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小桐子轉(zhuǎn)錄因子JcZAT10基因的分離與低溫表達(dá)分析

發(fā)布時間:2018-10-23 10:31
【摘要】:利用RT-PCR技術(shù)克隆小桐子C2H2型鋅指蛋白ZAT10轉(zhuǎn)錄因子基因c DNA序列,命名為Jc ZAT10,并對其基因結(jié)構(gòu)、功能結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)進化及差異表達(dá)進行了分析。結(jié)果表明,小桐子Jc ZAT10基因開放閱讀框全長753bp,編碼250個氨基酸,推測蛋白分子量為26.7k Da,理論等電點為8.45,并鑒定到兩個鋅指結(jié)構(gòu)域、核定位信號序列以及富Leu保守基序。系統(tǒng)進化分析顯示,Jc ZAT10與同屬大戟科的蓖麻親緣關(guān)系最近,序列一致性為79.6%。qRT-PCR分析表明,小桐子Jc ZAT10基因存在組織表達(dá)特異性,在莖中表達(dá)量較高,而在葉片中表達(dá)量較低,但在葉片與根中受低溫誘導(dǎo)表達(dá),且都在低溫脅迫3h時達(dá)到最大表達(dá)量。本研究為進一步對Jc ZAT10基因進行功能驗證以及其在低溫信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中的機制研究提供了依據(jù)。
[Abstract]:The c DNA sequence of ZAT10 transcription factor gene of C2H2 type zinc finger protein was cloned by RT-PCR, named Jc ZAT10, and its gene structure, functional domain, phylogeny and differential expression were analyzed. The results showed that the open reading frame of Jc ZAT10 gene was 753 BP in length and encoded 250 amino acids. The deduced molecular weight of the protein was 26.7k Da, and the theoretical isoelectric point was 8.45. Two zinc-finger domains, nuclear localization signal sequences and conserved Leu conserved motifs were identified. Phylogenetic analysis showed that Jc ZAT10 had the closest relationship with castor (Euphorbiaceae), and the sequence consistency was 79.6%.qRT-PCR analysis. The Jc ZAT10 gene of Paulownia chinensis had tissue expression specificity, higher expression in stem and lower expression in leaves. However, the expression was induced by low temperature in leaves and roots, and reached the maximum at 3h of low temperature stress. This study provides a basis for further functional verification of Jc ZAT10 gene and its mechanism in hypothermia signal transduction.
【作者單位】: 曲靖師范學(xué)院云南高原生物資源保護與利用研究中心;曲靖師范學(xué)院云南省高校云貴高原動植物遺傳多樣性及生態(tài)適應(yīng)性重點實驗室;云南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(31460179,31260064) 云南省高?萍紕(chuàng)新團隊支持計劃“云南省高校云南特境內(nèi)生菌資源的開發(fā)與利用科技創(chuàng)新團隊”
【分類號】:S794.9

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本文編號:2288973

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