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遼寧地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒分離株ORF5基因的遺傳變異分析

發(fā)布時(shí)間:2018-11-07 14:31
【摘要】:為研究遼寧地區(qū)豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)ORF5基因的生物學(xué)特性及遺傳變異情況,通過RT-PCR方法對PRRSV陽性樣品的ORF5基因進(jìn)行擴(kuò)增,應(yīng)用DNA Star軟件對檢測的序列進(jìn)行比對和遺傳變異分析。結(jié)果顯示,分離的8株P(guān)RRSV的ORF5基因全長為603 bp,均屬北美型,不同分離株間的核苷酸、氨基酸同源性分別為91.5%~99.0%、88.1%~98.5%;遺傳變異分析表明,分離株處于不同的進(jìn)化分支,但均屬于亞群3,為高致病性PRRSV。以上結(jié)果表明,遼寧地區(qū)主要流行毒株為高致病性PRRSV,在不同地區(qū)有不同的PRRSV毒株同時(shí)流行,但具有相同的進(jìn)化來源。
[Abstract]:In order to study the biological characteristics and genetic variation of (PRRSV) ORF5 gene of porcine reproductive and respiratory syndrome virus (RRSV) in Liaoning province, the ORF5 gene of PRRSV positive samples was amplified by RT-PCR. DNA Star software was used to analyze the sequence alignment and genetic variation. The results showed that the total length of the ORF5 gene of the 8 PRRSV isolates was 603 bp,. The nucleotide and amino acid homology of the 8 isolates were 91.5 ~ 99.0 and 88.51%, respectively. Genetic variation analysis showed that the isolates were in different evolutionary branches, but all belonged to subgroup 3, and were highly pathogenic PRRSV.. The results showed that the main epidemic strains in Liaoning province were high pathogenic PRRSV, different PRRSV strains in different regions, but with the same evolutionary origin.
【作者單位】: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué);遼寧省動(dòng)物疫病預(yù)防控制中心遼寧省動(dòng)物醫(yī)學(xué)研究院;
【基金】:遼寧省自然科學(xué)基金指導(dǎo)計(jì)劃項(xiàng)目(20170540477) 遼寧省農(nóng)業(yè)攻關(guān)項(xiàng)目(2015202013)
【分類號】:S852.651

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本文編號:2316653

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