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長雙歧桿菌BBMN68胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息學分析

發(fā)布時間:2018-08-23 19:41
【摘要】:目的:研究長雙歧桿菌BBMN68胞外多糖生物合成途徑和調控機制。方法:提取BBMN68胞外多糖,預測eps基因簇各基因編碼蛋白功能,克隆關鍵基因并對其進行進化分析。結果:在CDM和MRSC培養(yǎng)基上,長雙歧桿菌BBMN68產生胞外多糖,產量分別為100 mg/L和400 mg/L。本實驗室工作人員對其進行全基因組序列測定。根據全基因組序列,分析得到eps基因簇,對該基因簇各基因編碼蛋白的功能預測發(fā)現,BBMN68_1002編碼1個可能具有多糖重復單元轉運子功能的蛋白。BBMN68_1003、BBMN68_1006、BBMN68_1007和BMN68_1011與多糖重復單元聚合有關。BBMN68_1004、BBMN68_1008和BBMN68_1009參與糖基轉移。BMN68_1010控制多糖分子鏈長。BBMN68_1012編碼胞外多糖合成的關鍵酶——引導糖基轉移酶(priming glycosyltransferase,Cps D),啟動合成胞外多糖第1步。由Cps D基因構建的系統(tǒng)發(fā)育樹,BBMN68與猿猴、狨猴及大猩猩的長雙歧桿菌同枝,可能是飲食影響腸道細菌進化的結果。結論:本研究結果為解析長雙歧桿菌BBMN68胞外多糖生物合成途徑和調控機制奠定了理論基礎。
[Abstract]:Objective: to study the biosynthesis pathway and regulation mechanism of BBMN68 exopolysaccharide from Bifidobacterium longii. Methods: extracellular polysaccharides of BBMN68 were extracted, protein function of eps gene cluster was predicted, and key genes were cloned and analyzed. Results: on CDM and MRSC medium, BBMN68 produced extracellular polysaccharides with the yield of 100 mg/L and 400 mg/L., respectively. The whole genome sequence was sequenced by our laboratory staff. According to the whole genome sequence, the eps gene cluster was obtained. It is found that BBMN681002 encodes a protein. BBMN681003 / BBMN681003 / BBMN681006 BBMN686BBMN681007 and BMN68_1011 are associated with polysaccharide repeat unit polymerization. BBMN684BBMN681008 and BBMN68_1009 participate in glycosyl transfer. BMN681010 control polysaccharides. Molecular chain length. BBMN681012 encodes the key enzyme of extracellular polysaccharide synthesis-leading glycosyltransferase (priming glycosyltransferase,Cps D),) to initiate the synthesis of extracellular polysaccharides. BBMN68, a phylogenetic tree constructed from Cps D gene, shares the same branch with bifidobacteria in apes, marmosets and gorillas, which may be the result of diet affecting the evolution of intestinal bacteria. Conclusion: this study provides a theoretical basis for elucidating the biosynthesis pathway and regulation mechanism of BBMN68 exopolysaccharide in Bifidobacterium longiferi.
【作者單位】: 中國農業(yè)大學食品科學與營養(yǎng)工程學院食品質量與安全北京實驗室;
【基金】:中央在京高校重大成果轉化項目 國家科技支撐計劃項目(2011AA100903)
【分類號】:Q811.4;TS201.3

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本文編號:2199718

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