【摘要】：柑橘黃龍病是柑橘生產(chǎn)中的嚴(yán)重災(zāi)害,被稱為柑橘“癌癥”,對全球柑橘產(chǎn)業(yè)造成了巨大的破壞。利用基因的差異表達(dá)信息,可以精確地洞察生物學(xué)過程和功能紊亂,并發(fā)現(xiàn)相關(guān)的致病基因,明確黃龍病菌對柑橘基因表達(dá)的關(guān)鍵影響。研究把一種新型的非參數(shù)統(tǒng)計(jì)方法最大信息系數(shù)引入到柑橘黃龍病差異表達(dá)基因識別,并與常用的Rank Products和Wilcoxon符號秩檢驗(yàn)兩種方法對比分析,討論了最大信息系數(shù)在柑橘黃龍病差異表達(dá)基因識別中的可行性及有效性�；诟涕冱S龍病基因表達(dá)數(shù)據(jù)集GSE33459的研究表明,最大信息系數(shù)方法識別的差異表達(dá)基因不僅與對照方法有相同之處,而且該方法在5-9wai數(shù)據(jù)中還找到了較Wilcoxon符號秩檢驗(yàn)法多8437個新基因,較Rank Products法多8892個;在13-17wai數(shù)據(jù)中較Wilcoxon符號秩檢驗(yàn)法多10189個,較Rank Products法多11611個。雖然三種方法得到的差異表達(dá)基因數(shù)有明顯不同,但最大信息系數(shù)與其它兩種方法的富集分析結(jié)果占比基本相同,從而說明最大信息系數(shù)在識別差異表達(dá)基因上沒有偏倚。另外,基于柑橘黃龍病基因表達(dá)數(shù)據(jù)集GSE29633的進(jìn)一步實(shí)驗(yàn),也驗(yàn)證了上述結(jié)果。研究表明,最大信息系數(shù)用于柑橘黃龍病差異表達(dá)基因的識別是可行且有效的。
【學(xué)位授予單位】：贛南師范大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2018
【分類號】：S436.66

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號：2616310