【摘要】：為了分析綿羊痘病毒A11R蛋白質(zhì)的分子特征,提取了山羊痘病毒古浪分離株(GL)的基因組DNA,設計引物進行PCR擴增,將PCR產(chǎn)物連接到p GEM-T Easy載體后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞,篩選陽性克隆進行序列測定,利用生物信息學軟件對A11R基因序列進行預測分析。結(jié)果顯示,A11R基因序列由954個核苷酸組成的開放閱讀框,編碼317個氨基酸殘基組成的多肽,蛋白質(zhì)分子質(zhì)量的理論值為36 091.7,理論等電點為5.14。A11R蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)中,α螺旋占29.02%,β折疊占10.41%,其余60.57%為無規(guī)則卷曲。多序列比對分析顯示,不同羊痘病毒分離株A11R序列高度保守,同源性在98%以上。進化樹分析結(jié)果顯示,GL株與NK株、TU株以及SA株在一個分支,說明它們之間具有較近的親緣關系,上述研究結(jié)果為進一步研究A11R蛋白質(zhì)的生物學功能和羊痘病毒早期蛋白質(zhì)分子間相互作用奠定了基礎。
[Abstract]:In order to analyze the molecular characteristics of sheep pox virus A11R protein, the genomic DNA, design primers of Goat pox virus Gourang isolate (GL) were extracted and amplified by PCR. The PCR product was ligated to p GEM-T Easy vector and transformed into Escherichia coli DH5 偽 competent cells. The positive clones were screened and sequenced. The A11R gene sequence was predicted and analyzed by bioinformatics software. The results showed that the A11R gene sequence was composed of 954 nucleotides and encoded 317 amino acid residues. The theoretical value of protein molecular weight was 36,091.7. The theoretical isoelectric point is the secondary structure of 5.14.A11R protein, 偽 helix is 29.02, 尾 folding is 10.41, the rest 60.57% is irregular crimp. Multiple sequence alignment analysis showed that the A11R sequence of different sheep pox virus isolates was highly conserved, and the homology was over 98%. The results of phylogenetic tree analysis showed that the GL strain was closely related to NK strain, TU strain and SA strain. These results provide a basis for further study on the biological function of A11R protein and the intermolecular interaction between the early proteins of sheep pox virus.
【作者單位】： 中國農(nóng)業(yè)科學院蘭州獸醫(yī)研究所/家畜疫病病原生物學國家重點實驗室/農(nóng)業(yè)部畜禽病毒學重點開放實驗室;吉林農(nóng)業(yè)大學動物科學技術學院;西北民族大學生命科學技術學院;
【基金】：國家質(zhì)檢總局公益性行業(yè)科研專項(201310093) 國家自然科學基金項目(31201892) 甘肅省自然科學基金項目(1208RJZA101) 國家“863”計劃項目(2012AA101304)
【分類號】：S852.65

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本文編號：2374264