【摘要】：云南是世界公認的亞洲栽培稻遺傳多樣性和起源中心之一。利用51對SSR分子標記對云南哈尼梯田當前栽培的111份水稻材料進行多態(tài)性檢測,并分析其群體結構。聚類分析表明,供試材料主要分為偏粳類群(group I)及偏秈類群(group II)兩大類群,其中以偏秈類群居多,占83%,這兩類群并未完全按地理來源聚類。所選材料稻米的糊化溫度變異較廣,可以分為低(66℃)、中低(66~70℃)、中高(70~74℃)和高(74℃)4類。通過基因測序,分析了稻米糊化溫度控制基因ALK的序列多樣性,發(fā)現(xiàn)其可以分為10種單倍型。關聯(lián)分析結果表明,所選水稻樣品稻米的糊化溫度主要由ALK基因3個SNP位點組合控制。其中,A-GC和G-TT兩種組合主要控制低(66℃)和中低(66~70℃)糊化溫度,G-GC組合主要控制中高(70~74℃)和高(74℃)糊化溫度。SNP3402 T類型與高、中高糊化溫度有關。絕大多數(shù)偏秈類品種的ALK基因含有G-GC組合,因此都傾向于高糊化溫度。上述研究結果為水稻分子育種和種質資源保護研究提供了一定的參考價值。

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