大蔥蠟質(zhì)相關(guān)基因AfCER1和AfKCS6的克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2019-09-09 20:58
【摘要】:大蔥(Allium fistulosum)是我國(guó)傳統(tǒng)的蔬菜和調(diào)味品之一,其葉片表面覆蓋有明顯的蠟質(zhì)層,本課題組發(fā)現(xiàn)一株大蔥少蠟突變體,是研究蠟質(zhì)合成機(jī)制的較好材料。本項(xiàng)目組前期開展了大蔥表皮轉(zhuǎn)錄組分析,篩選出了兩個(gè)與蠟質(zhì)合成相關(guān)的基因AfCER1和AfKCS6。本文以野生型和突變型大蔥為實(shí)驗(yàn)材料,結(jié)合形態(tài)學(xué)、生物信息學(xué)、生理生化學(xué)對(duì)蠟質(zhì)代謝特性進(jìn)行研究,旨在為大蔥蠟質(zhì)合成的分子機(jī)制提供理論基礎(chǔ)。主要的結(jié)果如下:1.掃描電鏡可以觀察到野生型大蔥的葉表面覆蓋有尖狀晶體,突變型中未發(fā)現(xiàn)蠟質(zhì)晶體;野生型的株高、莖粗、蒸騰速率、及單位面積上的氣孔數(shù)高于突變型;野生型的葉綠素含量,凈光合速率低于突變型。2.利用RACE(rapid amplification of cDNA ends)技術(shù)獲得AfCER1(Allium fistulisum CER1)的全長(zhǎng)cDNA序列,并通過(guò)生物信息學(xué)手段分析基因的序列;利用RT-PCR和Real-time PCR分析AfCER1基因在大蔥野生型和突變型植株中的空間表達(dá)模式。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,AfCER1基因全長(zhǎng)為2144bp,包含一個(gè)1857 bp完整的開放閱讀框(ORF),編碼618個(gè)氨基酸。AfCER1與其他物種的CER1具有相似結(jié)構(gòu)域:脂肪酸羥化酶結(jié)構(gòu)域和WAX2-C結(jié)構(gòu)域。AfCER1基因在大蔥的根、葉鞘、葉片等部位均有表達(dá),且在野生型和突變型植株中的表達(dá)量有差異。在大蔥的根和葉鞘及剛見光的葉片中,AfCER1在突變型植株中的表達(dá)量相對(duì)野生型少,而在見光較多的葉片部位,AfCER1在突變型植株中的表達(dá)量卻比野生型多。3.野生型和突變型大蔥中克隆得到的AfKCS6序列存在差異性堿基,但預(yù)測(cè)的氨基酸序列是相同的;蛉L(zhǎng)包含一個(gè)1491bp完整的開放閱讀框(ORF),編碼497個(gè)氨基酸。AfKCS6基因在大蔥葉片部位顯著表達(dá),且在野生型和突變型植株的葉片部位表達(dá)量也有顯著性差異,野生型明顯高于突變型。4.將大蔥蠟質(zhì)相關(guān)基因AfKCS6克隆至原核表達(dá)載體PET-28a上,重組質(zhì)粒命名為PET28a-AfKCS6。
【圖文】:
大蔥蠟質(zhì)相關(guān)基因4/a:化/和4/KCS6的克隆與表達(dá)分析:(3-徑憸-ACP脫水生成反式-A2-Zf憸-ACP(trans-A2-enoyl-ACI>)脫水酶催化;(4)還原反應(yīng):由反式-A2-賭憸-ACP還原酶催化反增加了邋2個(gè)碳的憸基-ACP。每次反應(yīng)增加兩個(gè)碳原子,直到合成C再由憸基-ACP硫解酶(acyl-ACPthioesterase,FATB)催化裂解憸C16或C18脂肪酸["]。質(zhì)體內(nèi)有S種很重要的脂肪酸合成2-C4)[i9]、KASI(C4-C16)和邋KASII(C16邋—邋C18)[氣其中有幾個(gè)特異性,在質(zhì)體內(nèi)的多酶復(fù)合物中都存在PN。逡逑酸的延伸及各種衍生物的合成逡逑長(zhǎng)鏈脂肪酸(VLCFAs)的合成逡逑C18逡逑
質(zhì)成分可W跨過(guò)細(xì)胞壁到法表皮。有研究表明當(dāng)蠟質(zhì)成分穿過(guò)角質(zhì)層后,,會(huì)有目的逡逑的到達(dá)蠟質(zhì)晶體的合成位點(diǎn),進(jìn)一步裝配成各種晶體,因此蠟質(zhì)成分被運(yùn)輸?shù)奖砥ゅ义蠀^(qū)域后,就會(huì)表現(xiàn)出一個(gè)自我組織的系統(tǒng)[56](圖1.2)。逡逑f邐V\邐Cytoplasm邐、-逡逑-邐圖1.2蠟質(zhì)運(yùn)輸途徑【巧]逡逑Figure邋1邋.2邋The邋transport邋of邋wax逡逑1.3蠟質(zhì)相關(guān)基因的研究進(jìn)展逡逑目前關(guān)于表皮蠟質(zhì)研究還是挺多的,隨著蠟質(zhì)合成相關(guān)基因被陸續(xù)克隆成功,逡逑蠟質(zhì)合成過(guò)程也漸漸清晰,在合成的過(guò)程中有很多的基因都非常重要。逡逑有證據(jù)表明,在植物中可能存在多個(gè)延伸酶對(duì)不同的鏈的長(zhǎng)度有不同的特異性,逡逑產(chǎn)生不同鏈長(zhǎng)的VLCFAs口2]。KCR,HCD和ECR酶具有廣泛的底物特異性且可W共逡逑享所有FAE復(fù)合物特異性口4]。因此,在擬南芥基因組中21個(gè)KCS已被注釋[57],但逡逑5逡逑
【學(xué)位授予單位】:山西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S633.1;Q943.2
本文編號(hào):2533842
【圖文】:
大蔥蠟質(zhì)相關(guān)基因4/a:化/和4/KCS6的克隆與表達(dá)分析:(3-徑憸-ACP脫水生成反式-A2-Zf憸-ACP(trans-A2-enoyl-ACI>)脫水酶催化;(4)還原反應(yīng):由反式-A2-賭憸-ACP還原酶催化反增加了邋2個(gè)碳的憸基-ACP。每次反應(yīng)增加兩個(gè)碳原子,直到合成C再由憸基-ACP硫解酶(acyl-ACPthioesterase,FATB)催化裂解憸C16或C18脂肪酸["]。質(zhì)體內(nèi)有S種很重要的脂肪酸合成2-C4)[i9]、KASI(C4-C16)和邋KASII(C16邋—邋C18)[氣其中有幾個(gè)特異性,在質(zhì)體內(nèi)的多酶復(fù)合物中都存在PN。逡逑酸的延伸及各種衍生物的合成逡逑長(zhǎng)鏈脂肪酸(VLCFAs)的合成逡逑C18逡逑
質(zhì)成分可W跨過(guò)細(xì)胞壁到法表皮。有研究表明當(dāng)蠟質(zhì)成分穿過(guò)角質(zhì)層后,,會(huì)有目的逡逑的到達(dá)蠟質(zhì)晶體的合成位點(diǎn),進(jìn)一步裝配成各種晶體,因此蠟質(zhì)成分被運(yùn)輸?shù)奖砥ゅ义蠀^(qū)域后,就會(huì)表現(xiàn)出一個(gè)自我組織的系統(tǒng)[56](圖1.2)。逡逑f邐V\邐Cytoplasm邐、-逡逑-邐圖1.2蠟質(zhì)運(yùn)輸途徑【巧]逡逑Figure邋1邋.2邋The邋transport邋of邋wax逡逑1.3蠟質(zhì)相關(guān)基因的研究進(jìn)展逡逑目前關(guān)于表皮蠟質(zhì)研究還是挺多的,隨著蠟質(zhì)合成相關(guān)基因被陸續(xù)克隆成功,逡逑蠟質(zhì)合成過(guò)程也漸漸清晰,在合成的過(guò)程中有很多的基因都非常重要。逡逑有證據(jù)表明,在植物中可能存在多個(gè)延伸酶對(duì)不同的鏈的長(zhǎng)度有不同的特異性,逡逑產(chǎn)生不同鏈長(zhǎng)的VLCFAs口2]。KCR,HCD和ECR酶具有廣泛的底物特異性且可W共逡逑享所有FAE復(fù)合物特異性口4]。因此,在擬南芥基因組中21個(gè)KCS已被注釋[57],但逡逑5逡逑
【學(xué)位授予單位】:山西大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S633.1;Q943.2
【相似文獻(xiàn)】
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1 奧娜;大蔥蠟質(zhì)相關(guān)基因AfCER1和AfKCS6的克隆與表達(dá)分析[D];山西大學(xué);2016年
本文編號(hào):2533842
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