本文選題：馴鹿 + IFNβ基因　； 參考：《中國畜牧獸醫(yī)》2017年12期

【摘要】：試驗旨在從馴鹿鹿茸頂端組織中克隆干擾素β1(interferon beta 1,IFNβ1)基因全長序列,分析其分子特性,為研究其生物學(xué)活性及實際應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫中牛、羊等近緣物種IFNβ1基因的保守序列設(shè)計1對引物,以馴鹿鹿茸頂端間充質(zhì)層組織基因組DNA為模板,采用PCR技術(shù)擴增得到馴鹿IFNβ1基因并克隆、測序,利用相關(guān)生物信息學(xué)軟件對該序列進行分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),馴鹿IFNβ1基因全長561bp,共編碼186個氨基酸,含有3個糖基化位點;其編碼蛋白含有4個α螺旋、4個β折疊區(qū)、7個β轉(zhuǎn)角。將馴鹿IFNβ1基因推導(dǎo)的氨基酸序列與其他14種哺乳動物進行遺傳進化分析發(fā)現(xiàn),其同源性為45.1%~92.0%;馴鹿與其他動物IFNβ1基因序列分析和系統(tǒng)進化樹分析表明,IFNβ1基因存在種屬差異性,親緣關(guān)系越近,同源性越高。本研究結(jié)果為馴鹿IFNβ1基因的進一步研究和應(yīng)用提供了基礎(chǔ)試驗數(shù)據(jù)。
[Abstract]:The aim of the experiment was to clone the full length sequence of interferon 尾 1(interferon beta 1 (IFN 尾 1) gene from the apical tissue of deer antler, and to analyze its molecular characteristics, and to lay a foundation for the study of its biological activity and practical application. According to the conserved sequence of IFN- 尾 1 gene of cattle, sheep and other related species in GenBank database, a pair of primers were designed. The reindeer IFN 尾 1 gene was amplified by PCR and cloned and sequenced. The sequence was analyzed by bioinformatics software. The results showed that the total length of IFN 尾 1 gene of reindeer was 561 BP, encoding 186 amino acids and containing 3 glycosylation sites, and the coding protein contained 4 偽 helix, 4 尾 folding regions and 7 尾 turning angles. The amino acid sequence derived from the IFN 尾 1 gene of reindeer was analyzed by genetic evolution analysis with 14 other mammals, the homology was 45.1 and 92.0, and the sequence analysis of IFN 尾 1 gene and phylogenetic tree analysis of reindeer and other animals showed that the IFN- 尾 1 gene of reindeer was different in species. The closer the relationship is, the higher the homology is. The results provide basic experimental data for further study and application of IFN 尾 1 gene in reindeer.
【作者單位】： 東北林業(yè)大學(xué)野生動物資源學(xué)院;
【基金】：國家林業(yè)局珍稀瀕危物種野外救護與繁育項目(2012) 中央高�；究蒲袠I(yè)務(wù)費專項資金項目(2572016AA42)
【分類號】：S825

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本文編號：2002977