【摘要】：為了解太子參蠶豆萎蔫病毒2(Broad bean wilt virus 2,BBWV2)的遺傳多樣性及分子進(jìn)化關(guān)系,本研究對(duì)5個(gè)不同地理來源的6份太子參病葉樣品進(jìn)行了BBWV2外殼蛋白(coat protein,CP)基因的RT-PCR擴(kuò)增和克隆。序列分析結(jié)果表明,所得13條太子參BBWV2 CP基因序列均為1 345 bp,其核苷酸序列同一性在81.0%~99.0%之間,氨基酸序列同一性在93.5%~99.3%之間;核苷酸多樣性為0.084 00;存在280個(gè)核苷酸多態(tài)性位點(diǎn),其中232個(gè)為地域特異性位點(diǎn);總變異數(shù)為278個(gè),其中同義突變29個(gè),異義突變249個(gè)。不同地理來源的太子參BBWV2分離物之間遺傳分化程度較高,基因交流不頻繁,遺傳漂變可能導(dǎo)致分離物間明顯的遺傳分化。在系統(tǒng)進(jìn)化樹中,太子參分離物的聚類呈現(xiàn)出明顯的地域特異性,江蘇、貴州、湖南、福建分離物均聚類在I-a亞組,而山東分離物聚類在II-c亞組,遺傳距離較遠(yuǎn)。研究表明,太子參BBW V2存在很高的遺傳變異,基因突變是其產(chǎn)生遺傳多樣性的主要驅(qū)動(dòng)力,而地理因素與其具有較高的核苷酸多樣性密切相關(guān)。
[Abstract]:In order to understand the genetic diversity and molecular evolution relationship of Pseudostellaria heterophylla Vicia faba wilt virus 2 (Broad bean wilt virus 2 BBWV2, six samples of Pseudostellaria heterophylla from 5 different geographical sources were studied for BBWV2 coat protein (coat protein,. CP) gene was amplified and cloned by RT-PCR. The results of sequence analysis showed that the nucleotide sequence identity and amino acid sequence identity of 13 BBWV2 CP genes of Pseudostellaria heterophylla were between 81.0% and 99.3%, respectively. The nucleotide diversity was 0.084, and there were 280 nucleotide polymorphisms, of which 232 were loci specific, and the total number of variances was 278, of which 29 were synonymous mutations and 249 were heteronymy mutations. The genetic differentiation of BBWV2 isolates from different geographical sources was higher and the gene exchange was not frequent. Genetic drift might lead to obvious genetic differentiation among isolates. In phylogenetic tree, the cluster of Pseudostellaria heterophylla isolates showed obvious geographical specificity. The isolates of Jiangsu, Guizhou, Hunan and Fujian were clustered in I-a subgroup, while Shandong isolates were clustered in II-c subgroup, with a long genetic distance. The results showed that BBW V2 had high genetic variation, gene mutation was the main driving force for its genetic diversity, and geographical factors were closely related to its high nucleotide diversity.
【作者單位】： 寧德師范學(xué)院生物系;福建省特色藥用植物工程技術(shù)研究中心;三明市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院藥用植物研究所;
【基金】：福建省教育廳科技項(xiàng)目(JA15563) 寧德師范學(xué)院引進(jìn)人才項(xiàng)目(2014Y004) 福建省種業(yè)創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)化工程項(xiàng)目(2014S1477-12)
【分類號(hào)】：S435.675

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：2398885