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白菜型冬油菜β-1,3-葡聚糖酶基因在低溫脅迫下的表達(dá)

發(fā)布時間:2018-11-07 12:24
【摘要】:為探明β-1,3-葡聚糖酶基因(β-1,3-glucanase)對油菜(Brassica campestris)抵御低溫脅迫能力的作用,通過蛋白質(zhì)譜分析得到β-1,3-葡聚糖酶蛋白,采用RT-PCR技術(shù)克隆白菜型冬油菜(B.rapa)隴油6號和天油4號β-1,3-葡聚糖酶的c DNA序列;并對該序列進(jìn)行生物信息學(xué)分析;進(jìn)而采用實時熒光定量PCR及半定量PCR檢測β-1,3-葡聚糖酶基因在低溫脅迫下的表達(dá)模式。結(jié)果獲得長度為1 032 bp的隴油6號β-1,3-葡聚糖酶基因開放閱讀框,編碼343個氨基酸,相對分子量為38.102k Da,理論等電點為6.63,其與菜心(B.rapa subsp.chinensis)和甘藍(lán)型油菜(B.napus)的蛋白質(zhì)氨基酸序列同源性高達(dá)93.94%。該基因編碼的酶是一個主要由α-螺旋組成的親水性穩(wěn)定蛋白,含有1個信號肽,存在2個跨膜結(jié)構(gòu)域。該基因在進(jìn)化上高度保守,其保守序列屬于植物的糖基水解酶家族17特有的保守結(jié)構(gòu)域。β-1,3-葡聚糖酶基因表達(dá)模式分析顯示,4°C時該基因上調(diào)表達(dá),繼續(xù)低溫( 4°C)脅迫處理,該基因上調(diào)表達(dá)至峰值,至 8°C時其表達(dá)下調(diào)。研究表明從白菜型冬油菜中克隆的β-1,3-glucanase在冬油菜品種隴油6號抗寒過程中發(fā)揮作用。
[Abstract]:In order to find out the effect of 尾 -1n 3-glucanase gene on the ability of rape (Brassica campestris) to resist low temperature stress, 尾 -1N 3-glucanase protein was obtained by protein spectrum analysis. RT-PCR technique was used to clone the c DNA sequences of Longyou 6 and Tianyu 4 尾 -1 glucanase from Brassica campestris (B.rapa). The sequence was analyzed by bioinformatics, and the expression pattern of 尾 -1m3-glucanase gene under low temperature stress was detected by real-time fluorescence quantitative PCR and semi-quantitative PCR. Results A 1 032 bp open reading frame of Longyou 6 尾 -1Glucanase gene was obtained, encoding 343 amino acids, with a relative molecular weight of 38.102 k Da, and a theoretical isoelectric point of 6.63. Its amino acid sequence homology with B.rapa subsp.chinensis and B.napus is 93.94. The enzyme encoded by this gene is a hydrophilic stable protein mainly composed of 偽 -helix, which contains a signal peptide and two transmembrane domains. This gene is highly conserved in evolution and belongs to the conserved domain of the glycosylhydrolase family 17 of plants. The expression pattern of 尾-1 and 3-glucanase gene was up-regulated at 4 擄C. The gene was up-regulated to a peak at 8 擄C and down-regulated at 8 擄C after continued hypothermia (4 擄C) stress. The results showed that 尾 -1N 3-glucanase cloned from winter rape of Chinese cabbage played a role in cold resistance of winter rape variety Longyou 6.
【作者單位】: 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院甘肅省油菜工程技術(shù)研究中心甘肅省作物遺傳改良與種質(zhì)創(chuàng)新重點實驗室;河西學(xué)院農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(No.CARS-13) 國家自然科學(xué)基金(No.31460356,No.31560397,No.3166040,No.31660404) 國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃(No.2015CB150206) 科技部油菜雜種優(yōu)勢利用技術(shù)與強(qiáng)優(yōu)勢雜交種創(chuàng)制(No.2016YFD0101300) 甘肅省教育廳科研專項(No.2015A-077)
【分類號】:S565.4

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本文編號:2316369

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