藍(lán)鷴源H9N2亞型禽流感病毒HA和NA基因序列分析
[Abstract]:In order to investigate the prevalence and variation of avian influenza virus (H9N2) in captivity blue pheasant, a strain of H9N2 subtype avian influenza virus was isolated from (Lophura swinhoii) of captive blue pheasant. Its HA and NA genes were amplified by PCR and sequenced. The nucleotide sequence of A/chicken/Guangxi/CLB02/2014 (H9N2) (KT023046) from Guangxi chicken in 2014 was the most similar between the HA gene sequence of this isolate and that of A/chicken/Guangxi/CLB02/2014 (H9N2) (KT023046) in Genbank. The nucleotide sequence similarity between NA gene and A/Lengshuitan/11197/2013 (H9N2) was the highest. The nucleotide sequence analysis of 97%.HA protein showed that the 226-amino acid residue of HA was leucine (Leu),. SA 偽 2-6 receptor binding was observed in mammals, and one basic amino acid was found in the PSRSSR GL, at the cleavage site. The HA protein had nine potential N-glycosylation sites, located at position 29821418298305313492551, respectively. The amino acid variation of HA receptor binding site was obvious. NA protein sequence analysis showed that there were 7 potential glycosylation sites in the neck of NA protein, which were located at 69-86146200234264368; The HA,NA gene phylogenetic tree analysis showed that the isolated strain belonged to the small evolutionary branch of Y280-Like in Eurasia branch and belonged to the same evolutionary branch as the vaccine strain. But the kinship is far away. The HA and NA genes of H9N2 subtype avian influenza virus (LS/GD/P29/16) from the blue pheasant are mutated to some extent, so it is necessary to strengthen epidemiological surveillance.
【作者單位】: 廣州動物園;華南農(nóng)業(yè)大學(xué);
【分類號】:S852.65
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,本文編號:2300265
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