發(fā)布時間：2018-10-14 16:33

【摘要】：以我國玉米育種中常用的16份自交系為材料,通過對SNAC(Stress-responsive NAM,ATAF1/2,CUC2)基因編碼區(qū)及上游啟動子區(qū)800 bp核苷酸序列進(jìn)行測序,檢測SNAC基因在不同雜種優(yōu)勢類群材料中的遺傳變異。在12個SNAC基因中,其中有4個基因在上游800 bp區(qū)檢測到遺傳變異,有4個基因變異位點超過30個,多態(tài)性較高。雖然大多數(shù)SNAC基因變異以SNP(Single nucleotide polymorphism)為主,但在ZmNAC031467基因中檢測到較多的插入缺失變異(In Del),達(dá)到基因總遺傳變異的63.3%。通過PLACE軟件對上游啟動子有變異的4個基因進(jìn)行3種耐逆結(jié)合元件的預(yù)測,結(jié)果顯示4個基因均含有3種耐逆結(jié)合元件,但是基因突變對啟動子結(jié)合元件的影響較小。再對檢測到的遺傳變異進(jìn)行核苷酸多態(tài)性分析和中性檢驗,有7個SNAC基因核苷酸多態(tài)性較高,其中Zm NAC080308基因的多態(tài)性達(dá)到0.00962,推測這些基因在遺傳漂移過程中受自然選擇影響較大。利用t檢驗初步發(fā)現(xiàn)Zm NAC070395和Zm NAC080398基因的2個變異位點與耐旱相關(guān)性狀關(guān)聯(lián),為進(jìn)一步分析SNAC基因核苷酸變異與耐旱性狀的關(guān)系提供一定的借鑒。
[Abstract]:Sixteen inbred lines commonly used in maize breeding in China were used to detect the genetic variation of SNAC gene in different heterosis groups by sequencing the 800 bp nucleotide sequences in the coding region and upstream promoter region of SNAC (Stress-responsive NAM,ATAF1/2,CUC2) gene. Of the 12 SNAC genes, 4 were found to have genetic variations in the upstream 800 bp region, and 4 had more than 30 mutation sites, with high polymorphism. Although the majority of SNAC gene mutations were SNP (Single nucleotide polymorphism), more insertion deletion mutations (In Del),) were detected in the ZmNAC031467 gene than in the total genetic variation (63.3%). PLACE software was used to predict three kinds of stress-tolerant binding elements for four genes with mutation in upstream promoter. The results showed that all four genes contained three kinds of stress-resistant binding elements, but the effect of gene mutation on promoter binding elements was small. Nucleotide polymorphism analysis and neutral test showed that 7 SNAC genes had higher nucleotide polymorphisms. The polymorphism of Zm NAC080308 gene reached 0.00962, which suggested that these genes were greatly affected by natural selection during genetic drift. T test was used to find the correlation between the two mutation sites of Zm NAC070395 and Zm NAC080398 genes and drought tolerance traits, which provided some reference for further analysis of the relationship between nucleotide variation and drought resistance of SNAC gene.
【作者單位】： 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所;吉林省通化市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院;
【基金】：國家自然科學(xué)基金重大國際合作項目(31661143010)和面上項目(31271735)資助~~
【分類號】：S513

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前5條

1 張世煌;;商業(yè)育種只需要兩個雜種優(yōu)勢群[J];種子科技;2014年07期

2 康桂娟;曾日中;聶智毅;黎瑜;代龍軍;段翠芳;;植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的研究進(jìn)展[J];生物技術(shù)通報;2012年11期

3 李偉;韓蕾;錢永強;孫振元;;植物NAC轉(zhuǎn)錄因子的種類、特征及功能[J];應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報;2011年04期

4 陳儒鋼;鞏振輝;逯明輝;李大偉;黃煒;;植物抗逆反應(yīng)中的轉(zhuǎn)錄因子網(wǎng)絡(luò)研究進(jìn)展[J];農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報;2010年01期

5 周琦,王文;DNA水平自然選擇作用的檢測[J];動物學(xué)研究;2004年01期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 賈瑞瑞;周鵬飛;白曉晶;陳善春;許蘭珍;彭愛紅;雷天剛;姚利曉;陳敏;何永睿;李強;;柑橘響應(yīng)潰瘍病菌轉(zhuǎn)錄因子CsBZIP40的克隆及功能分析[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2017年13期

2 李慧園;田春育;鄭玉瑩;武濤;;黃瓜耐鎘相關(guān)基因CsNAC019的克隆及表達(dá)分析[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2017年10期

3 李國君;馬藝文;徐丹陽;吳永波;宋潔;王楠;郝轉(zhuǎn)芳;趙娟;;玉米SNAC基因的遺傳變異及耐旱性調(diào)控[J];作物學(xué)報;2017年08期

4 方義生;劉寶紅;陳水蓮;陳海峰;張嬋娟;袁松麗;郝青南;楊中路;張曉娟;單志慧;邱德珍;陳李淼;周新安;;大豆轉(zhuǎn)錄因子GmNAC8的克隆及耐旱性功能分析[J];中國油料作物學(xué)報;2017年01期

5 梅婷;何正波;王小婷;王婷婷;陳斌;;中華按蚊化學(xué)感受蛋白(CSP)家族基因的全基因組鑒定和特征分析[J];昆蟲學(xué)報;2017年02期

6 王翠英;李鑫宇;王瀟然;李明杰;張重義;陳新建;;地黃根部響應(yīng)澇脅迫關(guān)鍵基因的鑒定[J];中國現(xiàn)代中藥;2017年02期

7 鄭學(xué)偉;SHAH Syed Tariq;范術(shù)麗;魏恒玲;龐朝友;李鴻彬;喻樹迅;;陸地棉轉(zhuǎn)錄因子GhNAC7的克隆及功能分析[J];中國農(nóng)業(yè)科學(xué);2017年03期

8 張全芳;梁水美;李燕;劉艷艷;范陽陽;郭慶法;魯守平;步迅;;基于熒光SSR標(biāo)記的玉米自交系遺傳結(jié)構(gòu)解析[J];植物遺傳資源學(xué)報;2017年01期

9 丁澤紅;顏彥;付莉莉;黃猛;鐵韋韋;胡偉;;木薯NAC轉(zhuǎn)錄因子Rd26基因克隆及表達(dá)[J];南方農(nóng)業(yè)學(xué)報;2016年11期

10 岳俊燕;岳文冉;楊杞;于秀敏;楊飛蕓;王光霞;李國婧;王瑞剛;叢靖宇;;中間錦雞兒轉(zhuǎn)錄因子基因CiNAC1的克隆及功能分析[J];西北植物學(xué)報;2016年07期

【二級參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前8條

1 朱昀;付俊杰;李朝煒;王國英;;NAC類轉(zhuǎn)錄因子在玉米未成熟雌zB發(fā)育中的作用[J];河南農(nóng)業(yè)科學(xué);2011年07期

2 張海娟;吳劍鋒;胡帥;余小林;;蕪菁NAC轉(zhuǎn)錄因子BcNAC2基因的分離及其表達(dá)[J];園藝學(xué)報;2011年06期

3 劉旭;李玲;;花生NAC轉(zhuǎn)錄因子AhNAC2和AhNAC3的克隆及轉(zhuǎn)錄特征[J];作物學(xué)報;2009年03期

4 柳展基;邵鳳霞;唐桂英;單雷;畢玉平;;一個新的玉米NAC類基因(ZmNAC1)的克隆與分析[J];遺傳;2009年02期

5 邵鳳霞;柳展基;魏麗奇;曹敏;畢玉平;;花生NAC類新基因AhNAC1的克隆及序列分析[J];西北植物學(xué)報;2008年10期

6 劉武;戴良英;;植物抗逆相關(guān)ERF轉(zhuǎn)錄因子研究綜述[J];中國農(nóng)學(xué)通報;2007年04期

7 賴鐘雄,楊f，

本文編號：2271008