梅花鹿鹿茸尖端組織Tβ-4基因全長(zhǎng)cDNA的分離與生物信息學(xué)分析
本文選題:鹿茸 + 胸腺素β; 參考:《野生動(dòng)物學(xué)報(bào)》2017年02期
【摘要】:胸腺素β4(Thymosinβ4,Tβ-4)是真核生物細(xì)胞中的一種具有多重生物學(xué)功能的肌動(dòng)蛋白螯合分子。本研究首次從梅花鹿鹿茸尖端組織全長(zhǎng)cDNA文庫中成功克隆了Tβ-4基因的全長(zhǎng)cDNA序列,并結(jié)合生物信息學(xué)方法對(duì)該基因的氨基酸序列進(jìn)行了分析。結(jié)果表明,梅花鹿Tβ-4基因cDNA全長(zhǎng)為770 bp,編碼44個(gè)氨基酸,相對(duì)分子質(zhì)量為5 052.65 u,理論等電點(diǎn)為5.02,其一級(jí)結(jié)構(gòu)中賴氨酸和谷氨酸殘基所占比例最高,二級(jí)結(jié)構(gòu)元件主要以α-螺旋和無規(guī)則卷曲為主。結(jié)構(gòu)分析發(fā)現(xiàn),Tβ-4蛋白氨基酸序列含有"Thymosin family"結(jié)構(gòu)域,沒有N端信號(hào)肽,沒有跨膜區(qū)。同源序列分析表明,梅花鹿與白頰長(zhǎng)臂猿、人、牛的親緣關(guān)系較近,氨基酸同源性高于85%。Tβ-4在鹿茸尖端組織全長(zhǎng)cDNA文庫中高豐度表達(dá),提示它可能在鹿茸生長(zhǎng)發(fā)育中起到重要調(diào)節(jié)作用。
[Abstract]:Thymosin 尾 4 (Thymosin 尾 4T 尾 -4) is an actin chelating molecule with multiple biological functions in eukaryotic cells. In this study, the full-length cDNA sequence of T 尾 -4 gene was cloned successfully from the full-length cDNA library of deer antler tip tissue in sika deer for the first time, and the amino acid sequence of this gene was analyzed by bioinformatics. The results showed that the full-length cDNA of T 尾 -4 gene of sika deer was 770bp, encoding 44 amino acids, the relative molecular weight was 5 052.65 u, the theoretical isoelectric point was 5.02, and the proportion of lysine and glutamate residues in the primary structure was the highest. The main components of secondary structure are 偽-helix and irregular crimp. The amino acid sequence of T 尾 -4 protein contained "Thymosin family" domain, no N-terminal signal peptide and no transmembrane region. Homologous sequence analysis showed that sika deer was closely related to gibbon, human and cattle, and the amino acid homology was higher than 85.T 尾 -4 in the full-length cDNA library of pilose antler tip tissue. These results suggest that it may play an important role in the growth and development of velvet antler.
【作者單位】: 東北林業(yè)大學(xué);
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31271324) 中央高;究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項(xiàng)資金資助(2572014EA05-03;2572015CA18)
【分類號(hào)】:S825
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