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馬氏珠母貝DcpS基因的分子特征與表達(dá)分析

發(fā)布時間:2018-11-21 21:05
【摘要】:清道夫脫帽酶(DcpS)是一種mRNA脫帽酶,與基因表達(dá)調(diào)控、呼吸、運(yùn)動神經(jīng)元活動,癌癥和各種應(yīng)激反應(yīng)緊密相關(guān)。本研究采用cDNA末端快速擴(kuò)增(RACE)技術(shù)克隆獲得了馬氏珠母貝DcpS(Pm Dcp )基因cDNA全長序列;運(yùn)用實(shí)時熒光定量PCR(Real-time PCR)技術(shù)檢測Pm DcpS基因在馬氏珠母貝不同組織中的表達(dá)模式。結(jié)果顯示,Pm DcpS基因序列全長1 034 bp,其中開放閱讀框(ORF)為975 bp,編碼324個氨基酸,5'非編碼區(qū)(5'UTR)長為25 bp,3'非編碼區(qū)(3'UTR)長為34 bp,包含29 bp的poly A。預(yù)測分子量約為37.94 k D,理論等電點(diǎn)為6.12。序列分析發(fā)現(xiàn)Pm DcpS具有典型DcpS結(jié)構(gòu)域。多序列比對結(jié)果表明物種間DcpS具有較高的保守性,與太平洋牡蠣的相似性為65.6%。實(shí)時熒光定量PCR數(shù)據(jù)分析表明,該P(yáng)m DcpS基因在馬氏珠母貝性腺、鰓、肝胰腺、血細(xì)胞、閉殼肌、外套膜邊緣區(qū)、外套膜中央?yún)^(qū)這7種組織中均有表達(dá),其中在外套膜中央?yún)^(qū)和肝胰腺表達(dá)量較高。本研究可為進(jìn)一步探究Pm DcpS在貝類中的生物學(xué)功能提供重要的理論基礎(chǔ)和參考價值。
[Abstract]:Scavenger discap enzyme (DcpS) is a mRNA discap enzyme, which is closely related to gene expression regulation, respiration, motor neuron activity, cancer and various stress responses. In this study, the full-length cDNA sequence of DcpS (Pm Dcp) gene of Pinctada martensii was cloned by rapid amplification of (RACE) at the end of cDNA. The expression patterns of Pm DcpS gene in different tissues of Pinctada martensii were detected by real-time fluorescence quantitative PCR (Real-time PCR). The results showed that the total length of, Pm DcpS gene was 1 034 bp,. The open reading frame (ORF) encoded 324 amino acids for 975 bp, and the 5 'non-coding region (5'UTR) was 25 bp,3' non-coding region (3'UTR). The length of 3'UTR was 34 bp,. Poly A. The predicted molecular weight is about 37.94 KD and the theoretical isoelectric point is 6.12. Sequence analysis showed that Pm DcpS had a typical DcpS domain. The results of multiple sequence alignment showed that DcpS among species was highly conserved, and the similarity with Pacific oyster was 65.6. Real-time fluorescence quantitative PCR analysis showed that the Pm DcpS gene was expressed in the gonad, Gill, hepatopancreas, blood cells, obturator muscle, marginal region of coat membrane and central region of coat membrane in seven kinds of tissues, such as gonad, Gill, hepatopancreas, blood cells, adductor muscle, and central region of coat membrane. The expression level was higher in the central region of coat membrane and hepatopancreas. This study can provide important theoretical basis and reference value for further exploring the biological function of Pm DcpS in shellfish.
【作者單位】: 廣東海洋大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金“馬氏珠母貝植核育珠移植耐受免疫相關(guān)基因與蛋白質(zhì)鑒定及關(guān)聯(lián)度研究”(31472306) 廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目“海水珍珠貝功能基因的開發(fā)與應(yīng)用研究”(2012A031100010) 廣東省海港建設(shè)與漁業(yè)產(chǎn)業(yè)發(fā)展專項(xiàng)”馬氏珠母貝抗菌功能多肽的提取與應(yīng)用研究“(A201608B15)共同資助
【分類號】:Q78;S917.4

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本文編號:2348253

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