【摘要】：ω-3脂肪酸脫氫酶是多不飽和脂肪酸亞麻酸生物合成途徑的關(guān)鍵酶。依據(jù)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)設(shè)計(jì)特異性引物,使用RT-PCR方法從滇牡丹克隆得到1個(gè)FAD3基因的c DNA全長(zhǎng)序列,命名為Pd FAD3(Gene Bank登錄號(hào)為KX289610)。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明Pd FAD3基因片段序列全長(zhǎng)2 134 bp,包含完整的c DNA開放閱讀框,編碼含有450個(gè)氨基酸殘基的蛋白質(zhì);Blast比對(duì)結(jié)果顯示該蛋白質(zhì)屬于FAD蛋白質(zhì)家族;系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示與芍藥屬芍藥組植物芍藥親緣關(guān)系較近;該蛋白質(zhì)屬于跨膜蛋白質(zhì),親水性較低;RT-PCR結(jié)果顯示其在種子中的表達(dá)隨著種子成熟出現(xiàn)雙峰型的表達(dá)量變化,與目前所報(bào)道的其他物種的FAD3表達(dá)情況相似。為進(jìn)一步研究其調(diào)控機(jī)理提供理論依據(jù)及獲得含高不飽和脂肪酸轉(zhuǎn)基因滇牡丹品種奠定理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:Omega-3 fatty acid dehydrogenase is the key enzyme of polyunsaturated fatty acid linolenic acid biosynthesis pathway. According to transcriptome data, a specific primer was designed and a full-length sequence of c DNA of FAD3 gene was cloned from Paeonia suffruticosa by RT-PCR method, named Pd FAD3 (Gene Bank accession number as KX289610). The results of bioinformatics analysis showed that the full length of Pd FAD3 gene fragment 2 134 bp, contained a complete c DNA open reading frame, encoding 450 amino acid residues, and Blast comparison showed that the protein belonged to FAD protein family. Phylogenetic tree analysis showed that the phylogenetic relationship between Paeonia and Paeoniflorin was close; the protein was a transmembrane protein with low hydrophilicity; RT-PCR showed that the expression of Paeoniflorin in seeds changed with the expression of bimodal type. The expression of FAD3 is similar to that of other species reported so far. To provide theoretical basis for further study on its regulation mechanism and obtain transgenic varieties of Yunnan peony with high unsaturated fatty acids.
【作者單位】： 西南林業(yè)大學(xué)林學(xué)院;國(guó)家林業(yè)局重點(diǎn)開放性實(shí)驗(yàn)室云南珍稀瀕特森林植物保護(hù)和繁育實(shí)驗(yàn)室云南省森林植物培育與開發(fā)利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;云南省林業(yè)科學(xué)院;
【基金】：云南省林業(yè)科學(xué)院重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室自主創(chuàng)新項(xiàng)目(22CX2016-05) 云南省科技計(jì)劃項(xiàng)目(2015A005) 云南省應(yīng)用基礎(chǔ)研究重點(diǎn)項(xiàng)目(2013FA054)
【分類號(hào)】：S685.11

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