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非洲野生稻粒長和落粒性基因GL4的克隆與功能分析

發(fā)布時間:2020-04-23 17:03
【摘要】:隨著全球的人口增長,解決世界糧食安全問題,是擺在農業(yè)科學家眼前的重要課題。種子大小是由粒長、粒寬、粒厚和谷粒充實度等因素共同決定的,也是水稻產量決定因素中遺傳率最高的。非洲野生稻(O.barthii)是非洲栽培稻(O.glaberrima)的野生祖先種,其籽粒較大,是改良非洲栽培稻和亞洲栽培稻(O.sativa)的重要種質資源。發(fā)掘非洲野生稻控制粒重的基因能對提高非洲稻和亞洲栽培稻的產量具有重要意義。本研究從以非洲野生稻W1411為供體,非洲栽培稻IRGC102305為受體的滲入系中鑒定了一個籽粒變大的滲入系GIL25,在4號染色體長臂定位到一個控制粒長的QTL,將其命名為GL4(GrainLength4),并對GL4進行了圖位克隆和功能分析,主要研究結果如下:1.與IRGC102305相比,滲入系GIL25籽粒粒長增加13.6%,千粒重增加16.8%,單株產量增加14.3%。組織細胞觀察結果表明粒長增加是由穎殼的縱向細胞變長所致,而且GIL25表現(xiàn)出易落粒性。利用GIL25和IRGC102305雜交構建分離群體,將控制粒長的基因(Grain Lngth 4,GL4)定位到第4染色體長臂末端5.9 kb區(qū)間上。非洲栽培稻基因組該定位區(qū)間只有一個預測基因:ORGLA04G0254300。利用來自GIL25的等位基因構建互補載體,并轉化到親本IRGC102305,獲得12株陽性單株,轉基因植株籽粒顯著增長,該研究結果表明ORGLA04G0254300就是控制粒長的GL4基因。2.GIL25與IRGC102305的GL4基因序列在編碼區(qū)有4個SNP和一個6 bp的插入缺失。利用16份非洲野生稻和67份非洲栽培稻對這5個變異進行單倍型分析發(fā)現(xiàn),SNP2與粒長的相關性最高。進一步構建SNP2的定點突變載體并轉化IRGC102305,結果發(fā)現(xiàn)15個轉基因株系的籽粒都顯著增加,證明SNP2是引起非洲栽培稻IRGC102305籽粒變小的關鍵變異位點。3.對93份非洲栽培稻和94份非洲野生稻重測序數(shù)據(jù)進行分析,根據(jù)SNP2位點或GL4上下游5 kb區(qū)間主成分分析都可以將非洲栽培稻分為兩類,其中SNP2為T的非洲栽培稻廣泛分布于西非,且在馴化過程中受到了強烈的選擇。4.比較亞洲栽培稻和非洲栽培稻基因組序列發(fā)現(xiàn),GL4基因與亞洲栽培稻的落;騍H4等位,在以特青為背景的近等基因系NIL-GL4or,NIL-GI4os和NIL-GIAog中發(fā)現(xiàn),與OrGL4相比,OgGL4能夠使栽培稻落粒性降低的同時減小籽粒長度;OsGL4能夠降低栽培稻的落粒性,但是并不影響籽粒大小,說明OsGL4為更有利的等位變異。綜上所述,在非洲栽培稻馴化過程中,選擇GL4基因的一個SNP變異造成非洲栽培稻籽粒變小和落粒性喪失。GL4基因的克隆不僅為非洲栽培稻起源與馴化研究提供了直接的分子證據(jù),同時揭示了非洲栽培稻馴化過程中籽粒變小的分子遺傳基礎,為進一步改良非洲栽培稻和亞洲栽培稻產量提供了理論參考。
【圖文】:

相互作用,粒形,植物生長,籽粒


圖2-1粒形基因的作用途徑以及相互作用引自Zuoetal.邋2014逡逑植物生長代謝是一個復雜的過程,各種影響因素相互作用最終形成籽粒。目要途徑,蛋白酶體的降解,植物激素和G蛋白途徑之間可能存在相互作用。一個己知的大;虻木酒贩NN4】l的千粒重達到了驚人的70克,這五個基因包括逡逑

遺傳組成,離層,比例尺,親本


為了進一步研究觀察導致籽粒大小和落粒性表型變化的細胞結構差異,對穎殼表面細胞和離逡逑層進行了掃描電鏡觀察和徒手切片觀察。取開花后35天的成熟籽粒穎殼,經過掃描電鏡試驗觀逡逑察發(fā)現(xiàn),與IRGC102305相比,GIL25的穎殼內外表面細胞長度增加(圖3-3a-e),在體式顯微鏡下逡逑觀察發(fā)現(xiàn),IRGC102305外穎縱軸的細胞數(shù)目與GIL25無顯著差異(圖3-3f)。這些結果表明GIL25逡逑的籽粒變長是由于穎殼細胞增長所導致的,與細胞分裂無關。取開花當天的稻穗,徒手縱切籽粒逡逑與枝梗連接處,既離層所在部位,,經吖啶橙染色,在激光共聚焦顯微鏡下觀察到,GIL25的離層逡逑是連續(xù)完整的,而IRGC102305在維管束處并不形成離層細胞,整個離層處于不完整狀態(tài)(圖3-3g,逡逑h)。在籽粒成熟時,取籽粒與枝梗連接處的斷面,經過掃描電鏡觀察到,GIL25的離層斷面光滑,逡逑而IRGC102305的斷面在外圈光滑,內圈則是凹凸不平的。離層細胞在籽粒成熟時會自動分離,逡逑而其他細胞則不會(圖3-3i,邋j)。這種凹凸不平的表明正是由于離層細胞缺失,當發(fā)生外力作用逡逑時
【學位授予單位】:中國農業(yè)大學
【學位級別】:博士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S511.9

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本文編號:2637951

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