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SOCS1基因多態(tài)性與四川涼山地區(qū)彝族人群肺結(jié)核易感風(fēng)險(xiǎn)的遺傳關(guān)聯(lián)性研究

發(fā)布時(shí)間:2018-07-04 23:33

  本文選題:結(jié)核病 + 肺結(jié)核。 參考:《第三軍醫(yī)大學(xué)》2017年碩士論文


【摘要】:背景結(jié)核病(Tuberculosis,TB)是由結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,M.tb)感染所引起的慢性傳染病,長(zhǎng)期以來(lái)嚴(yán)重危害人類(lèi)身心健康。根據(jù)2016年WHO全球結(jié)核病大會(huì)報(bào)告:2015年全球大約新增1040萬(wàn)例結(jié)核病患者,大約有140萬(wàn)人因罹患結(jié)核病而死亡。M.tb主要侵及人體肺部,肺結(jié)核(Pulmonary Tuberculosis,PTB)約占所有結(jié)核病的80-90%,因此,研究肺結(jié)核對(duì)防治結(jié)核病意義重大。隨著精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)、個(gè)體化醫(yī)療和“4P”醫(yī)學(xué)模式等新醫(yī)學(xué)理念的提出,以及全基因組關(guān)聯(lián)分析的興起,宿主基因多態(tài)性與疾病易感性的關(guān)聯(lián)性研究越來(lái)越流行。單核苷酸多態(tài)性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNP)是指在基因組DNA水平上由于單個(gè)核苷酸的變異而產(chǎn)生的一種遺傳多態(tài)性。SNP數(shù)量眾多,分布廣泛,且便于醫(yī)學(xué)研究。全球約有1/3的人口曾感染過(guò)M.tb,但只有5%-10%的M.tb感染者轉(zhuǎn)變成臨床ATB。目前已有研究報(bào)道宿主HLA、NRAMP1、TLR、SP110、VDR等基因單核苷多態(tài)性與肺結(jié)核的易感風(fēng)險(xiǎn)具有關(guān)聯(lián)性。并且,不同地區(qū)、不同種族、不同人群的易感基因及其SNP位點(diǎn)均存在顯著性差異。涼山彝族有300多萬(wàn)人口,涼山彝族自治州是是我國(guó)結(jié)核病高發(fā)地區(qū),但是有關(guān)肺結(jié)核的易感基因及其相應(yīng)SNP位點(diǎn)的關(guān)聯(lián)性研究目前主要集中在新疆維吾爾族、新疆哈薩克族、西藏藏族、海南黎族等,而有關(guān)涼山彝族人群肺結(jié)核易感基因及其SNP的關(guān)聯(lián)性研究尚未見(jiàn)報(bào)道。SOCS1基因?qū)儆诜荋LA類(lèi)基因,細(xì)胞因子信號(hào)傳導(dǎo)抑制因子1(suppressor of cytokine signaling 1,SOCS1)是M.tb感染時(shí)機(jī)體巨噬細(xì)胞中調(diào)節(jié)細(xì)胞因子JAK/STAT信號(hào)通路的關(guān)鍵分子。巨噬細(xì)胞凋亡是機(jī)體清除M.tb感染的重要途徑,SOCS1參與機(jī)體結(jié)核感染時(shí)早期分泌蛋白ESAT-6介導(dǎo)的巨噬細(xì)胞凋亡過(guò)程[25]。SOCS1在肺結(jié)核患者PBMC、T淋巴細(xì)胞和M.tb感染所致的炎性淋巴結(jié)均表達(dá)上調(diào)[21,22,43],且SOCS1基因的差異性表達(dá)對(duì)鑒別ATB和LTB具有輔助診斷價(jià)值[23]。此外,SOCS1基因SNP已經(jīng)與慢性HBV感染[32]、牙周炎[29]等感染性疾病做了關(guān)聯(lián)性分析,但與肺結(jié)核易感風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性分析未見(jiàn)報(bào)道,并且SOCS1基因TagSNP rs243327、rs33932899等多態(tài)位點(diǎn)可能影響SOCS1基因表達(dá)水平,進(jìn)而影響機(jī)體巨噬細(xì)胞凋亡、IFN-γ產(chǎn)生等抗M.tb感染過(guò)程。研究SOCS1基因多態(tài)性與涼山彝族肺結(jié)核易感風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性對(duì)該地區(qū)結(jié)核病防控有重要意義。目的探討SOCS1基因的兩個(gè)標(biāo)簽單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)-3969C/T(rs243327)、+1125G/C(rs33932899)與涼山彝族人群肺結(jié)核易感風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性。方法采用病例-對(duì)照研究。選取2015年3月至2016年6月在涼山州傳染病醫(yī)院初次收治住院的彝族肺結(jié)核患者304例(肺結(jié)核組),同期選取310例彝族健康人(健康對(duì)照組)。以與M.tb感染相關(guān)的SOCS1基因?yàn)楹蜻x基因,選擇-3969 C/T(rs243327)和+1125G/C(rs33932899)為SOCS1的TagSNP,采用PCR擴(kuò)增聯(lián)合測(cè)序法對(duì)2個(gè)TagSNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,應(yīng)用Hardy-Weinberg遺傳平衡定律檢測(cè)所選樣本的群體代表性,采用Mann-Whitney U檢驗(yàn)比較肺結(jié)核組和健康對(duì)照組之間的年齡差異,采用四格表X~2檢驗(yàn)比較兩組之間性別、有無(wú)吸煙史的分布差異,采用X~2檢驗(yàn)和非條件Logistic回歸分析比較兩組之間基因型和等位基因頻率分布差異,并在共顯性模型、顯性模型、隱性模型、超顯性模型和加性模型等5種遺傳模型中對(duì)SOCS1基因的2個(gè)TagSNP位點(diǎn)進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析。結(jié)果1、本課題共隨機(jī)選取涼山彝族肺結(jié)核患者304例,平均年齡為35.83±16.22歲,男性比例為65.79%;共招募涼山彝族健康人310例,平均年齡為38.72±13.15歲,男性比例為60.64%。性別、年齡分布在兩組之間無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P=0.186,P=0.224),表明性別、年齡與涼山彝族人群肺結(jié)核易感風(fēng)險(xiǎn)無(wú)相關(guān)性。在肺結(jié)核組中,痰涂片抗酸染色陽(yáng)性率為31.90%,PTB與AIDS/HIV聯(lián)合感染率為22.69%,PTB合并肺外結(jié)核率為56.90%。2、采用PCR-直接測(cè)序法對(duì)SOCS1基因TagSNP rs243327、rs33932899位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,成功率為100%。rs243327存在等位基因C/T單核苷酸多態(tài)性。rs33932899存在等位基因G/C單核苷酸多態(tài)性。rs243327、rs33932899分別在肺結(jié)核組和健康對(duì)照組中的基因型頻率分布均符合哈迪-溫伯格遺傳平衡定律(rs243327:P=0.070,P=0.229;rs33932899:P=0.869,P=0.109)。3、在SOCS1基因TagSNP rs243327位點(diǎn)處,涼山彝族人群肺結(jié)核組CC基因型頻率顯著高于健康對(duì)照組(CC vs CT:X~2=4.248,OR=1.449,95%CI=1.018-2.063,P=0.039;CC vs CT+TT:X~2=5.179,OR=1.472,95%CI=1.54-1.056,P=0.023;在加性模型中把基因型CC、CT、TT分別賦值為1、2、3做非條件Logistic回歸分析:OR=0.649,95%CI=0.433-0.973,P=0.037),C等位基因頻率亦顯著高于健康對(duì)照組(C vs T:X~2=5.343,OR=1.391,95%CI=1.051-1.841,P=0.021)。4、在SOCS1基因TagSNP rs33932899位點(diǎn)處,基因型和等位基因分布在肺結(jié)核組和健康對(duì)照組之間均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(GG vs GC:X~2=0.031,OR=1.031,95%CI=0.730-1.456,P=0.861;GG vs CC:X~2=2.595,OR=1.856,95%CI=0.866-3.986,P=0.107;GG vs GC vs CC:X~2=2.601,P=0.272;GG+GC vs CC:X~2=2.570,OR=1.837,95%CI=0.865-3.902,P=0.109;GG vs GC+CC:X~2=0.429,OR=1.116,95%CI=0.803-1.551,P=0.513;GC vs GG+CC:X~2=0.006,OR=1.013,95%CI=0.721-1.425,P=0.939;在加性模型中把GG、GC、CC分別賦值為1、2、3做非條件Logistic回歸分析:OR=1.181,95%CI=0.786-1.774,P=0.422;等位基因G vs C:X~2=1.349,OR=1.178,95%CI=0.893-1.553,P=0.245)。5、吸煙是肺結(jié)核易感風(fēng)險(xiǎn)的獨(dú)立危險(xiǎn)因素。有吸煙史與涼山地區(qū)彝族人群肺結(jié)核的易感風(fēng)險(xiǎn)具有顯著相關(guān)性(X~2=16.982,OR=2.010,95%CI=1.439-2.808,P=0.000),涼山彝族有吸煙史人群罹患肺結(jié)核的風(fēng)險(xiǎn)是無(wú)吸煙史人群的2.010倍。結(jié)論本研究在涼山彝族人群中首次驗(yàn)證SOCS1基因多態(tài)性與肺結(jié)核易感風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)性,研究發(fā)現(xiàn)SOCS1基因TagSNP rs243327與涼山彝族人群肺結(jié)核的易感風(fēng)險(xiǎn)具有顯著相關(guān)性,CC基因型會(huì)增加涼山彝族人群肺結(jié)核的易感風(fēng)險(xiǎn),可能是肺結(jié)核的易感基因型;C等位基因會(huì)增加涼山地區(qū)彝族人群肺結(jié)核的易感風(fēng)險(xiǎn),可能是肺結(jié)核的易感等位基因。然而,SOCS1基因TagSNP rs33932899可能與涼山彝族人群肺結(jié)核的易感風(fēng)險(xiǎn)無(wú)關(guān)聯(lián)性。目前的研究結(jié)果為進(jìn)一步研究SOCS1基因TagSNP rs243327不同等位基因C和T對(duì)SOCS1基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的調(diào)控機(jī)制奠定了理論基礎(chǔ),也為預(yù)測(cè)肺結(jié)核的易感風(fēng)險(xiǎn)、提高肺結(jié)核的診治水平奠定了理論基礎(chǔ),有可能尋找到一種新的預(yù)測(cè)和診治肺結(jié)核的分子標(biāo)志物。
[Abstract]:鑳屾櫙緇撴牳鐥,

本文編號(hào):2097939

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