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斑馬魚早期心臟發(fā)育基因的功能研究及發(fā)育關(guān)鍵時(shí)間點(diǎn)轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2020-04-06 07:55
【摘要】:心臟是脊椎動物中最早形成并行使功能的器官之一。在其發(fā)育過程中,心管經(jīng)過復(fù)雜的環(huán)化過程,形成心房和心室間隔即(atriovent ricular canal,AVC),進(jìn)而形成心臟的腔室結(jié)構(gòu),發(fā)育成有功能的心臟。AVC形成過程受到多種信號通路調(diào)控。心臟瓣膜(Cardiac valv es)的發(fā)育過程是高度有序且精細(xì)的,以便確保血液流向腔室和血管。TBX家族中,Tbx2,Tbx5和Tbx20是房室間隔形成的關(guān)鍵基因。之前的報(bào)道表明Tbx2抑制腔室的分化和增殖,從而使腔室之間有序收縮。Tbx5的突變,會導(dǎo)致人類常染色體顯性遺傳病心手綜合征(Holt-Oram syndrome,HOS)。小鼠Tbx20突變體中早期心管的發(fā)育基本正常,但是后續(xù)的心臟環(huán)化過程異常。斑馬魚體外受精,并且早期胚胎發(fā)育透明便于觀察,是研究心臟早期發(fā)育和先天性心臟病致病機(jī)理的理想模式動物。本研究利用CRI SPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)成功獲得斑馬魚tbx2b,tbx5a和tbx20基因的突變魚系,T7E1檢測3種魚系F0突變效率分別約為57.5%、38.0%、42.1%。測序分析F1中突變類型,tbx2b F1獲得-11 bp和-20 bp的突變攜帶者,tbx5a F1獲得-10 bp和+10 bp的突變攜帶者。tbx20F1獲得-8 bp的突變攜帶者。在tbx20 F2突變體中觀察到心臟突變表型:48 hpf,tbx20突變體可見心臟結(jié)構(gòu)拉伸變形,環(huán)化異常,心包腔腫大;3 dpf,突變表型逐漸加深,心臟拉伸成細(xì)線狀。熒光定量PCR結(jié)果顯示tbx20突變體中l(wèi)ef1,nppa和has2的表達(dá)下調(diào)。此外,本論文利用肌球蛋白輕鏈7綠色熒光標(biāo)記的轉(zhuǎn)基因魚系成功分離出24 hpf、30 hpf、36 hpf、48 hpf 4個(gè)不同發(fā)育時(shí)期的斑馬魚心臟,并進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析。我們初步發(fā)現(xiàn)有488個(gè)轉(zhuǎn)錄因子在心臟早期表達(dá)呈明顯差異,其中包括:T-box家族、GATA家族、Nkx家族和bHLH家族中多個(gè)基因。在信號通路方面的分析,KEGG結(jié)果顯示了差異基因主要富集一些信號通路,如Notch、Wnt、TGF-beta等。本研究成功制備斑馬魚tbx2b、tbx5a和tbx20突變體魚系,并發(fā)現(xiàn)tbx20基因突變會影響心臟環(huán)化及AVC的發(fā)育,為深入探究tbx2b,tbx5a和tbx20基因在早期心臟發(fā)育的功能奠定基礎(chǔ)。本論文比較系統(tǒng)的分析出4個(gè)關(guān)鍵心臟發(fā)育階段的差異表達(dá)基因,為研究早期心臟發(fā)育階段的調(diào)控關(guān)系奠定基礎(chǔ)。
【學(xué)位授予單位】:上海海洋大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號】:Q954.4

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本文編號:2616238

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