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西雙版納黃瓜Cs-Psy1基因的序列特征與表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2019-11-09 07:09
【摘要】:西雙版納黃瓜是我國特有的果肉橙黃色的黃瓜變種資源,不同種質(zhì)間的β-胡蘿卜素含量差異明顯。PSY是胡蘿卜素生物合成途徑中的第1個(gè)限速酶。本文以西雙版納黃瓜為試材,分別克隆西雙版納黃瓜八氫番茄紅素合成酶(Cs-PSY1)的DNA和c DNA序列,結(jié)果顯示,DNA長2797 bp,包含5個(gè)內(nèi)含子和6個(gè)外顯子,c DNA序列長1385 bp,編碼421個(gè)氨基酸。Psy1推測(cè)的氨基酸序列包含該家族的2個(gè)特征序列,保守性很高。該蛋白為不穩(wěn)定蛋白,無明顯疏水區(qū),未預(yù)測(cè)到跨膜結(jié)構(gòu);系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示,西雙版納黃瓜的Cs-PSY1蛋白與甜瓜的同源性較高;與栽培黃瓜深度測(cè)序材料"9930"和"GY14"的序列進(jìn)行比較分析,結(jié)合115份黃瓜重測(cè)序結(jié)果,共發(fā)現(xiàn)5個(gè)SNP,其中2個(gè)位于起始密碼子上游27 bp處和971 bp處,3個(gè)位于內(nèi)含子區(qū)域。其中SNP4在重測(cè)序的19份西雙版納黃瓜中的突變率為100%,在96份栽培黃瓜中的特異性為5.3%。轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,在普通栽培黃瓜該位點(diǎn)處存在一個(gè)CTAG motif,在西雙版納黃瓜中該位點(diǎn)突變后則不存在該motif。利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)分析Cs-Psy1的表達(dá)量變化趨勢(shì),結(jié)果表明,在黃瓜不同果實(shí)發(fā)育時(shí)期,該基因的表達(dá)量均呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢(shì),在西雙版納黃瓜中表達(dá)量變化的差異明顯,在授粉后50 d達(dá)到最大值,是果實(shí)發(fā)育初期表達(dá)量的8倍多,是同時(shí)期普通黃瓜的4倍多,而普通黃瓜表達(dá)量的總體變化相對(duì)平緩。西雙版納黃瓜果實(shí)內(nèi)果皮的表達(dá)水平明顯高于中果皮,最高相差約5倍,普通黃瓜差異不明顯。從上述研究結(jié)果推測(cè)Psy1基因可能影響西雙版納黃瓜的β-胡蘿卜素積累。
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本文編號(hào):2558320

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