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致病疫霉ATP6基因單倍型與地理因素的相關(guān)性分析

發(fā)布時(shí)間:2018-07-14 15:07
【摘要】:致病疫霉(Phytophthora infestans)是馬鈴薯晚疫病的病原菌,對(duì)世界馬鈴薯的生產(chǎn)造成嚴(yán)重影響。ATP6編碼ATP合酶α亞基的第6個(gè)亞單位,對(duì)ATP合酶的功能及生物的生存生殖至關(guān)重要。本研究對(duì)來自我國7個(gè)群體140株馬鈴薯晚疫病菌的ATP6基因進(jìn)行核苷酸序列及其遺傳結(jié)構(gòu)和地理因素(海拔、經(jīng)度和年平均氣溫)的相關(guān)分析。結(jié)果表明:7個(gè)群體中只有2種單倍型Hapl-1和Hapl-2,其中Hapl-1在群體中所占比例與當(dāng)?shù)氐暮0纬曙@著正相關(guān),與年平均氣溫和經(jīng)度呈顯著負(fù)相關(guān),而Hapl-2在群體中的比例與當(dāng)?shù)氐暮0、年平均氣溫和?jīng)度的相關(guān)正好與Hapl-1相反。群體間的遺傳分化度(FST)與群體間直線距離呈顯著正相關(guān)(r=0.659,P=0.001)。本研究表明,馬鈴薯致病疫霉ATP6基因單倍型分布和群體地理因素之間具有顯著相關(guān)關(guān)系,該結(jié)果為了解致病疫霉的進(jìn)化趨勢(shì)和致病疫霉的防治提供了理論依據(jù)。
[Abstract]:Phytophthora infestans (Phytophthora infestans) is the pathogen of potato late blight. It has a serious effect on the production of potato in the world. ATP-6 encodes the sixth subunit of ATP-synthase 偽 subunit, which is very important to the function of ATP-synthase and the survival and reproduction of organisms. In this study, the nucleotide sequence, genetic structure and geographical factors (altitude, longitude and annual mean air temperature) of ATPase 6 gene from 140 strains of potato late blight in 7 populations in China were analyzed. The results showed that there were only two haplotypes Hapl-1 and Hapl-2 in the seven populations. The proportion of Hapl-1 in the population was positively correlated with the local altitude, and negatively correlated with the annual mean temperature and longitude, while the proportion of Hapl-2 in the population was significantly correlated with the local altitude. The correlation between annual mean temperature and longitude is the opposite of Hapl-1. The genetic differentiation degree (FST) among populations was positively correlated with the linear distance between populations (r = 0.659). This study showed that there was a significant correlation between the haplotype distribution and population geographical factors of ATP-6 gene in Phytophthora spp. The results provided a theoretical basis for understanding the evolutionary trend of Phytophthora disease and the prevention and control of Phytophthora disease.
【作者單位】: 福建農(nóng)林大學(xué)植物病毒研究所/福建省植物病毒學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【基金】:國家馬鈴薯產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(編號(hào):CARS-10) 福建省自然科學(xué)基金(編號(hào):2016J01111)
【分類號(hào)】:S435.32

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本文編號(hào):2122036

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