【摘要】：水稻(Oryza sativa L.)資源遺傳多樣性越來越受到人們的重視。對水稻稻種遺傳資源的研究可以幫助我們了解其遺傳背景,挖掘遺傳信息,對水稻育種和水稻資源保護(hù)研究有著非常重要的意義。糊化溫度是稻米蒸煮品質(zhì)的重要指標(biāo)之一,ALK是控制糊化溫度的主效基因。本研究選取了來自云南哈尼梯田和世界各地的546份水稻資源做研究對象,所選材料包括野生稻和栽培稻種。對其ALK進(jìn)行測序分析其遺傳多樣性,并測定其主要的相關(guān)品質(zhì)性狀,分析基因變異類型與品質(zhì)的關(guān)系。主要獲得如下結(jié)果:從品質(zhì)分析來看,總體上各品質(zhì)特征值分布廣泛。國際稻材料來源地分布廣泛,總體品質(zhì)分布較材料背景單一的云南稻材料豐富。尤其是在糊化溫度方面,在基因和環(huán)境共同作用下,出現(xiàn)極高極低值,且相比于云南稻,差異比較大。在不同亞群中,秈稻糊化溫度要高于粳稻,秋稻和芳香稻糊化溫度較高,偏向于秈稻類;秈稻、粳稻和混合稻群的表觀直鏈淀粉含量分布范圍廣泛,秋稻AAC含量覆蓋中等和高等含量,芳香稻主要以中等含量為主。由RVA數(shù)據(jù)可知,秈稻稻米的低溫粘度較高于粳稻。云南哈尼梯田當(dāng)前栽培水稻可分為偏粳(group Ⅰ)及偏秈(group Ⅱ)兩大類群,其中以偏秈類群居多,占83%。絕大多數(shù)偏秈類品種的ALK含有G-GC組合,因此都傾向于高糊化溫度。供試栽培水稻稻米糊化溫度的變異主要是與第8外顯子中3個SNP(4211 G/A、4342 G/T和4343 C/T)有關(guān),其中A-GC和G-TT兩種組合主要控制低和中低檔糊化溫度,G-GC組合主要控制高和中高檔糊化溫度。云南稻是傳統(tǒng)栽培稻種,其基因序列多態(tài)性較低。野生稻為未經(jīng)選擇馴化的稻種,其ALK序列變異豐富,單倍型多態(tài)性較國際稻和云南稻高�？傮w分析ALK核酸多態(tài)性較高,單倍型豐富,等位基因型有3種。在國際稻中,三種等位基因在不同亞群間分布各有差異。初步推斷A-GC和G-TT類型是由G-GC類型在進(jìn)化過程分化而來,即由秈型到粳型的分化規(guī)律。本文還解釋了ALZ、Wx的12種組合類型及相對應(yīng)的品質(zhì)表現(xiàn)狀況,兩個基因可能存在一定的連鎖關(guān)系。
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云南稻（丨１１）邐９２邐１９逡逑常規(guī)稻（７９）７９逡逑國際稻（２３８）邐４５邐４５邐５１邐１０邐３７邐３６邐１４逡逑野生稻（１１８）１１８逡逑２．２水稻種植與取樣逡逑Ｎ４編號系列水稻于２０１３年１１月播種于海南省陵水縣揚州大學(xué)南繁基地，于２０１４年逡逑４月收獲成熟種子。ＹＮ、ＺＮ、Ｎ０和ＬＰ編號系列水稻與２０１４年１１月播種于揚州大學(xué)海逡逑南省陵水縣南繁基地，２０１５年４月收獲成熟種子。Ｇ編號系列水稻于２０１４年５－１０月種植逡逑在中科院上海植生所試驗基地，２０１５年１０月收獲成熟種子。每個編號品種種植２行，每逡逑行１０株。在水稻苗期或取適量種子萌發(fā)幼苗后取葉片用于總ＤＮＡ提取。Ａ、ＢＬＷ、ＤＸＷ、逡逑ＦＧＷ、ＧＺＷ、ＨＬＷ、ＱＨＷ、ＳＷ、ＳＸＷ、ＺＣＷ編號的野生稻葉片于２０１５年４月在廣東逡逑采集。收種方法為隨機選�。持暌陨匣焓毡４妗ｅ义希玻吃囼灱夹g(shù)路線逡逑

子ＡＴＧ到終止密碼子ＴＧＡ共４４２２邋ｂｐ的序列。利用引物設(shè)計軟件ｐｒｉｍｅｒ邋５．０設(shè)計４對引物逡逑擴增目的基因，分別為＾：－ａｌ／ＸＩＸ－ａ２、、ｙ￡ＬＫ－ｃｌ／ｌ／：ｉ：－ｃ２邋和逡逑尺－ｄ２（圖３、表２），把目的基因分為ａ、ｂ、ｃ、ｄ共４段進(jìn)行分段擴增，其長度分逡逑別為１．５邋ｋｂ、１．２邋ｋｂ、１．５邋ｋｂ和１．６邋ｋｂ。如圖３。通過４個測序片段的序列重疊拼接，獲得逡逑NB全序列，共４．５ｋｂ邋（Ｅｘｏｎｌ－Ｅｘｏｎ８，包括７個內(nèi)含子）。４個擴增片段引物序列信息如逡逑表１。２０叫ＰＣＲ擴X椞逑蛋韻倫槌桑海叮板澹穡殄澹洌洌齲玻啊ⅲ保埃敖校玻校潁椋恚澹櫻裕粒義澹牽緬澹猓酰媯媯澹蟈澹ê義希停紓玻�、１．６邋０邋ｄＮＴ＠C澹停椋簦酰潁邋澹ǎ保板澹恚停ⅲ埃插澹皰澹穡潁椋恚澹櫻裕粒遙藻迕福ǎ玻靛澹擼�、０．６邋…ＦｅP潁鰨幔潁溴義希校潁椋恚澹蟈澹ǎ保板澹睿停�、０．６邋７w殄澹遙澹觶澹潁螅邋澹校潁椋恚澹蟈澹ǎ保板澹穡停⒁約板澹卞澹穡殄澹模危鈴澹ǎ保埃板澹睿紓椋歟�。ＰＣＡx宸從Τ絳蟈義先縵攏海梗，

本文編號：2579000