【摘要】：試驗(yàn)以人GUCY1A3和SFXN1基因序列為探針,BLAST獲得同源性較高的牛的表達(dá)序列標(biāo)簽(ESTs)序列及部分mRNA序列。通過(guò)RT-PCR方法從牛肌肉及腦組織克隆cDNA序列與牛表達(dá)序列標(biāo)簽進(jìn)行拼接,獲得牛GUCY1A3和SFXN1基因,并對(duì)其進(jìn)行了生物學(xué)特性分析。序列分析表明,牛GUCY1A3基因編碼區(qū)長(zhǎng)2 076bp,編碼691個(gè)氨基酸;牛SFXN1基因編碼區(qū)長(zhǎng)969bp,編碼322個(gè)氨基酸。氨基酸序列分析表明,GUCY1A3蛋白磷酸化位點(diǎn)分布于絲氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和蘇氨酸(Thr)殘基上,主要分布在細(xì)胞質(zhì)中,不屬于分泌蛋白,二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)以α螺旋為主,保守結(jié)構(gòu)域含1個(gè)CYCc功能結(jié)構(gòu)域;SFXN1蛋白磷酸化位點(diǎn)分布于絲氨酸(Ser)、酪氨酸(Tyr)和蘇氨酸(Thr)殘基上,主要分布在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)和漿膜上,屬于跨膜蛋白,二級(jí)結(jié)構(gòu)以α螺旋為主,保守結(jié)構(gòu)域含1段低復(fù)雜度序列和3段跨膜螺旋區(qū)。試驗(yàn)結(jié)果為進(jìn)一步研究牛GUCY1A3和SFXN1基因的表達(dá)調(diào)控機(jī)制與功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Using human GUCY1A3 and SFXN1 gene sequences as probes, the (ESTs) sequence and some mRNA sequences of bovine expression sequence tags with high homology were obtained by BLAST. Bovine GUCY1A3 and SFXN1 genes were obtained by splicing cDNA sequences from bovine muscle and brain tissue with bovine expression sequence tags, and their biological characteristics were analyzed. Sequence analysis showed that the coding region of bovine GUCY1A3 gene was 2076bp, encoding 691 amino acids, and the coding region of bovine SFXN1 gene was 969bp, encoding 322amino acids. Amino acid sequence analysis showed that the phosphate sites of GUCY1A3 protein were distributed on serine (Ser), tyrosine (Tyr) and threonine (Thr) residues, which were mainly distributed in cytoplasm and did not belong to secretory proteins. The secondary structure was predicted to be 偽 helix, and the conserved domain contained one CYCc functional domain. The phosphate sites of SFXN1 protein are distributed on serine (Ser), tyrosine (Tyr) and threonine (Thr) residues, mainly on endoplasmic reticulum and serosa. They belong to transmembrane protein. The secondary structure is mainly 偽 helix. The conserved domain contains 1 segment of low complexity sequence and 3 segments of transmembrane spiral region. The results laid a foundation for further study on the expression and regulation mechanism and function of bovine GUCY1A3 and SFXN1 genes.
【作者單位】： 天津農(nóng)學(xué)院動(dòng)物科學(xué)與動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院;
【基金】：基金項(xiàng)目:高產(chǎn)轉(zhuǎn)基因肉牛新品種培育(2014ZX08007-002)
【分類(lèi)號(hào)】：Q78;S823

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2513829