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中間錦雞兒3個DUF基因的生物信息學(xué)分析和CiDUF966-1基因功能分析

發(fā)布時間:2020-04-29 07:18
【摘要】:中間錦雞兒(Caragana intermedia)作為生長于干旱與半干旱荒漠地區(qū)的豆科灌木,具有良好的抗非生物脅迫能力。最近的研究發(fā)現(xiàn),許多中間錦雞兒的基因在逆境脅迫響應(yīng)、生長發(fā)育和新陳代謝調(diào)節(jié)上發(fā)揮著重要的作用。DUF(domain of unkown function)即未知功能結(jié)構(gòu)域,是所有尚未研究清楚功能的結(jié)構(gòu)域的統(tǒng)稱,其中,DUF220、DUF247和DUF966結(jié)構(gòu)域均為植物中特有的DUF結(jié)構(gòu)域。本研究從實驗室前期建立的干旱脅迫的中間錦雞兒轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中篩選出3條含有DUF結(jié)構(gòu)域的編碼基因CiDUF220-1、CiDUF247-1和CiDUF966-1,分別進行了生物信息學(xué)和逆境脅迫下表達量的分析,并對CiDUF966-1基因的功能進行了初步分析,結(jié)果如下:1、通過生物信息學(xué)分析,預(yù)測CiDUF220-1不受非生物脅迫誘導(dǎo),CiDUF247-1和CiDUF966-1受非生物脅迫的誘導(dǎo),qRT-PCR驗證了該結(jié)果。2、CiDUF966-1蛋白定位于細胞膜上。3、CiDUF966-1基因過表達株系相對于野生型和at966-1,蓮座葉直徑變小且整體向下卷曲,葉柄變短,葉片形態(tài)變圓,卷曲嚴重。4、CiDUF966-1基因過表達株系、野生型和at966-1之間抗干旱和抗鹽脅迫的能力沒有明顯的區(qū)別。5、在1/2MS培養(yǎng)基中生長時,CiDUF966-1基因過表達株系相對于野生型和at966-1出現(xiàn)葉片提前衰老、植株提前死亡的現(xiàn)象,經(jīng)過試驗分析,排除了氮元素缺乏和乙烯敏感性不同導(dǎo)致過表達株系早衰現(xiàn)象產(chǎn)生的可能性。
【圖文】:

過程圖,硝酸根,擬南芥,過程


圖 1 擬南芥中硝酸根轉(zhuǎn)運過程[74]Fig.1 Transport process of NO3-in Arabidopsis thaliana[74]物中NH4+的轉(zhuǎn)運主要靠銨根轉(zhuǎn)運蛋白家族AMT來完成,擬南芥中有白,分別是 AMT1 家族的 AMT1;1、AMT1;2、AMT1;3、AMT1;4、T2 家族 AMT2;1。擬南芥根部 NH4+的吸收大致可分為以下兩種途徑外界的 NH4+通過根表皮和根毛細胞膜上的轉(zhuǎn)運蛋白 AMT1;1、;5 的轉(zhuǎn)運后進入根表皮和根毛細胞內(nèi),之后通過共質(zhì)體運輸途徑穿過細胞,進入中柱鞘細胞。第二條途徑是 NH4+通過根表皮細胞間的空部,以皮質(zhì)層細胞細胞膜上 AMT1;2 轉(zhuǎn)運蛋白為中介,通過共質(zhì)體運柱鞘細胞;或者是 NH4+進入皮質(zhì)層細胞以后,通過外質(zhì)體運輸途徑MT1;2 轉(zhuǎn)運蛋白為中介,進入內(nèi)胚層細胞以后,再通過共質(zhì)體運輸?shù)那始毎衃77,78]。

過程圖,銨根,擬南芥,過程


圖 2 擬南芥中銨根轉(zhuǎn)運過程[78]Fig.2 Transport process of NH4+in Arabidopsis thaliana[78] 植物與乙烯乙烯是最簡單的不飽和碳氫化合物,,1992 年 Abeles 等將乙烯定義為植。黑暗環(huán)境中生長的植物幼苗,在乙烯的處理下,會表現(xiàn)出下胚軸變短、根伸長受到抑制,頂端彎弓曲度增大的“三重反應(yīng)”現(xiàn)象[81]。乙烯作為一種長激素,根據(jù)其含量、作用時間及作用物種的不同,對植物的生長或者衰或者促進作用。幼苗根的生長、胚軸的伸長、植物葉片、花、果實的發(fā)育乙烯的調(diào)節(jié)[82,83]。此外,乙烯還與生長素、赤霉素、細胞分裂素和脫落酸用,共同調(diào)節(jié)植物各個時期的生命活動[83]。乙烯的生物合成可以分為三步:甲硫氨酸在 SAMS(S-AdoMet synthetase催化為 SAM(S-AdoMet);之后 SAM 又在 ACS(l-aminocyclopropane-l-ca synthetase)的作用下轉(zhuǎn)化為了 ACC;最終 ACC 被 ACCO(ACC oxidas為了乙烯、H2O、和氫氰酸[84]。
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:Q943.2;S793.3

【參考文獻】

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本文編號:2644356

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