【摘要】：MYB家族作為植物中較大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,參與調(diào)控植物的多種生理活動(dòng)。本研究基于芒果果實(shí)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,鑒定出71個(gè)MYB家族蛋白,其中包含1個(gè)4R-MYB蛋白、3個(gè)R1R2R3-MYB蛋白、60個(gè)R2R3-MYB蛋白和7個(gè)MYB相關(guān)蛋白。進(jìn)化樹及基序分析表明:除個(gè)別蛋白外,相同類型的MYB蛋白均聚在一起,且相近分支的MYB蛋白具有相同或相似的基序。60個(gè)全長(zhǎng)MYB家族蛋白中,大部分為不穩(wěn)定蛋白,且均為不含跨膜結(jié)構(gòu)和信號(hào)肽的親水性蛋白,亞細(xì)胞定位分析均定位于細(xì)胞核。進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn)芒果R2R3-MYB蛋白與擬南芥有較高的保守性。R2R3-MYB蛋白保守域分析發(fā)現(xiàn),R2和R3結(jié)構(gòu)域均有多個(gè)氨基酸保守不變。GO分析發(fā)現(xiàn)芒果R2R3-MYB蛋白共注釋到生物學(xué)過程、細(xì)胞組分和分子功能3大類功能的15個(gè)亞類。
[Abstract]:As one of the larger transcription factor families, MYB family is involved in the regulation of plant physiological activities. In this study, 71 MYB family proteins including 1 4R-MYB protein, 3 R1R2R3-MYB protein, 60 R2R3-MYB protein and 7 MYB related proteins were identified based on the results of transcriptome sequencing of mango fruit. Phylogenetic tree and motif analysis showed that the same type of MYB proteins were clustered together except for individual proteins, and the MYB proteins with similar branches had the same or similar motifs. Most of the 60 full-length MYB family proteins were unstable proteins. All of them were hydrophilic proteins without transmembrane structure and signal peptide. Subcellular localization analysis was located in the nucleus. Phylogenetic tree analysis showed that mango R2R3-MYB protein was highly conserved with Arabidopsis thaliana. R2R3-MYB protein conserved domain analysis showed that mango R2R3-MYB protein was conserved with Arabidopsis thaliana. There were many amino acids conserved in R2 and R3 domains. GO analysis showed that Mango R2R3-MYB protein was elucidated into 15 subclasses of biological processes, cellular components and molecular functions.
【作者單位】： 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所農(nóng)業(yè)部熱帶果樹生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：農(nóng)業(yè)行業(yè)科研專項(xiàng)子項(xiàng)目(No.201203092-3) 廣東省自然科學(xué)基金-粵西北創(chuàng)新人才專項(xiàng)(No.2016A030307006)
【分類號(hào)】：S667.7

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2407249