本文選題：森林草莓 + 去乙�；��。� 參考：《南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報》2017年02期

【摘要】：[目的]本研究對森林草莓中組蛋白去乙�；富�(HDAC)進(jìn)行鑒定和分析,并研究其在生長發(fā)育以及逆境脅迫響應(yīng)過程中的表達(dá)變化,為深入研究森林草莓組蛋白去乙�；{(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。[方法]運(yùn)用生物信息學(xué)方法,對森林草莓中HDAC基因進(jìn)行鑒定,并進(jìn)行蛋白結(jié)構(gòu)域、染色體定位、基因復(fù)制類型和其他進(jìn)化分析。利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析森林草莓中HDAC基因在不同組織和發(fā)育階段中的表達(dá)變化。運(yùn)用實時熒光定量PCR對森林草莓中HDAC基因在低溫、高溫脅迫下的表達(dá)變化進(jìn)行分析。[結(jié)果]森林草莓中包含12個HDAC基因,其中RPD3/HDA1家族9個,SIR2家族2個,HD2家族1個;RPD3/HDA1家族基因可以分為5類,SIR2家族中基因分為2類。森林草莓中RPD3/HDA1和HD2家族HDAC基因主要通過離散型復(fù)制模式進(jìn)行擴(kuò)張,SIR2家族在雙子葉進(jìn)化過程中沒有發(fā)生明顯擴(kuò)張。各個HDAC基因具有發(fā)育階段或組織特異性表達(dá)。部分HDAC基因在森林草莓熱脅迫處理中有不同程度的響應(yīng),對冷脅迫的反應(yīng)相對較小。[結(jié)論]森林草莓HDAC基因具有植物的典型特性,并可能參與了森林草莓的生長發(fā)育和對熱脅迫的響應(yīng)。
[Abstract]:[objective] to identify and analyze histone deacetylase gene (HDAC) in forest strawberry, and to study its expression changes during growth and stress response. It lays a foundation for further study on the regulation mechanism of deacetylation of forest strawberry histone. [methods] the HDAC gene in forest strawberry was identified by bioinformatics, and protein domain, chromosome location, gene replication type and other evolutionary analysis were carried out. Transcriptional data were used to analyze the expression of HDAC gene in different tissues and development stages of forest strawberry. The changes of HDAC gene expression in forest strawberry under low temperature and high temperature stress were analyzed by real-time fluorescence quantitative PCR. [results] there were 12 HDAC genes in the forest strawberry. Among them, 9 genes of RPD 3 / HDA1 family, 9 SIR2 family, 2 HD2 family, 1 RPD 3 / HDA1 family gene can be divided into 5 types of SIR2 gene. The RPD3 / HDA1 and HD2 HDAC genes in forest strawberry were mainly expanded by discrete replication model. The SIR2 family did not expand significantly during the evolution of dicotyledon. Each HDAC gene has a developmental stage or tissue specific expression. Some of the HDAC genes responded to different degrees of heat stress in forest strawberry, but the response to cold stress was relatively small. [conclusion] the HDAC gene of forest strawberry has typical plant characteristics and may be involved in the growth and development of forest strawberry and its response to heat stress.
【作者單位】： 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳與種質(zhì)創(chuàng)新國家重點(diǎn)實驗室/園藝學(xué)院;
【基金】：中央高�；究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)自主創(chuàng)新重點(diǎn)項目(KYZ201605) 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)SRT項目(1514A04)
【分類號】：S668.4

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 Courtney Hollende;;Histone Deacetylase Genes in Arabidopsis Development[J];Journal of Integrative Plant Biology;2008年07期

【共引文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 林瑩;韓玉輝;熊思嘉;李澤斌;張欣;顧婷婷;;森林草莓組蛋白去乙酰化酶基因的鑒定和分析[J];南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報;2017年02期

2 肖振;趙琪;張川芳;王小麗;王全華;戴紹軍;;蛋白質(zhì)組學(xué)研究揭示的甘藍(lán)型油菜非生物脅迫應(yīng)答機(jī)制[J];植物科學(xué)學(xué)報;2016年06期

3 董亞茹;杜建勛;陳傳杰;趙東曉;王照紅;;組蛋白去乙�；�(HDACs)及其在植物中的作用[J];生物技術(shù)通報;2016年09期

4 劉超;李開隆;劉春娟;馬旭俊;;毛果楊HDA902基因的克隆、序列分析和亞細(xì)胞定位[J];分子植物育種;2016年05期

5 蘇魯方;汪難聰;熊澤洋;周蔓;;植物蛋白乙�；�/去乙�；c代謝和基因表達(dá)調(diào)控研究進(jìn)展[J];江漢大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2016年06期

6 Chizuko Yamamuro;Jian-Kang Zhu;Zhenbiao Yang;;Epigenetic Modifications and Plant Hormone Action[J];Molecular Plant;2016年01期

7 李濤;蘇慧慧;黎振興;李植良;徐小萬;;植物組蛋白去乙酰化酶生物學(xué)功能研究進(jìn)展[J];分子植物育種;2015年12期

8 毛昱力;張冰;馬旭俊;;組蛋白去乙�；敢种苿┱T導(dǎo)毛果楊不定芽的再生[J];林業(yè)科技;2015年05期

9 李淑娟;張超;張彥妮;董亞茹;馬旭俊;;毛果楊HDAC基因家族序列及其表達(dá)分析[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2015年03期

10 鐘理;楊春燕;吳佳海;;組蛋白去乙�；�(HDACs)及其調(diào)控的研究進(jìn)展[J];中國農(nóng)學(xué)通報;2014年21期

【相似文獻(xiàn)】

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1 王靜;趙密珍;王壯偉;吳偉民;錢亞明;;森林草莓精氨酸脫羧酶基因的電子克隆與序列分析[J];江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報;2011年03期

2 ;[J];;年期

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1 尹歡;葡萄bHLH與森林草莓NBS-LRR基因的全基因組分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

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本文編號：2062034