煙草NtCIPK2基因的克隆及表達分析
本文選題:煙草 + NtCIPK。 參考:《浙江農(nóng)業(yè)學報》2017年10期
【摘要】:CIPK(CBL-interacting protein kinase)是一類具有生物活性的絲/蘇氨酸蛋白激酶,通過與類鈣調(diào)神經(jīng)素B亞基蛋白(Calcineurin B-like protein,CBL)相互作用從而調(diào)節(jié)植物在適應或抵制非生物逆境脅迫中的生理活動;谕葱蛄锌寺煵軰326中Nt CIPK2基因c DNA全長,采用q RT-PCR分析Nt CIPK2的組織及逆境脅迫下特異性表達。結(jié)果表明,該基因全長1 341 bp,編碼446個氨基酸殘基,預測分子量為50.3 ku,等電點為8.90。同源性分析結(jié)果顯示,該蛋白與絨毛狀煙草(Nicotiana tomentosiformis)CIPK2有95%的同源性,故命名為Nt CIPK2。生物信息學分析表明,該蛋白是一個親水蛋白,其N端含有活化環(huán)結(jié)構(gòu)域S_TKc,C端含有調(diào)節(jié)結(jié)構(gòu)域CIPK-C,可能定位在質(zhì)膜。組織表達分析發(fā)現(xiàn),該基因在煙草根、莖、葉、花中均有表達,其中莖中表達量最高。逆境脅迫試驗表明,該基因受低鉀、高鹽、干旱、H2O2和ABA誘導,參與煙草非生物逆境脅迫的響應。
[Abstract]:Cipk (CBL-interacting protein kinase) is a kind of biologically active silk / threonine protein kinase, which regulates the physiological activities of plants in adapting to or resisting abiotic stress by interacting with Calcineurin B subunit protein (CBL). The full-length cDNA of Nt-CIPK2 gene was cloned from tobacco K326 based on homologous sequence, and the specific expression of Nt-CIPK2 in tissue and under stress was analyzed by qRT-PCR. The results showed that the total length of the gene was 1 341 BP, encoding 446 amino acid residues, the predicted molecular weight was 50.3 kuand and the isoelectric point was 8.90. The result of homology analysis showed that the protein had 95% homology with Nicotiana tomentosiformis CIPK2, so it was named NT CIPK2. Bioinformatics analysis showed that the protein was a hydrophilic protein, and the N-terminal of the protein contained the activated ring domain (SSP), which contained the regulatory domain CIPK-C, which may be located in the plasma membrane. Tissue expression analysis showed that the gene was expressed in the roots, stems, leaves and flowers of tobacco, and the highest expression was found in the stems. The stress test showed that the gene was induced by low potassium, high salt, H2O2 and ABA, and was involved in the response to abiotic stress in tobacco.
【作者單位】: 四川農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學院;
【基金】:植物生理學與生物化學國家重點實驗室開放課題(SKLPPBKF 1505,SKLPPBKF 1506)
【分類號】:Q943.2;S572
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