【摘要】：從龍眼轉(zhuǎn)錄組unigene序列篩選獲得龍眼DCL基因(命名為DlDCL)全長(zhǎng)序列,并結(jié)合生物信息學(xué)及實(shí)時(shí)熒光定量等方法,對(duì)龍眼DCL基因進(jìn)行研究,以明確DlDCLs在龍眼體胚、不同生長(zhǎng)組織部位中的表達(dá)規(guī)律及其對(duì)激素和光質(zhì)應(yīng)答反應(yīng),為進(jìn)一步研究龍眼體胚過(guò)程中DlDCLs基因的調(diào)控研究奠定基礎(chǔ)。結(jié)果表明:(1)龍眼轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)存在DlDCL1、DlDCL2、DlDCL3和DlDCL4四個(gè)DCL家族成員,且基于Unigene的FPKM值發(fā)現(xiàn)不同基因在體胚發(fā)生階段具有差異表達(dá)。(2)生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),DlDCLs成員間基本理化性質(zhì)較為類似,均為親水性不穩(wěn)定蛋白、不含信號(hào)肽、可進(jìn)行跨膜運(yùn)動(dòng),但也存在一定差異,如DlDCL2為堿性蛋白,而其他3個(gè)成員為酸性蛋白;亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)顯示,DlDCLs均定位于細(xì)胞核中,但DlDCL2也存在定位于葉綠體中;對(duì)DCL蛋白結(jié)構(gòu)域預(yù)測(cè)顯示,DCL是高度保守的蛋白。(3)系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析顯示,不同物種的DCL分為4個(gè)分支,同源的DCL蛋白都聚為一類,且DlDCLs與柑橘DCL親緣關(guān)系更為接近。(4)實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,DlDCLs在龍眼非胚性愈傷組織和體胚發(fā)生過(guò)程中的表達(dá)模式差異較大,但DlDCLs在愈傷組織階段均有較高的表達(dá)量,推測(cè)DlDCLs在體胚發(fā)生過(guò)程可能具有功能的獨(dú)立和協(xié)作。DlDCL1和DlDCL2在葉片、花器官等組織部位中的相對(duì)表達(dá)量較高,暗示DlDCL1和DlDCL2可能參與到光合作用和花器官的發(fā)育;DlDCLs還受2,4-D、MeJA、SA激素和光質(zhì)誘導(dǎo),表明DlDCLs可能參與激素和光質(zhì)調(diào)控。

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本文編號(hào)：2575693