中國水仙花中黃酮類物質(zhì)主要是黃酮醇,淲莖盤中主要黃逡逑酮類物質(zhì)是原花青素%因此本研宄將花轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)與前期獲得的淲莖盤轉(zhuǎn)錄組逡逑數(shù)據(jù)對比分析,,篩選出類黃酮合成途徑參與調(diào)控結構基因的相關轉(zhuǎn)錄因子,逡逑為進一步分析水仙類黃酮代謝途徑的調(diào)控機制和中國水仙花色研究奠定基礎。逡逑1實驗材料逡逑1.1植物材料逡逑以漳州水仙‘金盞銀臺’(白色花瓣和黃色副冠)為實驗材料,水仙的成花過逡逑程分為3個時期,轉(zhuǎn)錄測序以水仙始花期的花朵為實驗材料。取水仙種球,剝?nèi)ュ义献钔鈱喻[片,放入水中培養(yǎng)至開花后,取始花期的花瓣和副冠(去掉花絲、花藥逡逑和花柱)混合后置于離心管中,用液氮速凍,立即放入-80°C冰箱中貯存?zhèn)溆。逡?
【學位授予單位】:福建農(nóng)林大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:Q943.2;S682.21

【參考文獻】

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1 曾黎輝;羅鵬;吳雪琴;;類黃酮合成途徑結構基因的表達分析與中國水仙不能合成花青素原因的初步解析[J];農(nóng)業(yè)科技與信息(現(xiàn)代園林);2015年04期

2 趙佳;劉榮;楊帆;李鑫;劉厚生;嚴倩;肖月華;;月季花青素苷相關R_2R_3-MYB蛋白基因的克隆和表達分析[J];中國農(nóng)業(yè)科學;2015年07期

3 邢文;金曉玲;;調(diào)控植物類黃酮生物合成的MYB轉(zhuǎn)錄因子研究進展[J];分子植物育種;2015年03期

4 楊琳;王宇;楊劍飛;李玉花;;花青素積累相關負調(diào)控因子的研究進展[J];園藝學報;2014年09期

5 周翔;馮瑩;潘東明;;中國水仙遺傳轉(zhuǎn)化研究進展(綜述)[J];亞熱帶植物科學;2013年04期

6 李錫花;吳Z

本文編號:2645497


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