發(fā)布時(shí)間：2018-06-06 16:43

  本文選題：戊型肝炎病毒 + 基因型��； 參考：《動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展》2017年03期

【摘要】：為了解廣西豬群中戊型肝炎病毒(HEV)基因型,利用套式RT-PCR用對南寧周邊豬場采集到的104份新鮮豬糞便進(jìn)行HEV檢測、分離并成功擴(kuò)增和克隆了11株陽性毒株的ORF2基因部分保守片段。序列測定結(jié)果表明,11株HEV ORF2序列自身核苷酸同源性為97.7%~100%,推導(dǎo)編碼的氨基酸同源性為97.9%~100%;與4型HEV代表毒株Ch-S-1、Ch-T11、swGX40等的核苷酸同源性為84.6%~90.6%,而與其他各型之間的同源性較低。系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹結(jié)果表明,11株HEV廣西株為基因4型,其中,10株HEV為4a亞型,1株毒株為4e亞型。結(jié)果表明,廣西豬群中流行的HEV均為基因4型,且以4a亞型為優(yōu)勢流行毒株。
[Abstract]:In order to understand the genotype of hepatitis E virus (HEV) in Guangxi swine population, 104 fresh pig feces collected from pig farms around Nanning were detected by nested RT-PCR. The ORF2 gene of 11 positive strains was amplified and cloned successfully. The results of sequencing showed that the nucleotide homology of ORF2 sequence of HEV was 97.70.The deduced amino acid homology was 97.9100.The nucleotide homology with Ch-S-1Ch-T11swGX40 and other HEV strains was 90.6, but lower than that between HEV and other strains of HEV. The results showed that the nucleotide homology of HEV ORF2 was 97.7%, and the deduced amino acid homology was 97.990%, and the nucleotide homology was 84.6% with that of Ch-S-1 Ch-T11swGX40, but the homology was lower. Phylogenetic tree results showed that 11 HEV Guangxi strains were gene 4 type, 10 of them were 4a subtype and 1 strain was 4e subtype. The results showed that the prevalent HEV in Guangxi pigs were all genotypes 4, and 4a subtype was the dominant epidemic strain.
【作者單位】： 廣西大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院動物傳染病研究室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31372444) 廣西大學(xué)科研基金項(xiàng)目(XGZ130959)
【分類號】：S852.65

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本文編號：1987418