【摘要】：CLASP蛋白(CLIP-associated protein,CLASP)是一種調(diào)節(jié)微管結(jié)構(gòu)與功能的微管結(jié)合蛋白,在植物生長(zhǎng)發(fā)育及形態(tài)建成過(guò)程中起著至關(guān)重要的作用。本研究利用生物信息學(xué)的方法,在陸地棉基因組數(shù)據(jù)庫(kù)中鑒定出6個(gè)編碼CLASP蛋白的基因。多重序列比對(duì)及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明,陸地棉CLASPs可分為2個(gè)亞家族(I和II),亞家族I含有HEAT重復(fù)結(jié)構(gòu)域和典型的CLASP-N端結(jié)構(gòu)域,亞家族II只含有CLASP-N端結(jié)構(gòu)域。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果表明,6個(gè)CLASPs基因在棉花各組織中均有表達(dá),但表達(dá)模式各不相同,其中CotAD_63740(Gen Bank登錄號(hào)為KX881965)和CotAD_04861(Gen Bank登錄號(hào)為KX881961)在纖維中優(yōu)勢(shì)表達(dá),CotAD_48232(Gen Bank登錄號(hào)為KX881962)、CotAD_48665(Gen Bank登錄號(hào)為KX881963)、CotAD_55570(Gen Bank登錄號(hào)為KX881964)和CotAD_68468(Gen Bank登錄號(hào)為KX881966)在莖中優(yōu)勢(shì)表達(dá),表達(dá)模式的不同表明CLASPs在棉花不同組織中功能不同。本研究為深入研究棉花CLASPs的功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:CLASP protein (CLIP-associated protein,CLASP) is a microtubule-binding protein that regulates the structure and function of microtubules and plays an important role in plant growth and morphogenesis. In this study, six genes encoding CLASP protein were identified in the genome database of upland cotton by bioinformatics. Multiple sequence alignment and phylogenetic tree analysis showed that CLASPs of upland cotton could be divided into two subfamilies (I and II), subfamily I) containing HEAT repeat domain and typical CLASP-N terminal domain, and II only contained CLASP-N terminal domain. The results of real-time fluorescence quantitative PCR showed that all of the six CLASPs genes were expressed in different tissues of cotton, but the expression patterns were different. Among them, CotAD_63740 (Gen Bank accession number was KX881965) and CotAD_04861 (Gen Bank accession number was KX881961). CotAD_48232 (Gen Bank login number is KX881962), CotAD_48665 (Gen Bank login number is KX881963), CotAD_55570 (Gen Bank login number is KX881964) and CotAD_68468 (Gen Bank login number is KX881966). Different expression patterns indicated that CLASPs had different functions in different tissues of cotton. This study laid a foundation for further study on the function of cotton CLASPs.
【作者單位】： 石河子大學(xué)農(nóng)學(xué)院/新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)綠洲生態(tài)農(nóng)業(yè)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(U1128301) 新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)博士資金專(zhuān)項(xiàng)(2013BB003) 石河子大學(xué)高層次人才啟動(dòng)項(xiàng)目(RCZX201218)資助~~
【分類(lèi)號(hào)】：S562

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本文編號(hào)：2366388