本文選題：miR-b + 生物信息學(xué)��； 參考：《甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報》2017年04期

【摘要】：【目的】對miR-15b靶基因進行預(yù)測、信號通路分析及鑒定,以期為miR-15b的功能研究奠定基礎(chǔ).【方法】利用Target Scan Release 7.0,PicTar和PITA數(shù)據(jù)庫對miR-15b靶基因進行預(yù)測,再用DAVID數(shù)據(jù)庫對預(yù)測出的靶基因集進行功能富集分析(gene ontology-analysis)及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析(KEGG pathway analysis).隨后利用雙熒光素酶報告試驗對預(yù)測出miR-15b的靶基因丙酮酸脫氫酶激酶4(PDK4)和CD28進行驗證.【結(jié)果】3個軟件共同預(yù)測出miR-15b的靶基因有305個,其靶基因集合功能富集于蛋白激酶活性、GTP結(jié)合蛋白調(diào)控等分子功能,蛋白氨基酸磷酸化、細胞周期調(diào)控等生物學(xué)過程及微管相關(guān)復(fù)合體、轉(zhuǎn)錄因子復(fù)合體等細胞組分上.信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路則顯著富集于癌癥相關(guān)信號通路.雙熒光素酶報告實驗結(jié)果顯示CD28為miR-15b的靶基因,而PDK4不是miR-15b的靶基因.【結(jié)論】miR-15b在細胞增殖、凋亡和細胞周期調(diào)控等過程中發(fā)揮重要調(diào)控作用,且miR-15b通過調(diào)控CD28的表達對T細胞的受體激活發(fā)揮調(diào)控作用.
[Abstract]:[objective] to predict miR-15b target gene, signal pathway analysis and identification, so as to lay a foundation for the functional study of miR-15b. [methods] Target scan release 7.0 PicTar and PITA database were used to predict miR-15b target gene. Then, the predicted target gene sets were analyzed by functional enrichment analysis and signal transduction pathway enrichment analysis by DAVID database. Then the target genes of miR-15b were verified by double-luciferase report test, including pyruvate dehydrogenase kinase 4 PDK4) and CD28. [results] 305 target genes of miR-15b were predicted by three softwares. Its target gene set function is enriched in the molecular function of protein kinase activity and GTP binding protein regulation, protein amino acid phosphorylation, cell cycle regulation, microtubule-related complex, transcription factor complex and other cellular components. The signal transduction pathway was significantly enriched in the cancer-related signaling pathway. The results of double luciferase report show that CD28 is the target gene of miR-15b, while PDK4 is not the target gene of miR-15b. [conclusion] miR-15b plays an important role in cell proliferation, apoptosis and cell cycle regulation. MiR-15b regulates the receptor activation of T cells by regulating the expression of CD28.
【作者單位】： 甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;重慶市畜牧科學(xué)院;甘肅省現(xiàn)代養(yǎng)豬工程技術(shù)研究中心;
【基金】：重慶市基本科研業(yè)務(wù)費項目(2013cstc-jbky-00105-zj,14402) 國家自然基金項目(31372284,31601930) 甘肅省科技重大專項項目“高繁殖力豬新品系選育研究”(092NKDA036)
【分類號】：Q78

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本文編號：1987631