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安徽地方豬LDLR基因多態(tài)、表達(dá)及其與肉質(zhì)的相關(guān)性分析

發(fā)布時間:2018-10-30 15:06
【摘要】:本研究以安徽地方豬種(圩豬、安慶六白豬、皖南黑豬和霍壽黑豬)為試驗材料,以在動物體內(nèi)膽固醇代謝過程中發(fā)揮重要功能的低密度脂蛋白受體(LDLR)基因為候選基因,采用PCR-SSCP技術(shù)檢測LDLR基因部分區(qū)段的遺傳變異,運用SPSS程序最小二乘分析法檢測該遺傳變異與血脂性狀相關(guān)指標(biāo)的相關(guān)性,并檢測突變位點對LDLR基因在肌肉和肝臟組織表達(dá)的遺傳效應(yīng);運用雙變量相關(guān)性分析檢測肝臟和背最長肌組織LDLR基因的表達(dá)水平對胴體及肉質(zhì)性狀的影響。研究影響血脂性狀相關(guān)功能基因的構(gòu)造、遺傳與變異、表達(dá)及其與相關(guān)性狀的相關(guān)性,選擇可能會存在新的分子標(biāo)記的多態(tài)性位點,以探討利用該基因作為分子標(biāo)記運用于豬遺傳育種的可行性,為安徽地方豬種血脂及肉質(zhì)性狀的遺傳改良提供科學(xué)根據(jù)。試驗結(jié)果如下:(1)LDLR基因組織表達(dá)譜分析:LDLR基因的表達(dá)水平在肝臟中最高,脾臟上的表達(dá)水平最低,組織中從高到低的表達(dá)依次是肝臟、背肌、背脂、心臟、腎、腦、肺、脾。該試驗驗證了LDLR基因在肝臟中的高表達(dá),為后續(xù)試驗的開展提供了科學(xué)依據(jù)。(2)圩豬、安慶六白、皖南黑豬和霍壽黑豬LDLR基因第三內(nèi)含子12088、12093堿基處發(fā)生A→G突變(g.12088AG)和C→T突變(g.12093CT)。通過群體遺傳學(xué)分析表明:在g.12088AG突變位點中檢測到AA、AG、GG三種基因型;在g.12093CT突變位點中檢測到CC、CT、TT三種基因型,經(jīng)過χ2適合性檢驗,被測豬群的基因型頻率和基因頻率都處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),g.12088AG與g.12093CT兩突變位點是連鎖突變位點。(3)圩豬LDLR基因g.12088AG/g.12093CT突變位點與血液中膽固醇含量的相關(guān)性分析表明:在此兩個位點的突變對血液總膽固醇、高密度和低密度脂蛋白膽固醇含量顯著影響。(4)圩豬LDLR基因在不同基因型個體的肝臟和肌肉中的表達(dá)分析表明:不同基因型的圩豬LDLR在肝臟上的轉(zhuǎn)錄水平有顯著差異,LDLR mRNA在AA/CC型圩豬肝臟中的表達(dá)顯著高于GG/TT型(P0.05);LDLR mRNA在肌肉中的表達(dá)沒有顯著差異。(5)LDLR基因的表達(dá)與胴體、肉質(zhì)性狀的相關(guān)性分析表明:圩豬肝臟LDLR mRNA的表達(dá)量與背最長肌肌肉脂肪酸中的硬脂酸含量呈顯著正相關(guān)(P0.05),與背膘厚呈顯著負(fù)相關(guān);圩豬背最長肌LDLR mRNA的表達(dá)量與背膘厚、肌肉膽固醇、肌內(nèi)脂肪、十六碳烯酸、油酸呈顯著正相關(guān)(P0.05),與肌肉脂肪酸中的硬脂酸和亞油酸呈顯著負(fù)相關(guān)(P0.05)。研究結(jié)果提示:LDLRg.12088AG/g.12093CT位點可以作為圩豬血脂性狀候選遺傳標(biāo)記,以應(yīng)用于血脂性狀的改良。豬LDLR基因可能在血脂性狀和胴體、肉質(zhì)性狀的形成過程中發(fā)揮重要作用。
[Abstract]:In this study, Anhui local pig breeds (Wei pig, Anqing six white pig, southern Anhui black pig and Huoshou black pig) were used as experimental materials, and the candidate genes of low density lipoprotein receptor (LDLR), which play an important role in cholesterol metabolism, were used as candidate genes. PCR-SSCP technique was used to detect the genetic variation in some segments of LDLR gene, and the correlation between the genetic variation and the related indexes of lipid traits was detected by SPSS program least square analysis. The genetic effects of mutation sites on the expression of LDLR gene in muscle and liver were detected. The effects of LDLR gene expression level on carcass and meat quality in liver and longissimus dorsi were detected by bivariate correlation analysis. To study the structure, inheritance and variation of functional genes related to lipid traits, their expression and their correlation with related traits, the selection of polymorphic loci with new molecular markers may exist. To explore the feasibility of using this gene as a molecular marker in pig genetics and breeding, and to provide scientific basis for the genetic improvement of blood lipids and meat quality traits in Anhui local pig breeds. The results were as follows: (1) the expression of LDLR gene: the expression level of LDLR gene was the highest in the liver, the lowest in the spleen, and the highest in the liver, the dorsal muscle, the heart, the kidney and the brain in the tissue. Lung, spleen. This experiment verified the high expression of LDLR gene in liver and provided the scientific basis for the subsequent test. (2) Pigs, Anqing six white, The A G mutation (g.12088AG) and C taut mutation (g.12093CT) occurred in the third intron 12088 of the LDLR gene in southern Anhui black pigs and Huoshou black pigs. Population genetic analysis showed that three genotypes of AA,AG,GG were detected in g.12088AG mutation sites. Three genotypes of CC,CT,TT were detected in the g.12093CT mutation site. The genotype frequency and gene frequency of the tested pigs were in the Hardy-Weinberg equilibrium state after 蠂 2 fitness test. (3) the relationship between g.12088AG/g.12093CT mutation site of LDLR gene and cholesterol content in blood was analyzed. High density and low density lipoprotein cholesterol contents were significantly affected. (4) the expression of LDLR gene in liver and muscle of different genotype individuals showed that the transcriptional level of LDLR in liver of different genotypes was significantly different. The expression of LDLR mRNA in liver of AA/CC type pigs was significantly higher than that of GG/TT type (P0.05). There was no significant difference in the expression of LDLR mRNA in muscle. (5) the expression of LDLR gene and carcass. The correlation analysis of meat quality traits showed that the expression of LDLR mRNA in liver was positively correlated with the content of stearic acid in longissimus dorsi muscle (P0.05) and negatively correlated with backfat thickness. The expression of LDLR mRNA in longissimus dorsi muscle was positively correlated with backfat thickness, muscle cholesterol, intramuscular fat, hexadecenoic acid and oleic acid (P0.05), and negatively correlated with stearic acid and linoleic acid in muscle fatty acids (P0.05). The results suggested that LDLRg.12088AG/g.12093CT locus could be used as a candidate genetic marker for blood lipid traits in fair pigs. Porcine LDLR gene may play an important role in the formation of lipid traits, carcass traits and meat quality traits.
【學(xué)位授予單位】:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:S828

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本文編號:2300340

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