本文選題：甘蔗 + 鈣依賴蛋白激酶基因(CDPK)　； 參考：《南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)》2017年04期

【摘要】：【目的】克隆甘蔗鈣依賴蛋白激酶基因(ScCDPK1),為其功能解析和育種利用打下基礎(chǔ)�！痉椒ā扛鶕�(jù)甘蔗cDNA文庫(kù)中的CDPK基因序列信息設(shè)計(jì)引物,利用RT-PCR克隆ScCDPK1基因,并采用在線生物信息學(xué)分析軟件對(duì)其推導(dǎo)蛋白的理化性質(zhì)、跨膜結(jié)構(gòu)、信號(hào)肽及保守結(jié)構(gòu)域等進(jìn)行預(yù)測(cè)分析�！窘Y(jié)果】克隆獲得的ScCDPK1基因完整編碼區(qū)大小1650 bp,編碼549個(gè)氨基酸,相對(duì)分子量61.971 kD,等電點(diǎn)(pI)6.78,不穩(wěn)定指數(shù)35.63。同源性和遺傳進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示,ScCDPK1基因與小麥TaCPK7基因親緣關(guān)系最近,同源性達(dá)88%;ScCDPK1蛋白與其他已知CDPK蛋白一致,具有CDPKs家族特有的4個(gè)保守區(qū)域(可變區(qū)、蛋白激酶區(qū)、自抑制區(qū)和鈣離子結(jié)合區(qū)),其二級(jí)結(jié)構(gòu)主要由α螺旋(42.80%)和無(wú)規(guī)則卷曲(32.97%)構(gòu)成;蛋白功能分類預(yù)測(cè)結(jié)果顯示,ScCDPK1蛋白是一種陽(yáng)離子通道蛋白,可能參與植物脅迫應(yīng)答、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)和翻譯調(diào)控等生物反應(yīng)�！窘Y(jié)論】ScCDPK1基因編碼的蛋白與其他已知CDPK蛋白一致,具有CDPKs家族特有的4個(gè)保守區(qū)域,是一種陽(yáng)離子通道蛋白。
[Abstract]:[objective] to clone SCCDPK1 gene from sugarcane and lay a foundation for its function analysis and breeding. [methods] based on the sequence information of CDPK gene in sugarcane cDNA library, primers were designed and RT-PCR was used to clone ScCDPK1 gene. The physicochemical properties, transmembrane structure, signal peptide and conserved domain of the deduced protein were predicted by on-line bioinformatics analysis software. [results] the complete coding region of ScCDPK1 gene was 1650 BP, encoding 549 amino acids. The relative molecular weight is 61.971 KD, the isoelectric point (Pi) is 6.78, and the instability index is 35.63. The results of homology and phylogenetic tree analysis showed that ScCDPK1 gene was closely related to wheat TaCPK7 gene. The homology of ScCDPK1 protein was consistent with other known CDPK proteins, and had four conserved regions (variable region, protein kinase region) specific to the CDPKs family. The secondary structure of SCPK1 protein was mainly composed of 偽 helix 42.80) and irregular crimp 32.97), and the results of protein functional classification predicted that ScCDPK1 protein was a cationic channel protein, which might participate in plant stress response, and its secondary structure was mainly composed of 偽 helix (42.80) and irregular curl (32.97). [conclusion] the protein encoded by ScCDPK1 gene is consistent with other known CDPK proteins and has four conserved regions of the CDPKs family, which is a cationic channel protein.
【作者單位】： 廣西作物遺傳改良生物技術(shù)重點(diǎn)開放實(shí)驗(yàn)室;廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所/農(nóng)業(yè)部廣西甘蔗生物技術(shù)與遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;賀州學(xué)院;
【基金】：廣西自然科學(xué)基金項(xiàng)目(2013GXNSFAA019077,2013GXNSFAA019088) 廣西八桂學(xué)者專項(xiàng)項(xiàng)目([2013]3號(hào)) 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院科技發(fā)展基金項(xiàng)目(2016JM05)
【分類號(hào)】：S566.1

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本文編號(hào)：1973030