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番茄PIN基因家族的生物信息學(xué)分析及其表達模式

發(fā)布時間:2018-12-26 16:58
【摘要】:PIN蛋白是生長素輸出蛋白,具有多個跨膜結(jié)構(gòu)域,能夠介導(dǎo)生長素在整個植物體內(nèi)的流動。番茄作為一種具有重要經(jīng)濟價值的果蔬,對其生長發(fā)育調(diào)控的研究具有重要的意義。研究表明,PIN蛋白對植物果實的生長發(fā)育起著重要的調(diào)控作用。本研究通過生物信息學(xué)的方法對番茄PIN基因組中10個SlPINs的核酸和氨基酸序列進行分析,構(gòu)建番茄Sl PINs的進化樹,并分析番茄SlPINs在不同組織和果實生長發(fā)育過程中的表達量變化,為進一步研究SlPINs的生物學(xué)功能提供理論依據(jù)。
[Abstract]:PIN protein is a auxin exportation protein with multiple transmembrane domains which can mediate the flow of auxin in the whole plant. As a kind of fruit and vegetable with important economic value, it is of great significance to study the regulation of tomato growth and development. The results show that PIN protein plays an important role in the growth and development of plant fruits. In this study, the nucleic acid and amino acid sequences of 10 SlPINs in tomato PIN genome were analyzed by bioinformatics, and the phylogenetic tree of tomato Sl PINs was constructed, and the expression of SlPINs in different tissues and fruit was analyzed. It provides a theoretical basis for the further study of the biological function of SlPINs.
【作者單位】: 清華大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與營養(yǎng)工程學(xué)院;中國人民大學(xué)農(nóng)業(yè)與農(nóng)村發(fā)展學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金面上項目(31371847;31272215) 國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(973計劃)項目(2013CB127106)
【分類號】:TS255.1

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