【摘要】：本研究首先從施氏鱘(Acipenser schrenckii)性腺轉(zhuǎn)錄組中獲得nanos1(Asnanos1)基因全長c DNA,并對其序列的準(zhǔn)確性和特征分別進行PCR驗證和生物信息學(xué)分析。進一步利用熒光定量RT-PCR技術(shù)檢測Asnanos1基因在雌、雄施氏鱘的性腺、心臟、鰓、腦、腎、肝臟、脾臟等組織中的表達(dá)量。利用熒光定量RT-PCR技術(shù)檢測Asnanos1基因在雌、雄施氏鱘的性腺、心臟、鰓、腦、腎、肝臟、脾臟等組織中的表達(dá)量。結(jié)果顯示:Asnanos1的c DNA全長為1 389 bp,其中,5′非編碼區(qū)(UTR)為414 bp,3′UTR為279 bp,ORF為696 bp。該基因共編碼231個氨基酸。Asnanos1基因在施氏鱘除心臟以外的各組織中均有表達(dá),在雌、雄魚的鰓、腦、腎、肝臟、脾臟等組織中表達(dá)量無顯著差異,但在卵巢中的表達(dá)量顯著高于其他各組織(P0.05)。所得到的結(jié)果可為人工培育全雌施氏鱘苗種提供一些基礎(chǔ)資料。
【圖文】：

MarineSciences/Vol.41,No.4/201719圖1Asnanos1全長cDNA序列及氨基酸序列Fig.1cDNAanddeducedaminoacidsequencesoftheAsnanos1gene黃色底為磷酸化位點;起始密碼子atg用紅色線表示;終止密碼子taa用加粗表示;灰色區(qū)域為α螺旋。下劃線所指示的區(qū)域為保守的-CCHC-鋅指結(jié)構(gòu)域,黑色加粗顯示的為核心的Cys或HisPhosphorylationsitesaremarkedinyellow;Theinitiationcodon(atg)ismarkedbyredline;Thestopcodon(taa)ischaracterizedinbold;Fiveα-helixedaremarkedwithgray;Conserved-CCHC-zincfingerdomainisunderlined;CysorHisareinbold圖2推測的Asnanos1氨基酸序列的三級結(jié)構(gòu)Fig.2Predictedthree-dimensionalstructureoftheAsnanos1gene結(jié)果顯示(圖4),Asnanos1基因在施氏鱘除心臟以外的各組織中均有表達(dá),在雌、雄魚的鰓、腦、腎、肝臟、脾臟等組織中表達(dá)量無顯著差異,但在卵巢中的表達(dá)量顯著高于其他各組織(P<0.05)。3討論與結(jié)論本研究獲得了Asnanos1的cDNA全長為1389bp,其中,5′UTR為414bp,3′UTR為279bp以及696bp的ORF。該基因共編碼231個氨基酸。Blast分析可知,Asnanos1與nanos2和nanos3在分類進化上的關(guān)系較遠(yuǎn),而與nanos1聚為一大支。這些結(jié)果充分表明本研究所得到的基因序列為Asnanos1。系統(tǒng)進化樹結(jié)果顯示:在nanos1的進化中,施氏鱘與斑點雀鱔聚為一支,但與中華鱘有一定的距離,產(chǎn)生這個現(xiàn)象的原因有待于進一步研究。Asnanos1蛋白氨基酸序列的C端具有兩個保守-CCHC-(-Cys-Cys-His-Cys-)鋅指結(jié)構(gòu)域,這一結(jié)構(gòu)特征與在其他物種nanos1中也同樣存在,是nanos1蛋白發(fā)揮功能所必需的。

MarineSciences/Vol.41,No.4/201719圖1Asnanos1全長cDNA序列及氨基酸序列Fig.1cDNAanddeducedaminoacidsequencesoftheAsnanos1gene黃色底為磷酸化位點;起始密碼子atg用紅色線表示;終止密碼子taa用加粗表示;灰色區(qū)域為α螺旋。下劃線所指示的區(qū)域為保守的-CCHC-鋅指結(jié)構(gòu)域,黑色加粗顯示的為核心的Cys或HisPhosphorylationsitesaremarkedinyellow;Theinitiationcodon(atg)ismarkedbyredline;Thestopcodon(taa)ischaracterizedinbold;Fiveα-helixedaremarkedwithgray;Conserved-CCHC-zincfingerdomainisunderlined;CysorHisareinbold圖2推測的Asnanos1氨基酸序列的三級結(jié)構(gòu)Fig.2Predictedthree-dimensionalstructureoftheAsnanos1gene結(jié)果顯示(圖4),Asnanos1基因在施氏鱘除心臟以外的各組織中均有表達(dá),在雌、雄魚的鰓、腦、腎、肝臟、脾臟等組織中表達(dá)量無顯著差異,但在卵巢中的表達(dá)量顯著高于其他各組織(P<0.05)。3討論與結(jié)論本研究獲得了Asnanos1的cDNA全長為1389bp,其中,5′UTR為414bp,3′UTR為279bp以及696bp的ORF。該基因共編碼231個氨基酸。Blast分析可知,Asnanos1與nanos2和nanos3在分類進化上的關(guān)系較遠(yuǎn),而與nanos1聚為一大支。這些結(jié)果充分表明本研究所得到的基因序列為Asnanos1。系統(tǒng)進化樹結(jié)果顯示:在nanos1的進化中,施氏鱘與斑點雀鱔聚為一支,但與中華鱘有一定的距離,產(chǎn)生這個現(xiàn)象的原因有待于進一步研究。Asnanos1蛋白氨基酸序列的C端具有兩個保守-CCHC-(-Cys-Cys-His-Cys-)鋅指結(jié)構(gòu)域,這一結(jié)構(gòu)特征與在其他物種nanos1中也同樣存在,是nanos1蛋白發(fā)揮功能所必需的。
【作者單位】： 莆田市水產(chǎn)科學(xué)研究所;集美大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院;福建農(nóng)林大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(41306174) 福建省農(nóng)業(yè)科技重點資助項目(2013N0024) 莆田市科技局項目(2012N16)~~
【分類號】：S917.4

【參考文獻】

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本文編號：2551643