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長雙歧桿菌BBMN68胞外多糖生物合成基因的克隆及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時(shí)間:2018-08-23 19:41
【摘要】:目的:研究長雙歧桿菌BBMN68胞外多糖生物合成途徑和調(diào)控機(jī)制。方法:提取BBMN68胞外多糖,預(yù)測eps基因簇各基因編碼蛋白功能,克隆關(guān)鍵基因并對(duì)其進(jìn)行進(jìn)化分析。結(jié)果:在CDM和MRSC培養(yǎng)基上,長雙歧桿菌BBMN68產(chǎn)生胞外多糖,產(chǎn)量分別為100 mg/L和400 mg/L。本實(shí)驗(yàn)室工作人員對(duì)其進(jìn)行全基因組序列測定。根據(jù)全基因組序列,分析得到eps基因簇,對(duì)該基因簇各基因編碼蛋白的功能預(yù)測發(fā)現(xiàn),BBMN68_1002編碼1個(gè)可能具有多糖重復(fù)單元轉(zhuǎn)運(yùn)子功能的蛋白。BBMN68_1003、BBMN68_1006、BBMN68_1007和BMN68_1011與多糖重復(fù)單元聚合有關(guān)。BBMN68_1004、BBMN68_1008和BBMN68_1009參與糖基轉(zhuǎn)移。BMN68_1010控制多糖分子鏈長。BBMN68_1012編碼胞外多糖合成的關(guān)鍵酶——引導(dǎo)糖基轉(zhuǎn)移酶(priming glycosyltransferase,Cps D),啟動(dòng)合成胞外多糖第1步。由Cps D基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹,BBMN68與猿猴、狨猴及大猩猩的長雙歧桿菌同枝,可能是飲食影響腸道細(xì)菌進(jìn)化的結(jié)果。結(jié)論:本研究結(jié)果為解析長雙歧桿菌BBMN68胞外多糖生物合成途徑和調(diào)控機(jī)制奠定了理論基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective: to study the biosynthesis pathway and regulation mechanism of BBMN68 exopolysaccharide from Bifidobacterium longii. Methods: extracellular polysaccharides of BBMN68 were extracted, protein function of eps gene cluster was predicted, and key genes were cloned and analyzed. Results: on CDM and MRSC medium, BBMN68 produced extracellular polysaccharides with the yield of 100 mg/L and 400 mg/L., respectively. The whole genome sequence was sequenced by our laboratory staff. According to the whole genome sequence, the eps gene cluster was obtained. It is found that BBMN681002 encodes a protein. BBMN681003 / BBMN681003 / BBMN681006 BBMN686BBMN681007 and BMN68_1011 are associated with polysaccharide repeat unit polymerization. BBMN684BBMN681008 and BBMN68_1009 participate in glycosyl transfer. BMN681010 control polysaccharides. Molecular chain length. BBMN681012 encodes the key enzyme of extracellular polysaccharide synthesis-leading glycosyltransferase (priming glycosyltransferase,Cps D),) to initiate the synthesis of extracellular polysaccharides. BBMN68, a phylogenetic tree constructed from Cps D gene, shares the same branch with bifidobacteria in apes, marmosets and gorillas, which may be the result of diet affecting the evolution of intestinal bacteria. Conclusion: this study provides a theoretical basis for elucidating the biosynthesis pathway and regulation mechanism of BBMN68 exopolysaccharide in Bifidobacterium longiferi.
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與營養(yǎng)工程學(xué)院食品質(zhì)量與安全北京實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:中央在京高校重大成果轉(zhuǎn)化項(xiàng)目 國家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(2011AA100903)
【分類號(hào)】:Q811.4;TS201.3

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