煙草病程相關蛋白NtPR10基因克隆與表達分析
本文選題:煙草 + 病程相關蛋白; 參考:《中國煙草科學》2017年03期
【摘要】:為鑒定煙草病程相關蛋白PR10的生物學功能,從普通煙草G28中克隆得到了Nt PR10基因,基因全長483 bp,編碼160個氨基酸;蚪Y(jié)構(gòu)分析表明,該基因編碼的蛋白包含病程相關蛋白家族Bet_v_I保守域,具有與核酸酶活性相關的"P-Loop"結(jié)構(gòu)。利用TMHMM、Signal P、Prosite Scan等軟件分析發(fā)現(xiàn),Nt PR10不含跨膜區(qū),無信號肽,有胞內(nèi)定位特征。采用實時熒光定量PCR分別分析了TMV誘導下該基因在抗、感品種枯斑三生和G28中的表達模式。結(jié)果表明,在TMV誘導下,Nt PR10基因在感病品種G28中顯著上調(diào)表達;而在抗病品種枯斑三生中,TMV侵染后6 h,Nt PR10基因顯著上調(diào)表達,第12小時至第8天顯著下調(diào)表達,而后至第16天逐漸升高至侵染前水平。綜合以上結(jié)果,Nt PR10應答了TMV侵染過程,并且在抗、感品種中整體呈現(xiàn)出相反的表達趨勢,暗示了Nt PR10在TMV侵染過程中具有重要功能,為深入分析Nt PR10的抗病生物學功能奠定了基礎。
[Abstract]:In order to identify the biological function of tobacco pathogenesis-related protein (PR10), the Nt PR10 gene was cloned from common tobacco G28, with a length of 483bpand encoding 160 amino acids. The gene structure analysis showed that the protein encoded by the gene contained the conserved domain of the pathogenesis-related protein family (Bet_v_I) and had a "P-Loop" structure related to the activity of nuclease. It was found that the NT PR10 had no transmembrane region, no signal peptide and intracellular localization characteristics by using TMHMMMM-Signal Pnprosite Scan and other softwares. The results showed that Nt PR10 had no transmembrane region, no signal peptide, and had intracellular localization characteristics. Real-time fluorescence quantitative PCR was used to analyze the expression patterns of the gene induced by TMV in the resistant and susceptible cultivars, Kubansansheng and G28, respectively. The results showed that the expression of Nt PR10 gene was significantly up-regulated in susceptible variety G28 induced by TMV, but significantly up-regulated at 6 h after infection, and significantly down-regulated from 12th hour to 8th day. Then on the 16th day, it gradually increased to the pre-infection level. Combined with the above results, Nt PR10 responded to the process of TMV infection, and showed a contrary expression trend in resistant and susceptible cultivars, suggesting that NT PR10 has an important function in the process of TMV infection. It lays a foundation for further analysis of the biological function of NT PR10 in disease resistance.
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)科學院煙草研究所;中國農(nóng)業(yè)科學院研究生院;
【基金】:國家自然科學基金項目“煙草病程相關蛋白PR10抗病分子機理研究”(31240013) 中國農(nóng)業(yè)科學院煙草研究所青年科學基金項目“對煙草赤星病不同抗性品種蛋白質(zhì)組差異分析及抗性蛋白挖掘”(2016B04) 中國煙草總公司四川省公司科技項目“優(yōu)質(zhì)適產(chǎn)烤煙新品種選育與推廣”(SCYC201501)
【分類號】:S435.72
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,本文編號:1972660
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