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蓖麻3個PIP基因的克隆與冷脅迫下的表達(dá)分析

發(fā)布時間:2024-10-17 13:00
   植物水通道蛋白參與水分快速跨膜運輸、調(diào)節(jié)植物體內(nèi)的養(yǎng)分轉(zhuǎn)運、種子萌發(fā)、側(cè)根生長等多種生理過程。本研究以蓖麻(Ricinus communis)自交系'通蓖5號'葉片為材料,設(shè)計特異性引物,采用RT-PCR技術(shù)成功克隆3個水通道蛋白基因的開放閱讀框(ORFs),分別命名為蓖麻質(zhì)膜內(nèi)源蛋白基因1;3 (Ricinus communis plasma membrane intrinsic proteins genes 1; 3, RcPIP1; 3)(Gen Bank No. MT068547)、RcPIP2; 1(Gen Bank No. MT068546)和RcPIP2;2 (Gen Bank No. MT068545)。生物信息學(xué)分析表明3個基因均包含4個外顯子和3個內(nèi)含子,編碼蛋白含有6個跨膜螺旋和主要內(nèi)源蛋白(major intrinsic proteins, MIPs)超家族特有的2個NPA (Asn-Pro-Ala)基序。多重序列比對表明RcPIP1;3與楊樹(Populus tremula) Pt PIP1;3的相似性高達(dá)92.36%;RcPIP2;1、RcPIP2;2分別與...

【文章頁數(shù)】:10 頁

【部分圖文】:

圖1RcPIP1;3(A)、RcPIP2;1(B)、RcPIP2;2(C)基因的ORFs擴(kuò)增

圖1RcPIP1;3(A)、RcPIP2;1(B)、RcPIP2;2(C)基因的ORFs擴(kuò)增

PlantCARE在線預(yù)測了RcPIP1;3、RcPIP2;1與RcPIP2;2啟動子區(qū)的順式作用元件(表2)。預(yù)測顯示RcPIP1;3、RcPIP2;1與RcPIP2;2均具有響應(yīng)光照、赤霉素誘導(dǎo)與調(diào)控組織生長的順式作用元件,暗示該基因具有調(diào)節(jié)生長發(fā)育的潛在功能;....


圖2RcPIP1;3、RcPIP2;1和RcPIP2;2基因結(jié)構(gòu)分析

圖2RcPIP1;3、RcPIP2;1和RcPIP2;2基因結(jié)構(gòu)分析

圖1RcPIP1;3(A)、RcPIP2;1(B)、RcPIP2;2(C)基因的ORFs擴(kuò)增2.3RcPIP1;3、RcPIP2;1、RcPIP2;2序列及結(jié)構(gòu)分析


圖3RcPIP1;3、RcPIP2;1與RcPIP2;2跨膜結(jié)構(gòu)域分析

圖3RcPIP1;3、RcPIP2;1與RcPIP2;2跨膜結(jié)構(gòu)域分析

為探索RcPIP1;3、RcPIP2;1與RcPIP2;2是否響應(yīng)低溫脅迫,本探究采用qRT-PCR的方法檢測該基因受冷脅迫(4℃)0、2、6、8h的表達(dá)情況(圖7),結(jié)果發(fā)現(xiàn),冷處理后RcPIP1;3、RcPIP2;2基因均上調(diào)表達(dá),RcPIP2;1下調(diào)表達(dá)。....


圖4RcPIP1;3、RcPIP2;1與RcPIP2;2保守區(qū)預(yù)測

圖4RcPIP1;3、RcPIP2;1與RcPIP2;2保守區(qū)預(yù)測

圖3RcPIP1;3、RcPIP2;1與RcPIP2;2跨膜結(jié)構(gòu)域分析3討論



本文編號:4008040

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