不同氮處理茶樹實時定量PCR內(nèi)參基因篩選和驗證
本文選題:茶樹 + 內(nèi)參基因。 參考:《茶葉科學(xué)》2016年01期
【摘要】:為篩選不同氮處理下茶樹(Camellia sinensis)實時熒光定量PCR(q RT-PCR)試驗體系中最佳內(nèi)參基因,以茶樹幼葉、成熟葉和幼根為材料,應(yīng)用qRT-PCR分析GAPDH、18S rRNA、β-actin、RPL13、a-tubulin、Ru BP等6個內(nèi)參基因在不同氮濃度和氮源處理下的表達(dá)變化,借助GeNorm和NormFinder程序?qū)蜻x內(nèi)參基因穩(wěn)定性進行評價。結(jié)果表明,在不同氮濃度和氮源處理下,GAPDH、b-actin和RPL13表達(dá)穩(wěn)定性較好,GAPDH+β-actin組合穩(wěn)定性最佳,可用作茶樹基因表達(dá)研究的內(nèi)參基因;而a-tubulin和RuBP表達(dá)穩(wěn)定性較差,不適合做內(nèi)參基因。為進一步證實上述結(jié)果,分別以GAPDH、a-tubulin、GAPDH+β-actin組合為內(nèi)參基因,分析茶樹幼葉中硝酸根轉(zhuǎn)運蛋白基因(CsNRT1.2)和銨根轉(zhuǎn)運蛋白基因(Cs AMT1.1)的表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)以GAPDH和GAPDH+β-actin組合為內(nèi)參基因時,目的基因的相對表達(dá)量隨處理時間延長變化規(guī)律基本一致;而以a-tubulin為內(nèi)參基因時,目的基因的變化規(guī)律與前兩者存在明顯差別。因此,根據(jù)特定試驗體系選擇合適的內(nèi)參基因?qū)τ趒RT-PCR定量結(jié)果的準(zhǔn)確性和可靠性具有重要意義。
[Abstract]:In order to screen the best internal reference genes of tea Camellia sinensis (Camellia sinensis) real-time fluorescence quantitative PCR system, the young leaves, mature leaves and young roots of tea plants were used as materials. QRT-PCR was used to analyze the expression changes of six internal reference genes GAPDHN 18s rRNAand 尾 -actinus RPL13a tubulin Ru BP under different nitrogen concentration and nitrogen source treatment. The stability of candidate internal reference genes was evaluated by GeNorm and Norm Finder program. The results showed that the combination of GAPDH 尾 -actin and GAPDH 尾 -actin had the best stability under different nitrogen concentration and nitrogen source treatment, but the expression stability of a-tubulin and RuBP was poor, so it was not suitable to be used as internal reference gene. In order to confirm the above results, GAPDH 尾 -actin combinations were used as internal reference genes, respectively. The expression levels of nitrate transporter gene (CsNRT1.2) and ammonium transporter gene (Cs AMT1.1) in young tea leaves were analyzed. It was found that when GAPDH and GAPDH 尾 -actin combinations were used as internal reference genes, GAPDH and GAPDH 尾 -actin combinations were used as internal reference genes. The relative expression of the target gene was basically consistent with the treatment time, but when a-tubulin was used as the internal reference gene, the change rule of the target gene was obviously different from the former two. Therefore, it is important for the accuracy and reliability of the quantitative results of qRT-PCR to select the appropriate internal reference gene according to the specific test system.
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所國家茶樹改良中心;
【基金】:浙江省茶樹農(nóng)業(yè)新品種選育重大科技專項(2012C12905) 國家茶葉產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(nycytx-23)
【分類號】:S571.1
【共引文獻】
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2 張力維;李勇鵬;姚瑤;梁優(yōu);杜麗;;香樟延伸因子EF1a基因片段的克隆及表達(dá)分析[J];中南林業(yè)科技大學(xué)學(xué)報;2015年05期
3 田云芳;蔣素華;蘇金樂;崔波;;蕙蘭TUB基因片段的克隆與序列分析[J];中國農(nóng)學(xué)通報;2015年19期
4 秦曉藝;王杰;;杏鮑菇采后木質(zhì)化相關(guān)基因?qū)崟r定量PCR中內(nèi)參基因的選擇[J];西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2015年07期
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1 安雨;基于資源競爭和化感作用原理的柳枝稷生態(tài)適應(yīng)機制研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2014年
【二級參考文獻】
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1 高東;魏富剛;何霞紅;孟國成;刀麗云;朱有勇;;水稻OsCKX2基因表達(dá)實時熒光定量PCR檢測技術(shù)的建立[J];云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2010年03期
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1 陳開心;;茶樹起源在臨滄[J];茶業(yè)通報;2007年01期
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3 ;膠南茶樹越冬措施[J];中國茶葉;1972年07期
4 張春靜;;對華北地區(qū)引種茶樹的一點意見[J];植物雜志;1978年03期
5 虞富蓮;;山東茶樹引種現(xiàn)狀及其初步結(jié)果的分析[J];茶葉通訊;1980年01期
6 葉福才,黃添樹;冬季搭棚防凍溫室培育茶樹試驗初報[J];茶葉科學(xué)簡報;1981年02期
7 此本晴夫;劉醒群;;秋整枝對茶樹萌芽的影響[J];茶葉;1981年01期
8 吳英藩;;關(guān)于幼齡茶樹修剪新途徑的探討[J];茶業(yè)通報;1960年02期
9 施嘉藩;李家光;;茶樹修剪講座[J];茶葉科技簡報;1977年07期
10 В.В.Похлеькин;趙學(xué)仁;;茶樹的地理傳布[J];茶葉;1985年04期
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1 朱林;房婉萍;葉愛華;余梅;江昌俊;;植物硒代謝與茶樹硒營養(yǎng)研究進展[A];食品安全的理論與實踐——安徽食品安全博士科技論壇論文集[C];2005年
2 瞿花;陳起偉;;對保護永平縣古茶樹的思考[A];2012年云南農(nóng)業(yè)環(huán)境保護協(xié)會論文集[C];2012年
3 陳惠;岳輝英;;福建省茶樹生長的氣候適應(yīng)性[A];2005年泛珠三角氣象學(xué)術(shù)研討會論文選集[C];2005年
4 唐勁馳;趙超藝;黎健龍;唐顥;;茶豆間作對幼齡茶樹生長影響[A];2008茶學(xué)青年科學(xué)家論壇論文集[C];2008年
5 陳亮;;在后基因組時代,對茶樹功能基因組研究的思考[A];新觀點新學(xué)說學(xué)術(shù)沙龍文集13:茶與茶道的科學(xué)研究[C];2007年
6 范衛(wèi)東;顧衛(wèi)忠;;茶樹無心土育苗技術(shù)的初步研究[A];面向21世紀(jì)的科技進步與社會經(jīng)濟發(fā)展(上冊)[C];1999年
7 周萌;李友勇;孫雪梅;王家金;謝瑾;成浩;汪云剛;劉本英;;云南大茶樹遺傳多樣性的EST-SSR分析[A];第十五屆中國科協(xié)年會第20分會場:科技創(chuàng)新與茶產(chǎn)業(yè)發(fā)展論壇論文集[C];2013年
8 劉守安;韓寶瑜;;茶樹脂氧合酶(Cslox1)在酵母中的高效表達(dá)及酶學(xué)特性研究[A];中國茶葉科技創(chuàng)新與產(chǎn)業(yè)發(fā)展學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2009年
9 方金福;;潮州鳳凰茶區(qū)古茶樹見聞錄[A];中國生物學(xué)史暨農(nóng)學(xué)史學(xué)術(shù)討論會論文集[C];2003年
10 阮建云;;茶園和根際土壤鋁的動態(tài)及其對茶樹生長和養(yǎng)分吸收的影響[A];海峽兩岸茶葉科技學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2000年
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1 本報記者 熊玲;認(rèn)養(yǎng)古茶樹禍焉福焉?[N];云南日報;2004年
2 曹潘榮;茶樹的庭院栽培技術(shù)[N];廣東科技報;2001年
3 夏長元;茶樹冬管 沃土肥園[N];農(nóng)民日報;2001年
4 記者 徐永升 通訊員 哨音;喀喇沁旗試種茶樹取得階段性成功[N];內(nèi)蒙古日報(漢);2010年
5 見習(xí)記者 郭洋;濟南改善土壤才能種好茶樹[N];濟南日報;2011年
6 ;茶樹中微量元素不足[N];農(nóng)資導(dǎo)報;2014年
7 云南農(nóng)業(yè)大學(xué) 蔡新;茶樹的總發(fā)育周期[N];云南科技報;2008年
8 朱秀紅;小氣候?qū)Σ铇涞挠绊慬N];中國氣象報;2004年
9 省農(nóng)科院茶葉研究所 殷麗瓊;茶樹樹冠培養(yǎng)技術(shù)[N];云南科技報;2007年
10 記者 姜洪良 供稿;我國云南勐海首現(xiàn)“冬茶”[N];中國食品質(zhì)量報;2009年
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1 周坤;茶樹MADS-box家族B類基因CsGLO1和CsGLO2的克隆及其與C類基因CsAG的功能研究[D];陜西師范大學(xué);2015年
2 王茂香;日照市茶樹適生環(huán)境的自然區(qū)域劃分研究[D];山東師范大學(xué);2012年
3 孔海云;茶樹低溫光抑制發(fā)生的條件及遮蔭效應(yīng)研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年
4 洪永峰;河南省固始縣茶區(qū)茶樹生長的自然地理條件研究[D];廣西師范學(xué)院;2011年
5 高雪梅;果、茶樹對可溶性有機氮的吸收性能及其差異研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2013年
6 秦冰;茶樹硒代氨基酸的賦存形態(tài)及外源硒肥對其形態(tài)和含量影響的研究[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
7 段繼春;鋅對茶樹生長發(fā)育的影響及其與茶葉品質(zhì)關(guān)系的研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年
8 胡波;茶樹成花相關(guān)基因的cDNA克隆及生物信息學(xué)分析[D];福建農(nóng)林大學(xué);2010年
9 王林林;基于DEM的山東省茶樹優(yōu)生區(qū)氣候因子模擬[D];山東師范大學(xué);2007年
10 孫有豐;土壤濕度和氣溫對茶樹生長影響的研究[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年
,本文編號:2037161
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