鹽芥RAV基因家族在擬南芥中的過量表達(dá)及功能驗(yàn)證
【圖文】:
例如,在擬南芥及大豆中,TEM1 和 GmRAV 分別通過結(jié)合和抑制 FT基因的啟動(dòng)子而抑制開花[90]。從圖 2-1 很明顯地可以看出,每個(gè) A-TsRAVs( TsRAV1-TsRAV4 ) 基 因 都 含 有 核 定 位 序 列 ( NLS ) , 而 B-TsRAVs(TsRAV5-TsRAV8)不含該序列,因此推測(cè)核定位序列的有無對(duì) RAV 轉(zhuǎn)錄因子的功能起到至關(guān)重要的作用。除了 BRD 結(jié)構(gòu)域外,對(duì) A-TsRAVs 和 B-TsRAVs 進(jìn)行蛋白序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)兩組基因蛋白序列在高度保守區(qū)域出現(xiàn)個(gè)別氨基酸的變化,變化較顯著的有:A-TsRAVs 在圖中第一、二位為非極性的脯氨酸,第七位為非極性的纈氨酸,第九位非極性的苯丙氨酸,第十二位為極性谷氨酸,第十三位為非極性亮氨酸,第十四位為極性天冬酰胺,十八、十九位為極性絡(luò)氨酸,二十一位為非極性丙氨酸。而 B-TsRAVs 依次為極性的谷氨酸,極性的天冬酰胺,極性的精氨酸,非極性纈氨酸,極性谷氨酸,非極性纈氨酸,非極性苯丙氨酸,極性谷氨酸;如圖 2-2 所示,這種組間的差異可能會(huì)影響 RAV 蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)及 DNA 結(jié)合能力和活性。
圖 2-5 鹽芥和擬南芥 RAV 基因家族 Motif 分析示意圖Fig.2-5 Schematic illustrations of the types and distributions of motifs for each TsRAV familymembers and AtRAVs with a same group符合篩選條件(e-value<1e-7)的有 17 個(gè)保守的 Motif。位于 AP2 結(jié)構(gòu)域前的 Motif5、Motif12,,位于 B3 結(jié)構(gòu)域內(nèi)部的 Motif 9 以及在 C 端的 Motif8 都A組基因特有的保守結(jié)構(gòu),AP2結(jié)構(gòu)域內(nèi)部的Motif 10、B3結(jié)構(gòu)域內(nèi)部的Mot、Motif 16 及在 BRD 結(jié)構(gòu)域前端的 Motif 14 只存在于 B 組基因結(jié)構(gòu)中。由上比較可見 Motif的種類和分布出現(xiàn)明顯的分組現(xiàn)象。2.3.5 擬南芥和鹽芥 RAV 基因家族信號(hào)肽分析信號(hào)肽可以引導(dǎo)分泌性蛋白質(zhì)穿過其合成所在的細(xì)胞,進(jìn)入到其他細(xì)胞中發(fā)作用,因此信號(hào)肽對(duì)蛋白分泌的過程有非常重要的作用。信號(hào)肽位于外分泌蛋的 N 端,當(dāng)新合成的含有信號(hào)肽的多肽通過轉(zhuǎn)運(yùn)途徑進(jìn)入到糙面內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上繼合成蛋白的時(shí)候,其 N 端的信號(hào)肽結(jié)構(gòu)被切除。信號(hào)肽的長(zhǎng)度一般是 10-4
【學(xué)位授予單位】:天津大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:Q943.2
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本文編號(hào):2575928
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