【摘要】：柑橘黃龍病是柑橘生產(chǎn)中的嚴重災害,被稱為柑橘“癌癥”,對全球柑橘產(chǎn)業(yè)造成了巨大的破壞。利用基因的差異表達信息,可以精確地洞察生物學過程和功能紊亂,并發(fā)現(xiàn)相關(guān)的致病基因,明確黃龍病菌對柑橘基因表達的關(guān)鍵影響。研究把一種新型的非參數(shù)統(tǒng)計方法最大信息系數(shù)引入到柑橘黃龍病差異表達基因識別,并與常用的Rank Products和Wilcoxon符號秩檢驗兩種方法對比分析,討論了最大信息系數(shù)在柑橘黃龍病差異表達基因識別中的可行性及有效性�；诟涕冱S龍病基因表達數(shù)據(jù)集GSE33459的研究表明,最大信息系數(shù)方法識別的差異表達基因不僅與對照方法有相同之處,而且該方法在5-9wai數(shù)據(jù)中還找到了較Wilcoxon符號秩檢驗法多8437個新基因,較Rank Products法多8892個;在13-17wai數(shù)據(jù)中較Wilcoxon符號秩檢驗法多10189個,較Rank Products法多11611個。雖然三種方法得到的差異表達基因數(shù)有明顯不同,但最大信息系數(shù)與其它兩種方法的富集分析結(jié)果占比基本相同,從而說明最大信息系數(shù)在識別差異表達基因上沒有偏倚。另外,基于柑橘黃龍病基因表達數(shù)據(jù)集GSE29633的進一步實驗,也驗證了上述結(jié)果。研究表明,最大信息系數(shù)用于柑橘黃龍病差異表達基因的識別是可行且有效的。
【學位授予單位】：贛南師范大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2018
【分類號】：S436.66

【參考文獻】

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1 程春振;曾繼吾;鐘云;閆化學;姜波;鐘廣炎;;柑橘黃龍病研究進展[J];園藝學報;2013年09期

2 張凌云;陽佳位;王淼;鐘廣炎;;DNA微陣列技術(shù)在柑橘研究中的應用[J];果樹學報;2010年01期

3 莫元妹;;柑橘黃龍病的傳播途徑及鑒定方法[J];現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科學;2009年05期

4 ;ARS科學家對柑橘黃龍病致病細菌進行測序[J];分子植物育種;2009年02期

5 鄒敏,周常勇;柑桔黃龍病病原和檢測方法研究進展[J];植物保護;2005年03期

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1 邵福波;最大信息系數(shù)改進算法及其在鐵路事故分析中的應用[D];北京交通大學;2016年

2 劉漢明;基于最大信息系數(shù)的復雜疾病全基因組關(guān)聯(lián)算法研究[D];電子科技大學;2015年

3 傅仕敏;柑橘黃龍病的細胞病理及其寄主轉(zhuǎn)錄組學研究[D];西南大學;2014年

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2 趙培婭;贛州地區(qū)柑橘黃龍病遺傳多樣性分析及其樹體分布特征研究[D];贛南師范大學;2016年

3 李翌菡;柑橘木虱內(nèi)共生菌檢測與取食時間對其獲毒效率的影響[D];華南農(nóng)業(yè)大學;2016年

4 霍斐爾;黃龍病菌對寄主植物淀粉代謝相關(guān)酶的影響及檢測技術(shù)研究[D];華南農(nóng)業(yè)大學;2016年

5 陳凱男;柑橘黃龍病病原檢測方法的研究[D];內(nèi)蒙古師范大學;2016年

6 鄧蕾;感染柑橘黃龍病植株生理指標分析及黃龍病代謝相關(guān)酶（FabG）蛋白表達[D];華中農(nóng)業(yè)大學;2014年

7 吳越;柑橘黃龍病菌侵染對甜橙葉片糖代謝的影響研究[D];西南大學;2014年

8 王賢達;柑橘黃龍病可視化LAMP檢測體系的建立及其室內(nèi)防治藥劑篩選[D];福建農(nóng)林大學;2014年

9 李運明;基于SAM的基因表達譜數(shù)據(jù)分析方法研究及應用[D];第四軍醫(yī)大學;2008年

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本文編號：2616310