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玉米耐深播QTL精細定位和旱敏感突變體swl3的基因定位

發(fā)布時間:2020-04-07 01:41
【摘要】:干旱是影響玉米(Zea mays L.)產(chǎn)量最主要的環(huán)境因素之一,耐深播玉米品種能夠吸收土壤深層水分,具有較強的耐旱性。研究作物耐深播性狀的遺傳機理具有重要的育種價值。實驗室的前期工作通過玉米自交系X178和3681-4構(gòu)建的F_(2:3)家系,在玉米10號染色體長臂上定位到了一個耐深播相關(guān)的主效QTL qMES20-10,并以X178為輪回親本構(gòu)建了BC_3F_(3:4)家系。本研究首先通過鑒定100份BC_3F_(3:4)家系的表型和基因型,對qMES20-10進行了驗證。在此基礎(chǔ)上結(jié)合分子標記輔助選擇,構(gòu)建了高代回交群體和多代自交群體,將qMES20-10定位于10號染色體133.3-136.0 Mb的區(qū)間之內(nèi)。同時,從BC_3F_(3:4)家系中篩選出兩個近等基因系,進行了差異表達基因分析,基因富集(Gene Ontology,GO)分析發(fā)現(xiàn)差異表達基因主要參與了化學刺激的應激反應、氧化還原反應和對氧化脅迫的應激反應。本研究對玉米耐深播性狀遺傳位點的精細定位和受深播誘導的相關(guān)基因的挖掘為耐深播玉米的選育提供了材料基礎(chǔ)和分子生物學信息。葉片是植物的光合器官,葉片形態(tài)是理想株型的重要因素之一。本實驗以繁種中發(fā)現(xiàn)的一個旱敏感突變體swl3(sensitive to water loss)為材料,該突變體在田間表現(xiàn)出葉片向近軸端卷曲、顏色發(fā)白、葉表面變光滑、質(zhì)地變軟等特征。通過測定swl3突變體和B73的光合生理指標,發(fā)現(xiàn)swl3光能轉(zhuǎn)換效率和相對葉綠素含量均顯著低于B73,葉片溫度高于B73,說明SWL3基因可能影響了光合作用和蒸騰作用。用swl3分別與B73和Mo17構(gòu)建了兩個F_2群體,用BSR-Seq(Bulked Segregant RNA-Seq)的方法將SWL3基因初步定位在6號染色體107-130 Mb的區(qū)間。然后用圖位克隆的方法,結(jié)合兩個群體的定位結(jié)果,將SWL3基因定位到兩個InDel標記swl3InD13和swl3InD19之間,兩個標記在B73參考基因組上(v3版本)的距離為183 Kb,定位區(qū)間內(nèi)共6個候選基因。本研究為swl3突變體基因的克隆提供了參考依據(jù)和材料基礎(chǔ)。
【圖文】:

葉片發(fā)育,階段


2010; Bar and Ori, 2014)。葉片的形態(tài)建成起始于頂端分生組織的兩側(cè),包括幾個對稱軸的形成,也就是葉片極性的建立,包括基-頂軸(proximo-distal),近-遠軸(adaxial-abaxial)和中-側(cè)軸(medio-lateral)(圖1.1)。之后是葉片原基向外擴展,構(gòu)成最初的葉片形態(tài)。最后,葉原基繼續(xù)生長并伴隨進一步的細胞分化,形成最終的葉片結(jié)構(gòu)。在這個過程中,葉片的上下表皮,葉脈,葉邊緣和一些特殊的表皮細胞如毛狀體和氣孔也分化形成。成熟的葉片結(jié)構(gòu)從上到下通常包括表皮細胞、柵欄組織和海綿組織。其中,柵欄組織細胞排列整齊致密,葉綠體分布其中,進行光合作用;海綿組織細胞排列松散,氣孔分布其中,進行呼吸和蒸騰作用。禾本科的葉片上表皮中有很多泡狀細胞(bulliform cell),泡狀細胞內(nèi)膨壓的改變會造成葉片卷曲程度的不同(王元軍,2005)。圖1.1 葉片發(fā)育階段 (引自Maya and Naomi, 2014)Fig.1.1 The stages of leaf development (Maya and Naomi, 2014)植物葉片的形態(tài)、大小、數(shù)目等在自然界中存在廣泛的變異,同一植物不同生長時期葉片的形態(tài)也不相同。這種形態(tài)學上多樣性的重要原因之一是葉片上(近軸端)下(遠軸端)表面極性的形成。通過對相關(guān)突變體的研究,目前關(guān)于葉片近遠端極性建立的機制已經(jīng)比較清楚。最早關(guān)于近-遠軸極性的遺傳分析是在金魚草(Antirrhinum majus)的突變體phantastica(phan)中

QTL定位方法,圖位克隆


3)開始同時進行基因型和表型的鑒定工作,不斷篩選新的重組體,逐步縮小QTL的定位區(qū)間,最終實現(xiàn)QTL的克隆(圖1.2)。這種方法主要的優(yōu)點是來自同一重組體的后代可以在同一環(huán)境條件下鑒定表型,有效減少了環(huán)境因素對表型鑒定的影響,并且在群體較大的情況下可以獲得足夠數(shù)量的重組體后代進行重復試驗,保證表型鑒定的準確性。圖1.2 連續(xù)的QTL定位方法 (引自Yang et al., 2012)Fig.1.2 The sequential QTL fine-mapping procedure (Yang et al., 2012)1.3.2 圖位克隆研究概述圖位克。∕ap-based cloning)最早在1986年首次提出(Coulson et al., 1986),主要原理是根據(jù)目的基因在染色體上的相對位置,用與目的基因連鎖的分子標記將目的基因定位在一定的區(qū)間,再通過染色體步移等方法構(gòu)建包含目的基因的克隆片段,,最終克隆目的基因,并通過轉(zhuǎn)基因互補等實驗進行功能驗證。圖位克隆一般包括以下步驟:構(gòu)建群體、標記篩選、基因初定位和精細定位、候選基因分析及功能驗證等。與QTL定位的過程一樣,圖位克隆的第一步是構(gòu)建分離群體,最常用的是容易獲得的F2和BC1F1群體。在保證野生型和突變體表型能清晰辨別的基礎(chǔ)上,通常選擇已測序完成的自交系構(gòu)建分離群體
【學位授予單位】:中國農(nóng)業(yè)科學院
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:S513

【參考文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 彭云玲;楊芳林;趙小強;任續(xù)偉;;不同玉米自交系耐深播能力的差異分析[J];干旱地區(qū)農(nóng)業(yè)研究;2014年01期

2 向晶;鐘甫寧;;人口結(jié)構(gòu)變動對未來糧食需求的影響:2010-2050[J];中國人口.資源與環(huán)境;2013年06期

3 呂洪坤;鄭軍;;圖位克隆技術(shù)在玉米基因分離中的應用[J];分子植物育種;2013年03期

4 牛元;陳雅平;吳國江;;葉卷曲突變體的研究進展[J];安徽農(nóng)業(yè)科學;2010年07期

5 羅冉;吳委林;張e

本文編號:2617280


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