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基于12S、16S rDNA和Cyt b基因部分序列云南23種鯉科魚類的分子系統(tǒng)發(fā)育研究

發(fā)布時間:2018-12-12 14:49
【摘要】:鯉科(Cyprinidae)魚類隸屬于硬骨魚綱(Osteichthyes)骨鰾總目(Ostariophysi)的鯉形目(Cypriniformes),是目前魚類中最大的一個科,也是我國淡水魚類最大的科。基于形態(tài)解剖和分子數(shù)據(jù)研究者對鯉科魚類的系統(tǒng)發(fā)育關系未形成一致的認識和結論。云南鯉科魚類的系統(tǒng)發(fā)育的重建,將為揭示我國和東亞魚類的系統(tǒng)發(fā)育研究提供新的數(shù)據(jù)。本研究測定了云南鯉科,共8個亞科20個屬23種魚類的12S rDNA、16S rDNA和Cyt b基因序列,以擬長鰍(Acanthopsoides gracilis)作為外類群,采用分子系統(tǒng)發(fā)育方法,重建了基于12S rDNA,16S rDNA和Cyt b基因部分序列的系統(tǒng)發(fā)育關系,分析了云南鯉科魚類的分子系統(tǒng)發(fā)育關系,研究結果顯示:1.本研究中的麗色低線渞(Barilius pulchellus)、羅碧魚(Paralaubuca barroni)、鳙魚(Aristichthys nobilis)、棒花魚(Abbottina rivularis)、中國結魚(Tor sinensis)、云南盤泩(Discogobio yunnanensis)、昆明裂腹魚(Shizothorax grahami)和大頭鯉(Cyprinus pellegrini)等23種云南鯉科魚類形成了由(魚丹)亞科(Danioninae)、湆亞科(Cultrinae)、鰱亞科(Hypophthalmichthyinae)、和泩亞科(Gobioninae)構成的雅羅魚系(Leuciscinea)和由渻亞科(Barbinae)、野鯪亞科(Labeoninae)、裂腹魚亞科(Schizothoracinae)和鯉亞科(Cyprininae)構成的渻系(Barbini)兩個大的支系。2.研究中基于12S rDNA+16S rDNA構建的ML樹、基于Cyt b構建的NJ樹和基于12S rDNA+16S rDNA+Cyt b構建的NJ樹均顯示,湆亞科中的翹嘴湆(Culter alburnus)、飄魚(Pseudolaubuca sinensis)、?條(Hemiculter leucisculus)和似淣(Toxabramis swinhonis)聚為一支,隸屬于湆亞科的羅碧魚(P.barroni)均未與其他4種湆亞科魚類聚為一支。本研究中采用的湆亞科魚類形成一個并系。3.短吻魚(Sikukia gudgeri)、黃尾短吻魚(S.flavicaudata)、云南四須渻(Barbodes huangchuchieni)、中國結魚(T.sinensis)、長臀渻(Mystacoleucus marginatus)和異斑小渻(Puntius ticto)共6種渻亞科魚類在研究中未聚成一支,初步推測認為渻亞科不是一個單系類群。4.研究中的5種渻亞科魚類中,云南四須渻在系統(tǒng)樹中均未聚于渻亞科分支的最基部,四須渻屬為渻亞科最原始的屬這一觀點有待商榷。5.重建的系統(tǒng)發(fā)育關系顯示,云南四須渻和長臀渻的系統(tǒng)發(fā)育位置較近,長臀渻和云南四須渻的親緣關系較近。
[Abstract]:Cyprinidae (Cyprinidae), which belongs to (Ostariophysi) of (Osteichthyes), is the largest family of fishes and the largest family of freshwater fishes in China. Based on morphological anatomy and molecular data, researchers have not reached a consistent understanding and conclusion on phylogenetic relationship of Cyprinidae. The phylogenetic reconstruction of Cyprinidae fishes in Yunnan will provide new data for revealing the phylogenetic studies of fishes in China and East Asia. In this study, 12s rDNA,16S rDNA and Cyt b gene sequences of 23 species of 20 genera and 8 subfamilies of Cyprinidae from Yunnan were determined. (Acanthopsoides gracilis) was used as the exotaxa and molecular phylogenetic method was used to reconstruct the fish based on 12s rDNA,. The phylogenetic relationships of 16s rDNA and Cyt b genes were studied. The molecular phylogenetic relationships of Cyprinidae in Yunnan were analyzed. The results showed that: 1. (Barilius pulchellus), (Paralaubuca barroni), bighead (Aristichthys nobilis), rosefish (Abbottina rivularis), in this study (Tor sinensis), (Tor sinensis), Yunnan (Discogobio yunnanensis), 23 species of Cyprinidae (Cyprinidae) from Yunnan, such as (Shizothorax grahami) and (Cyprinus pellegrini), were formed by (Hypophthalmichthyinae), of (Cultrinae), silver carp (Danioninae), subfamily). The two major branches of (Leuciscinea) and (Cyprininae) are (Leuciscinea) and (Barbini), which are composed of (Labeoninae), and (Cyprininae) of (Barbinae), subfamily (Barbinae), and (Cyprininae) of the subfamily Cyprinidae, respectively. 2. The ML tree based on 12s rDNA 16s rDNA, the NJ tree based on Cyt b and the NJ tree based on 12s rDNA 16s rDNA Cyt b show that (Pseudolaubuca sinensis),? The (Hemiculter leucisculus) and (Toxabramis swinhonis) were clustered into one branch, and P.barroni, belonging to the subfamily Phaeidae, did not form one with the other four species. In this study, the fishes of the subfamily Phaeidae form a parallel line. 3. (Sikukia gudgeri), S.flavicaudata, T.sinensis, (Mystacoleucus marginatus) and (Puntius ticto), six species of (Sikukia gudgeri), not one branch of the subfamily, were not found in the study. It is preliminarily speculated that Xiongsubfamily is not a monophyletic group. 4. Of the five species of the subfamily Shengliaceae studied, the view that none of the four XIANGXIANGXIANG of Yunnan Province is the most basic of the branches of the subfamily SHINGYIDAE in the systematic tree is the most primitive genus of the XIANGXIANG subfamily is open to question. 5. The phylogenetic relationship showed that the phylogenetic position of Yunnan Sixuxiao and long breech was close, and the relationship between Yunnan Sixuxiao and Yunnan Sixiao was close.
【學位授予單位】:云南師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:Q953

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本文編號:2374765

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