【摘要】：以刺五加嫩葉為試材,采用二代測(cè)序方法Illumina HiSeq 4000進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序和生物信息學(xué)方法,找出其轉(zhuǎn)錄因子,并隨機(jī)挑選4個(gè)不同家族的轉(zhuǎn)錄因子,針對(duì)6個(gè)生長(zhǎng)時(shí)期和3個(gè)器官的樣本,使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR確認(rèn)轉(zhuǎn)錄因子的正確性。結(jié)果表明:刺五加轉(zhuǎn)錄組共計(jì)8.34Gb,拼接得到77 087條Unigenes,有485個(gè)轉(zhuǎn)錄因子,分類于36個(gè)家族。通過qRT-PCR分析,Unigene 49771、Unigene 22314、Unigene 13139和Unigene18837在不同生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期和器官中表達(dá)差異極顯著(P0.01)。
[Abstract]:The tender leaves of Acanthopanax senticosus were used for transcriptome sequencing and bioinformatics with the second generation sequencing method Illumina HiSeq 4000, and four transcription factors of different families were selected randomly. Real-time quantitative PCR was used to confirm the correctness of transcription factors in 6 growth stage and 3 organ samples. The results showed that the transcriptome of Acanthopanax senticosus was 8.34 Gb, and 77,087 Unigenes, had 485 transcription factors, which were classified into 36 families. QRT-PCR analysis showed that the expression of Unigene 13139 and Unigene18837 in different growth stages and organs were significantly different (P0.01).
【作者單位】： 華北理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31570683) 河北省教育廳資助科研資助項(xiàng)目(QN2014102) 華北理工大學(xué)培育基金資助項(xiàng)目(SP201508)
【分類號(hào)】：S567.19

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本文編號(hào)：2214601