應(yīng)激反應(yīng)基因遺傳變異與兒童注意缺陷多動障礙的關(guān)聯(lián)研究
【圖文】:
圖 1 瓊脂糖電泳檢測部分 DNA 樣本結(jié)果1.3.2 候選基因遺傳變異位點篩選單核苷酸多態(tài)性(SNP)由單個核苷酸變異引起的 DNA 序列多態(tài)性,,單個堿基的改變在人群中的發(fā)生頻率(等位基因頻率)在 0%到 50%之間[86]。SNP 是人類可遺傳變異中最常見的一種,占所有已知多態(tài)性的 90%以上。目前已發(fā)現(xiàn)人類基因組 SNP 總數(shù)有達 400 萬各,平均每 1000 個堿基中就有 1 個[87]。部分 SNP會直接影響到蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)或基因表達水平,從而參與疾病遺傳機制。本研究中綜合 考 慮 以 下 信 息 進 行 SNP 位 點 的 篩 選 : 在 HapMap 數(shù) 據(jù) 庫(http://hapmap.ncbi.nlm.nih.gov/cgi-perl/gbrowse/hapmap28_B36/)中公布的中國漢族人群(CHB)數(shù)據(jù)中獲取 NR3C1 和 SLC6A4 兩個基因全部 SNP 位點,然后通過 SNP-info 數(shù)據(jù)庫(https://snpinfo.niehs.nih.gov/snpinfo/snptag.html)篩選出標簽 SNP(tagSNP)和有功能注釋的潛在功能 SNP,過濾條件選擇 MAF 0.1,r2 0.8的 CHB 人群,結(jié)合 F-SNP 數(shù)據(jù)庫[88](http://compbio.cs.queensu.ca/F-SNP/)中各
圖 2 F-SNP 功能預測流程圖表 1 候選 SNP 功能注釋整合分析基因 SNP TagSNP SNPfunc F 得分 Regulome DBNR3C1 rs41423247 N -- 0.176 5rs10052957 N -- 0.268 5rs6191 N miRNA(miRanda) 0.217 --SLC6A4 rs3813034 N -- 0.204 6rs12449783 Y -- 0.176 4rs25531 N TFBS 0.217 5rs2020939 Y -- 0.000 1f表 2 候選基因 SNP 位點基本信息
【學位授予單位】:華中科技大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R749.94
【參考文獻】
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本文編號:2628716
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