【摘要】：目的克隆太子參Pseudostellariae Radix赤霉素2-氧化酶(gibberellin2-oxidase,GA2ox)基因,并進(jìn)行生物信息學(xué)和表達(dá)分析。方法通過對(duì)太子參轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)的分析,得到2個(gè)太子參GA2ox基因PhGA2ox1和PhGA2ox8。。采用反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)和特異PCR技術(shù)獲得2個(gè)基因的蛋白編碼區(qū)(coding sequence,CDS),并對(duì)其編碼的蛋白進(jìn)行生物信息學(xué)分析。采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)檢測(cè)基因的表達(dá)模式。結(jié)果生物信息學(xué)分析表明,PhGA2ox1和PhGA2ox8的CDS區(qū)分別長(zhǎng)981和1 056 bp,編碼326和351個(gè)氨基酸殘基,蛋白相對(duì)分子質(zhì)量分別為36 871.3和40 169.9,理論等電點(diǎn)為8.66和6.91,具有GA2ox的保守結(jié)構(gòu)域DIOX_N和20G-Fell_Oxy,但均無(wú)明顯疏水區(qū),無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)域,無(wú)信號(hào)肽,為穩(wěn)定蛋白。序列系統(tǒng)進(jìn)化分析顯示植物GA2ox蛋白可被分為3個(gè)亞類,PhGA2ox1和PhGA2ox8分別歸入Class I和Class III亞類。qPCR分析顯示,PhGA2ox1在不同組織器官中的表達(dá)基本恒定,而PhGA2ox8在塊根木質(zhì)部的表達(dá)量卻顯著高于在其他組織器官中的表達(dá)量(P0.05)。結(jié)論首次獲得PhGA2ox1和PhGA2ox8基因的編碼區(qū)序列,為進(jìn)一步分析2個(gè)基因在太子參生長(zhǎng)發(fā)育過程中的作用奠定了基礎(chǔ)。

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前7條

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【共引文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2586634