發(fā)布時間：2018-08-02 19:22

【摘要】：氨酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase,aaRS)是蛋白質(zhì)生物合成中的關(guān)鍵酶,能夠催化特定的氨基酸和相應(yīng)tRNA結(jié)合。為了研究八肋游仆蟲氨酰-tRNA合成酶(Euplotes octocarinatus aminoacyl-tRNA synthetase,EoaaRS)基因的種類、數(shù)目、結(jié)構(gòu)及起源,本研究利用生物信息學(xué)方法,對八肋游仆蟲大核基因組編碼的aaRS進(jìn)行了系統(tǒng)分析。結(jié)果表明,八肋游仆蟲大核基因組共包含45個aaRS基因,可編碼20種不同的aaRS蛋白。其中,Eo GlnRS和Eo AlaRS僅由1個基因編碼,其余EoaaRS均由多個基因編碼。亞細(xì)胞定位分析顯示,僅8個EoaaRS具有線粒體導(dǎo)肽,對應(yīng)于6種EoaaRS。此外,基于核酸序列分析顯示,多個EoaaRS在翻譯過程中需要發(fā)生編程性核糖體移碼,才能形成結(jié)構(gòu)完整的蛋白質(zhì)產(chǎn)物。結(jié)構(gòu)域分析表明,部分EoaaRS存在特殊結(jié)構(gòu)域,暗示其可能具有氨�；酝獾男鹿δ�。進(jìn)化分析揭示,2個Eo GlyRS起源于古菌,而2個Eo LysRS起源于細(xì)菌。本研究為后續(xù)探討低等真核生物aaRS的結(jié)構(gòu)與功能奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Aminoacyl-tRNA synthetic tRNA synthase (aminoacyl-tRNA synthetic tRNA synthase) is a key enzyme in protein biosynthesis, which can catalyze the binding of specific amino acids to corresponding tRNA. In order to study the species, number, structure and origin of the (Euplotes octocarinatus aminoacyl-tRNA synthetic tRNA synthase (Euplotes octocarinatus aminoacyl-tRNA) gene, a bioinformatics method was used to systematically analyze the aaRS encoding the large nucleus genome of EoaRS. The results showed that there were 45 aaRS genes encoding 20 different aaRS proteins. Among them, Eo GlnRS and Eo AlaRS are encoded by only one gene, and the rest of EoaaRS are encoded by multiple genes. Subcellular localization analysis showed that only 8 EoaaRS had mitochondrial conductors corresponding to 6 Eoa RSs. In addition, nucleic acid sequence analysis shows that multiple EoaaRS require programmed ribosomal frameshift in order to form a complete protein product. Domain analysis shows that some EoaaRS have special domains, suggesting that they may have new functions other than aminoacylation. Evolutionary analysis revealed that two Eo GlyRS originated from ancient bacteria and two Eo LysRS originated from bacteria. This study laid a foundation for further study on the structure and function of low eukaryote aaRS.
【作者單位】： 山西大學(xué)生物技術(shù)研究所化學(xué)生物學(xué)與分子工程教育部重點實驗室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.31372199)資助項目~~
【分類號】：Q55;Q78

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本文編號：2160477